RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP19.84■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 RASSF5Q8WWW0 418 aa19.84■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 MARVELD3Q96A59 401 aa19.84■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 MCHR1Q99705 422 aa19.84■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 PTDSS2Q9BVG9 487 aa19.84■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP19.84■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 PCDHAC1Q9H158 963 aa19.84■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 GP6Q9HCN6 339 aa19.84■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 KLHL13Q9P2N7 655 aa19.84■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 SLC13A4Q9UKG4 626 aa19.84■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 ZNF716A6NP11 495 aa19.83■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP19.83■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 PLGP00747 810 aaPredicted RBP19.83■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 YES1P07947 543 aa19.83■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 T-ENOLP0DO92 83 aa19.83■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 COX6B1P14854 86 aa19.83■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 TNFRSF1BP20333 461 aa19.83■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 UQCRC1P31930 480 aa19.83■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 CDH12P55289 794 aa19.83■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 CEACAM7Q14002 265 aa19.83■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 ALG10BQ5I7T1 473 aa19.83■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 C1orf140Q5VVS0 124 aa19.83■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 LINC00114Q6XXX2 140 aa19.83■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP19.83■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP19.83■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP19.83■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 TMEM27Q9HBJ8 222 aa19.83■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 SPAG4Q9NPE6 437 aa19.83■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 GALNT8Q9NY28 637 aa19.83■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa19.83■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP19.83■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 EMC9Q9Y3B6 208 aa19.83■□□□□ 0.77
SYF2-201ENST00000236273 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa19.82■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 A0A087WUJ7 227 aa19.82■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 FTCDNL1E5RQL4 147 aa19.82■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 CXCR6O00574 342 aa19.82■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 FZD7O75084 574 aa19.82■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 NTF4P34130 210 aa19.82■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 IDUAP35475 653 aa19.82■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 CPOXP36551 454 aa19.82■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 P2RY4P51582 365 aa19.82■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 CTBP2P56545 445 aa19.82■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 SELENOWP63302 87 aa19.82■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 SLC35A1P78382 337 aa19.82■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa19.82■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 PDK3Q15120 406 aa19.82■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 ENTPD8Q5MY95 495 aa19.82■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP19.82■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 MCEMP1Q8IX19 187 aa19.82■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP19.82■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 CD300AQ9UGN4 299 aa19.82■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 PROCRQ9UNN8 238 aa19.82■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP19.81■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP19.81■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 NDUFAB1O14561 156 aa19.81■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 EDNRAP25101 427 aa19.81■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 PCYT1AP49585 367 aa19.81■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 FAM27E3Q08E93 113 aa19.81■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 FXNQ16595 210 aa19.81■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 ELOA3BQ3SY89 546 aa19.81■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP19.81■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 ZNF613Q6PF04 617 aa19.81■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 CARM1Q86X55 608 aa19.81■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 PGAM4Q8N0Y7 254 aa19.81■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 ELOA3Q8NG57 546 aa19.81■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 BCAS4Q8TDM0 211 aa19.81■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 SLC47A1Q96FL8 570 aa19.81■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 NSL1Q96IY1 281 aa19.81■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP19.81■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 KLHL9Q9P2J3 617 aa19.81■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 BAG5Q9UL15 447 aa19.81■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 SH3GLB1Q9Y371 365 aa19.81■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 APCP25054 2843 aa19.8■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 ZNF724A8MTY0 619 aa19.8■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP19.8■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 IFNA14P01570 189 aa19.8■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 PNMTP11086 282 aa19.8■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 NCK1P16333 377 aa19.8■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 GGT1P19440 569 aa19.8■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 OR1E2P47887 323 aa19.8■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 SLC16A1P53985 500 aa19.8■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 OR7A5Q15622 319 aa19.8■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 PAQR6Q6TCH4 344 aa19.8■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 WDR88Q6ZMY6 472 aa19.8■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 P3H2Q8IVL5 708 aa19.8■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 RNF148Q8N7C7 305 aa19.8■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 TMEM99Q8N816 258 aa19.8■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa19.8■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 TAAR8Q969N4 342 aa19.8■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 C12orf49Q9H741 205 aa19.8■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP19.79■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 AKR7A3O95154 331 aa19.79■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 GPIP06744 558 aa19.79■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 NCALDP61601 193 aa19.79■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 LTBQ06643 244 aa19.79■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 TMEM201Q5SNT2 666 aa19.79■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP19.79■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 TFAP2EQ6VUC0 442 aa19.79■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 CBLL1Q75N03 491 aa19.79■□□□□ 0.76
SYF2-201ENST00000236273 VTCN1Q7Z7D3 282 aa19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59 ms