RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636120.1

PDE4D-228, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 6,659 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-228ENST00000636120 SLA2Q9H6Q3 261 aa6.01□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 TM7SF3Q9NS93 570 aa6.01□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 CARD8Q9Y2G2 431 aa6.01□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa6.01□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 A0A087WV62 115 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 LCATP04180 440 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 RAC2P15153 192 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 OR1D4P47884 311 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 POU3F4P49335 361 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF81P51508 661 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 ACTBL2Q562R1 376 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 IGFN1Q86VF2 1251 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 SIMC1Q8NDZ2 872 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 DNAJA3Q96EY1 480 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 WDR76Q9H967 626 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 PARPBPQ9NWS1 579 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 NDUFAF4Q9P032 175 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 ATG4BQ9Y4P1 393 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 TRAV18A0A075B6X5 111 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 SLC16A7O60669 478 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 SCGB2A1O75556 95 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 TSPAN9O75954 239 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 LGI1O95970 557 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 PEX11BO96011 259 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 IFNA5P01569 189 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 TFPTP0C1Z6 253 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 TACR3P29371 465 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 NR4A2P43354 598 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 CEBPGP53567 150 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 HOXC5Q00444 222 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 ERV3-1Q14264 604 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 MLC1Q15049 377 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 MED25Q71SY5 747 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 CLDN22Q8N7P3 220 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 OR52N1Q8NH53 320 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 RSC1A1Q92681 617 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 GABARAPL3Q9BY60 117 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 TREM1Q9NP99 234 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 NPAP1Q9NZP6 1156 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 USP22Q9UPT9 525 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 SC5DO75845 299 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 OLFM2O95897 454 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 CTSLP07711 333 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP6□□□□□ -1.459e-7■■■■□ 20.4
PDE4D-228ENST00000636120 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 TGFBR3Q03167 851 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 FAM111BQ6SJ93 734 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 FOXRED2Q8IWF2 684 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 FRMD1Q8N878 549 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 OR13F1Q8NGS4 319 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 SEMA4GQ9NTN9 838 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 DAPP1Q9UN19 280 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 TMED7Q9Y3B3 224 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 HTR3BO95264 441 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 ADH6P28332 368 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 SLC1A3P43003 542 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 ATAD3CQ5T2N8 411 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 AGBL4Q5VU57 503 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF566Q969W8 418 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 MYEOVQ96EZ4 313 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 TEX37Q96LM6 180 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 MAP3K3Q99759 626 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 CENPOQ9BU64 300 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 P2RX6O15547 441 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 SIGLEC6O43699 453 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 ALOX12BO75342 701 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 NSA2O95478 260 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 SFTPBP07988 381 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 SLC26A5P58743 744 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 MORN4Q8NDC4 146 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 MVB12AQ96EY5 273 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 CCDC120Q96HB5 630 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 NIPAL2Q9H841 368 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 FGF22Q9HCT0 170 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 TBC1D29Q9UFV1 150 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 ETV7Q9Y603 341 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-228ENST00000636120 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
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