RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626061.2

SNAP23-222, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 237 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-222	ENST00000626061	SPNS1	Q9H2V7	528 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNAP23-222	ENST00000626061	XAB2	Q9HCS7	855 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SNAP23-222	ENST00000626061	SIRT7	Q9NRC8	400 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNAP23-222	ENST00000626061	NLE1	Q9NVX2	485 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SNAP23-222	ENST00000626061	DDX56	Q9NY93	547 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SNAP23-222	ENST00000626061	CFL2	Q9Y281	166 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNAP23-222	ENST00000626061	CRYL1	Q9Y2S2	319 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNAP23-222	ENST00000626061		A0A087WZY1	265 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061		A0A096LPE4	126 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061		A0A1W2PPZ6	126 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	GJE1	A6NN92	205 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	RAD51C	O43502	376 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	IFNA14	P01570	189 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	SPARC	P09486	303 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	CCND1	P24385	295 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	EEF1B2	P24534	225 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	ATP5D	P30049	168 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	SLC6A1	P30531	599 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	CRHR1	P34998	444 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	MDH2	P40926	338 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	PMS1	P54277	932 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	ANAPC15	P60006	121 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	CDR2	Q01850	454 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	ZMYND11	Q15326	602 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	EXOC3L4	Q17RC7	722 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	CASP12	Q6UXS9	341 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	LARP4	Q71RC2	724 aa	Known RBP eCLIP	4.96	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	LSR	Q86X29	649 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	TRIM59	Q8IWR1	403 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	OR52K1	Q8NGK4	314 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	PHLDA1	Q8WV24	401 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	VPS39	Q96JC1	886 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	DUX3	Q96PT4	197 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	ALS2CR12	Q96Q35	445 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	NPAS1	Q99742	590 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	APOL2	Q9BQE5	337 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	LAT2	Q9GZY6	243 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	CCDC68	Q9H2F9	335 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	COQ10B	Q9H8M1	238 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	LIN7B	Q9HAP6	207 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	DCAF16	Q9NXF7	216 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	LIMA1	Q9UHB6	759 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	LYVE1	Q9Y5Y7	322 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	MAD1L1	Q9Y6D9	718 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	TNC	P24821	2201 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	ARPC4-TTLL3	A0A0A6YYG9	625 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	UPK3A	O75631	287 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	NEFL	P07196	543 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	CD22	P20273	847 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	PSMA4	P25789	261 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	PPARG	P37231	505 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	BMX	P51813	675 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	RPL23A	P62750	156 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	MRPS22	P82650	360 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	REEP5	Q00765	189 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	ZNF45	Q02386	682 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	KCNJ11	Q14654	390 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	STK38	Q15208	465 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	KLHL38	Q2WGJ6	581 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	CPTP	Q5TA50	214 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	DUPD1	Q68J44	220 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	BAIAP2L2	Q6UXY1	529 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	NLRC3	Q7RTR2	1065 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	ABHD12B	Q7Z5M8	362 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	OR2L5	Q8NG80	312 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	OR7G1	Q8NGA0	311 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	OR8B3	Q8NGG8	313 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	ZFP90	Q8TF47	636 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	DUSP19	Q8WTR2	217 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	EME1	Q96AY2	570 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	WDR34	Q96EX3	536 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	NEIL1	Q96FI4	390 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	OR8B2	Q96RD0	313 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	EGLN1	Q9GZT9	426 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	RPF2	Q9H7B2	306 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	CXorf21	Q9HAI6	301 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	FAM53C	Q9NYF3	392 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	CLN8	Q9UBY8	286 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	NUP214	P35658	2090 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	SLC22A23	A1A5C7	686 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	C7orf72	A4D263	438 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	LRIT2	A6NDA9	550 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	C22orf46	C9J442	243 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	MANBA	O00462	879 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	NR5A2	O00482	541 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	PRMT5	O14744	637 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	T	O15178	435 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	TSPAN2	O60636	221 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	IGLV1-40	P01703	118 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	LIPF	P07098	398 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	CT62	P0C5K7	136 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	CBR1	P16152	277 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	NPPB	P16860	134 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	CDK11B	P21127	795 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	RBL1	P28749	1068 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	HPD	P32754	393 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	SKIV2L2	P42285	1042 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	PITPNB	P48739	271 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	CENPA	P49450	140 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	SELENOP	P49908	381 aa		4.94	□□□□□ -1.62

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