RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027667.12

Pkp1-201, Transcript of Plakophilin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pkp1, Length 4,669 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vmn1r85Q8VIB8 308 aa11.93□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nol3Q9D1X0 220 aa11.93□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 MiipA2A7Y5 387 aa11.93□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm8765B7ZWJ3 1017 aa11.93□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm498D3YYH9 372 aa11.93□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rdh19G5E8H9 318 aa11.93□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Wnt4P22724 351 aa11.93□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 CapzbP47757 277 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rps5P97461 204 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Apoc2Q05020 97 aa11.93□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Prr27Q3SYJ2 352 aa11.93□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm906Q3V0M1 1017 aa11.93□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Frs3Q91WJ0 492 aa11.93□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 MallQ91X49 154 aa11.93□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Spesp1Q9D5A0 399 aa11.93□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cmtm2aQ9DAR1 169 aa11.93□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Actr10Q9QZB7 417 aa11.93□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Klhl15A2AAX3 604 aa11.93□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Hoxb3P09026 433 aa11.93□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 PpibP24369 216 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Atp5j2P56135 88 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Kcnk2P97438 426 aa11.93□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zfp36l3Q5ISE2 725 aa11.93□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Alg8Q6P8H8 526 aa11.93□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Prss27Q8BJR6 328 aa11.93□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zmynd11Q8R5C8 602 aa11.93□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pex12Q8VC48 359 aa11.93□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Adam23Q9R1V7 829 aa11.93□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 4930595M18RikA2RRY9 829 aa11.92□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dbil5O09035 87 aa11.92□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 P01878 344 aa11.92□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Drd3P30728 446 aa11.92□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tmem255bQ5FW56 369 aa11.92□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr406Q7TRX0 323 aa11.92□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cept1Q8BGS7 416 aa11.92□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ptges2Q8BWM0 384 aa11.92□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cbx7Q8VDS3 158 aa11.92□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr120Q8VFQ2 330 aa11.92□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Thumpd1Q99J36 350 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 HadhbQ99JY0 475 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Acss1Q99NB1 682 aa11.92□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Emc9Q9DB76 206 aa11.92□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dap3Q9ER88 391 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Hacl1Q9QXE0 581 aa11.92□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1089A0A1L1SRK6 311 aa11.92□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr601A2RS33 314 aa11.92□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm8356J3QPD3 205 aa11.92□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zic1P46684 447 aa11.92□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fgf17P63075 216 aa11.92□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cln6Q3U466 308 aa11.92□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mapk3Q63844 380 aa11.92□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr128Q7TRJ1 308 aa11.92□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Spem2Q8C5U4 503 aa11.92□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr510Q8VEW6 314 aa11.92□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dus3lQ91XI1 637 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1034A0A1L1ST14 310 aa11.92□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 SrsxB2RZI1 361 aa11.92□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 EllO08856 602 aa11.92□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Galr3O88853 370 aa11.92□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ube2nP61089 152 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gng2P63213 71 aa11.92□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 AbraclQ4KML4 81 aa11.92□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mfsd11Q8BJ51 449 aa11.92□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Q8K039 155 aa11.92□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cacng6Q8VHW3 260 aa11.92□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Arid1aA2BH40 2283 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vsig10l2A0A140LHF2 776 aa11.92□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cd300ld4A2A7W1 245 aa11.92□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1156A2AVC3 323 aa11.92□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr115B2RTB9 312 aa11.92□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1511E9PWU0 318 aa11.92□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1510E9PZZ6 318 aa11.92□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 A630095N17RikJ3KMM7 116 aa11.92□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm8024L7N2E0 100 aa11.92□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 S1pr1O08530 382 aa11.92□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fcn1O70165 334 aa11.92□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 P06321 130 aa11.92□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Eef1a1P10126 462 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pou3f1P21952 449 aa11.92□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Myf5P24699 255 aa11.92□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Evx2P49749 475 aa11.92□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Stard6P59096 233 aa11.92□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rap1aP62835 184 aa11.92□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mettl7a2Q5I0W6 244 aa11.92□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ptpn21Q62136 1176 aa11.92□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cd300ld3Q6SJQ5 245 aa11.92□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Abhd17bQ7M759 288 aa11.92□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc43a2Q8CGA3 568 aa11.92□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Adam4Q8CGQ2 763 aa11.92□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 BphlQ8R164 291 aa11.92□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 BanpQ8VBU8 548 aa11.92□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr461Q8VF30 313 aa11.92□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ash2lQ91X20 623 aa11.92□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rap1bQ99JI6 184 aa11.92□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Abcg5Q99PE8 652 aa11.92□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Prl8a8Q9DAS4 241 aa11.92□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Moap1Q9ERH6 352 aa11.92□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dok3Q9QZK7 444 aa11.92□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 March7Q9WV66 693 aa11.92□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Loxl3Q9Z175 754 aa11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 25.3 ms