RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637624.1

PXN-222, Transcript of paxillin, human

TSL 2

Gene PXN, Length 4,132 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PXN-222	ENST00000637624	S100A8	P05109	93 aa		11.31	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	FGF9	P31371	208 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	CSF2RB	P32927	897 aa		11.31	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	CD79B	P40259	229 aa		11.31	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	PBX2	P40425	430 aa		11.31	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	KCNJ5	P48544	419 aa		11.31	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	FNDC3B	Q53EP0	1204 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	C1orf53	Q5VUE5	145 aa		11.31	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	PAPD4	Q6PIY7	484 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	TTLL10	Q6ZVT0	673 aa		11.31	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	SDR9C7	Q8NEX9	313 aa		11.31	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	NUP43	Q8NFH3	380 aa		11.31	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	OR56A1	Q8NGH5	318 aa		11.31	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	OR4Q3	Q8NH05	313 aa		11.31	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	TFG	Q92734	400 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	ZBTB8A	Q96BR9	441 aa		11.31	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	GPER1	Q99527	375 aa		11.31	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	CHRD	Q9H2X0	955 aa		11.31	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	SRA1	Q9HD15	236 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	HINT3	Q9NQE9	182 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	WSB2	Q9NYS7	404 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		11.31	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	CKAP5	Q14008	2032 aa		11.31	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624		A0A087WUU8	490 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624		A8MVJ9	347 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	TRIM77	I1YAP6	450 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	ETHE1	O95571	254 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	TSPAN15	O95858	294 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	PEX11B	O96011	259 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	LIMS3	P0CW19	117 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	LIMS4	P0CW20	117 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	CLCNKA	P51800	687 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	ZNF155	Q12901	538 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	CLINT1	Q14677	625 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	PRICKLE2	Q7Z3G6	844 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	APCDD1	Q8J025	514 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	TMEM99	Q8N816	258 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	OR6N2	Q8NGY6	317 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	CNN2	Q99439	309 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	ZFP57	Q9NU63	452 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	GFOD1	Q9NXC2	390 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	ANKRD61	A6NGH8	418 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	TMEM200C	A6NKL6	621 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	DRGX	A6NNA5	263 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	MCRIP1	C9JLW8	97 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	NDUFS4	O43181	175 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	IFNA17	P01571	189 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	AKAIN1	P0CW23	69 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	ACTA2	P62736	377 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	ACTG2	P63267	376 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	NTHL1	P78549	312 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	GPNMB	Q14956	572 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	TCTN1	Q2MV58	587 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	CCSMST1	Q4G0I0	132 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	C9orf152	Q5JTZ5	239 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	AKR1C8P	Q5T2L2	129 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624		Q6ZTK2	550 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	LRRTM1	Q86UE6	522 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	ACBD4	Q8NC06	268 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	KREMEN2	Q8NCW0	462 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	CYB5D2	Q8WUJ1	264 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	FATE1	Q969F0	183 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	MARVELD3	Q96A59	401 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	WDR77	Q9BQA1	342 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	PLA2G12A	Q9BZM1	189 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	MKKS	Q9NPJ1	570 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	ACSS1	Q9NUB1	689 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	YIPF1	Q9Y548	306 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	NPFFR2	Q9Y5X5	522 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	TRAV27	A0A087WT01	109 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	CARNS1	A5YM72	827 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	CXCL10	P02778	98 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	GIMD1	P0DJR0	217 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	ZNF8	P17098	575 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	GRK6	P43250	576 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	NR0B1	P51843	470 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	IL13RA1	P78552	427 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	ZNF674	Q2M3X9	581 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	LINC00303	Q3SY05	128 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	NXPE4	Q6UWF7	544 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	ZNF565	Q8N9K5	539 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	OR51S1	Q8NGJ8	323 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	SFT2D1	Q8WV19	159 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	CHTF18	Q8WVB6	975 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	TMED6	Q8WW62	240 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	SCMH1	Q96GD3	660 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	CASD1	Q96PB1	797 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	SULT4A1	Q9BR01	284 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	NOX4	Q9NPH5	578 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	ASXL3	Q9C0F0	2248 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	TSTD3	H0UI37	97 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	XKRY	O14609	159 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	CDC40	O60508	579 aa	Known RBP eCLIP	11.29	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	STC2	O76061	302 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	HOXA1	P49639	335 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	ACTB	P60709	375 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	B2M	P61769	119 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	ACTG1	P63261	375 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	PDZD11	Q5EBL8	140 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	ARSI	Q5FYB1	569 aa		11.29	□□□□□ -0.6

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