RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000061209.6

Ccdc71-201, Transcript of Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ccdc71, Length 3,092 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Olfr1215A3KGY3 312 aa11.92□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Smpd5D6MZJ6 483 aa11.92□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 FaimlJ3QPY3 178 aa11.92□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Nmur1O55040 428 aa11.92□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Fabp3P11404 133 aa11.92□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Adrb2P18762 418 aa11.92□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 LynP25911 512 aa11.92□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Nedd8P29595 81 aa11.92□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 MakQ04859 622 aa11.92□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Zdhhc11Q14AK4 347 aa11.92□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ctsll3Q3ULP7 331 aa11.92□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ankrd13bQ5F259 626 aa11.92□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Nox3Q672J9 568 aa11.92□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 2810021J22RikQ8BIB6 539 aa11.92□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Glt28d2Q8BML3 165 aa11.92□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Amdhd2Q8JZV7 409 aa11.92□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Dlgap5Q8K4R9 808 aa11.92□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Clec2dQ91V08 207 aa11.92□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Med31Q9CXU1 131 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Trim2Q9ESN6 744 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Cfap46E9Q2C0 2641 aa11.92□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Celsr3Q91ZI0 3301 aa11.92□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Zfp978A2A7I1 335 aa11.92□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gm19345G3UYD9 124 aa11.92□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Slc22a1O08966 556 aa11.92□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 FxnO35943 207 aa11.92□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 FrzbP97401 323 aa11.92□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ces2fQ08ED5 561 aa11.92□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ckmt2Q6P8J7 419 aa11.92□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Eid2Q6X7S9 236 aa11.92□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Hapln3Q80WM5 359 aa11.92□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ccdc126Q8BIS8 140 aa11.92□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 QdprQ8BVI4 241 aa11.92□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 D2hgdhQ8CIM3 535 aa11.92□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ppil3Q9D6L8 161 aa11.92□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Dda1Q9D9Z5 102 aa11.92□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Jmjd6Q9ERI5 403 aa11.92□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 RlimQ9WTV7 600 aa11.92□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Slc37a2Q9WU81 501 aa11.92□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ppp1r17Q9Z2E4 159 aa11.92□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Dchs1E9PVD3 3291 aa11.92□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 BC024063A0A1W2P7G7 749 aa11.91□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Cd209fD3Z1H5 274 aa11.91□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Avpr2O88721 371 aa11.91□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Klk1b5P15945 261 aa11.91□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Hrh3P58406 445 aa11.91□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Cdc42P60766 191 aa11.91□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Rnf133Q14B02 382 aa11.91□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Spag8Q3V0Q6 470 aa11.91□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Nr0b1Q61066 472 aa11.91□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Adam9Q61072 845 aa11.91□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Tlx2Q61663 284 aa11.91□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Dlgap3Q6PFD5 977 aa11.91□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Vgll4Q80V24 287 aa11.91□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Slc35f1Q8BGK5 408 aa11.91□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ino80cQ8BHA0 191 aa11.91□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Pqlc3Q8C6U2 202 aa11.91□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Slc31a1Q8K211 196 aa11.91□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Olfr341Q8VGK9 313 aa11.91□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Abcg5Q99PE8 652 aa11.91□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Tmem25Q9DCF1 365 aa11.91□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Tmem176aQ9DCS1 244 aa11.91□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Olfr2Q9QWU6 327 aa11.91□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Vmn1r10W4VSP8 311 aa11.91□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Sult2a7A0A1B0GRF0 313 aa11.91□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gm45711E0CXA2 391 aa11.91□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gm10477F6SW83 55 aa11.91□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Cd38P56528 304 aa11.91□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 IspdQ5RJG7 447 aa11.91□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Laptm5Q61168 261 aa11.91□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Olfr744Q7TRM0 323 aa11.91□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Zfp184Q7TSH9 737 aa11.91□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Zfp763Q8BIC7 588 aa11.91□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 NagsQ8R4H7 527 aa11.91□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Guca1bQ8VBV8 201 aa11.91□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Olfr461Q8VF30 313 aa11.91□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Kiss1rQ91V45 396 aa11.91□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 UqcrbQ9D855 111 aa11.91□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Eif3iQ9QZD9 325 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Eif2s3yQ9Z0N2 472 aa11.91□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Parp4E9PYK3 1969 aa11.91□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Adam3F8VQ03 822 aa11.9□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Phkg1P07934 388 aa11.9□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 TP20293 436 aa11.9□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Sftpa1P35242 248 aa11.9□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 EsrrgP62509 458 aa11.9□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Cdh10P70408 788 aa11.9□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ms4a15Q3UPL6 245 aa11.9□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Pcyt1bQ811Q9 369 aa11.9□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Adamts4Q8BNJ2 833 aa11.9□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Mmgt2Q8R3L0 123 aa11.9□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Fam20bQ8VCS3 409 aa11.9□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Wwp2Q9DBH0 870 aa11.9□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Tnfrsf21Q9EPU5 655 aa11.9□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gm10608E9PZ13 166 aa11.9□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Nr4a1P12813 601 aa11.9□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Igsf5Q7TSN7 370 aa11.9□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 UstQ8BUB6 407 aa11.9□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ebf4Q8K4J2 599 aa11.9□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Tmem43Q9DBS1 400 aa11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 53.9 ms