RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614059.4

RPS6KC1-208, Transcript of ribosomal protein S6 kinase C1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RPS6KC1, Length 4,188 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1-208ENST00000614059 C1QAP02745 245 aa12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 CBR1P16152 277 aa12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 LUMP51884 338 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 EMP3P54852 163 aa12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 TMEM64Q6YI46 380 aa12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 CSF3RQ99062 836 aa12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 GSX2Q9BZM3 304 aa12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 ELOVL3Q9HB03 270 aa12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 KLHL21Q9UJP4 597 aa12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 AKAP6Q13023 2319 aa12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 MEGF11A6BM72 1044 aa12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 PRAMEF2O60811 474 aa12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 CSF1P09603 554 aa12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 ELK1P19419 428 aa12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 PRPS1P60891 318 aa12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 FAM27D1Q5T7N8 215 aa12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 NXNL2Q5VZ03 156 aa12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 SAXO2Q658L1 398 aa12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 XAF1Q6GPH4 301 aa12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 PXKQ7Z7A4 578 aa12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 ZNF611Q8N823 705 aa12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 OR51D1Q8NGF3 324 aa12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 OR9A4Q8NGU2 314 aa12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 SCGB1C1Q8TD33 95 aa12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 TM4SF18Q96CE8 201 aa12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 CDC6Q99741 560 aa12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 WASH6PQ9NQA3 447 aa12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 TSPAN11A1L157 253 aa12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 PLPP1O14494 284 aa12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 SEC14L5O43304 696 aa12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 UBL3O95164 117 aa12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 ETHE1O95571 254 aa12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 PRMT2P55345 433 aa12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 TLE3Q04726 772 aa12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 TCTN3Q6NUS6 607 aa12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 IDO2Q6ZQW0 420 aa12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 CREB3L2Q70SY1 520 aa12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 TMEM151BQ8IW70 566 aa12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 NANOGP1Q8N7R0 232 aa12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 STK35Q8TDR2 534 aa12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 CHTF18Q8WVB6 975 aa12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 SLC25A46Q96AG3 418 aa12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 NEURL3Q96EH8 262 aa12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 TPSD1Q9BZJ3 242 aa12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 STRCQ7RTU9 1775 aa12.98□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 NRAPQ86VF7 1730 aa12.98□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 CTSAP10619 480 aa12.98□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 RORAP35398 523 aa12.98□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 HCCSP53701 268 aa12.98□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 DSC1Q08554 894 aa12.98□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa12.98□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa12.98□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 TPRA1Q86W33 373 aa12.98□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 STEAP2Q8NFT2 490 aa12.98□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 HMGCLL1Q8TB92 370 aa12.98□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 AMDHD1Q96NU7 426 aa12.98□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 DEFB126Q9BYW3 111 aa12.98□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 CHST2Q9Y4C5 530 aa12.98□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 SCN9AQ15858 1988 aa12.98□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 A0A0B4J203 849 aa12.98□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 HEXBP07686 556 aa12.98□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 XCR1P46094 333 aa12.98□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 ACVR1Q04771 509 aa12.98□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 FAM69BQ5VUD6 431 aa12.98□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 ELP4Q96EB1 424 aa12.98□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 C11orf49Q9H6J7 331 aa12.98□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 KCNJ16Q9NPI9 418 aa12.98□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 SIRT5Q9NXA8 310 aa12.98□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 ACTR10Q9NZ32 417 aa12.98□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 EMC3Q9P0I2 261 aa12.98□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa12.98□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 A0A0B4J2A0 478 aa12.98□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa12.98□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 ASPDHA6ND91 283 aa12.98□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 SOX18P35713 384 aa12.98□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 PPT1P50897 306 aa12.98□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 ERVFC1P60507 584 aa12.98□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 C14orf28Q4W4Y0 310 aa12.98□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa12.98□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa12.98□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 FAAP20Q6NZ36 180 aa12.98□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 COMTD1Q86VU5 262 aa12.98□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 PM20D2Q8IYS1 436 aa12.98□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 SLC39A11Q8N1S5 342 aa12.98□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 LINC01465Q8N7H1 131 aa12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.7 ms