RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609525.1

CSNK2A1-208, Transcript of casein kinase 2 alpha 1, human

TSL 5

Gene CSNK2A1, Length 581 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TSSK3	Q96PN8	268 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CHCHD6	Q9BRQ6	235 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TMEM246	Q9BRR3	403 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CCM2	Q9BSQ5	444 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ZSCAN5A	Q9BUG6	496 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SPRY4	Q9C004	299 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	DPEP2	Q9H4A9	486 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	BCL2L10	Q9HD36	194 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RASSF1	Q9NS23	344 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ACSS1	Q9NUB1	689 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ACOXL	Q9NUZ1	547 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ZNF226	Q9NYT6	803 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	LHX3	Q9UBR4	397 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	GLS2	Q9UI32	602 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NUP50	Q9UKX7	468 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SLC9A8	Q9Y2E8	581 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	DLGAP4	Q9Y2H0	992 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	KLHL20	Q9Y2M5	609 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	LSM2	Q9Y333	95 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ANKRD36	A6QL64	1941 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PATJ	Q8NI35	1801 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ZFC3H1	O60293	1989 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	FAM240B	A0A1B0GVZ2	78 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	LINC00862	A6NCI5	91 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TMEM8B	A6NDV4	472 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	C5orf58	C9J3I9	102 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	hCG_2039718	K7EN88	272 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SYT5	O00445	386 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TFEC	O14948	347 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	POLR1C	O15160	346 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RGS5	O15539	181 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	HOXC11	O43248	304 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TPST2	O60704	377 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NOS1AP	O75052	506 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	STX11	O75558	287 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	OLFM2	O95897	454 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	AGR2	O95994	175 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PTH	P01270	115 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	IFNA7	P01567	189 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	IGLV2-11	P01706	119 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	DNTT	P04053	509 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PRB1	P04280	392 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RPN2	P04844	631 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	H1F0	P07305	194 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SP1	P08047	785 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	IFI6	P09912	130 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TSPAN19	P0C672	248 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PIRT	P0C851	137 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ACP2	P11117	423 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ARSA	P15289	507 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	EPOR	P19235	508 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	F8A1	P23610	371 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CORO1A	P31146	461 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CD52	P31358	61 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CCR7	P32248	378 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	HNF1B	P35680	557 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TALDO1	P37837	337 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CRAT	P43155	626 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TSFM	P43897	325 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RGR	P47804	291 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	OR1G1	P47890	313 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SPINT3	P49223	89 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ATP12A	P54707	1039 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CDH12	P55289	794 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	WNT4	P56705	351 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TAS2R43	P59537	309 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PFN3	P60673	137 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PITPNA	Q00169	270 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CSTF1	Q05048	431 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	C2orf80	Q0P641	193 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PMPCA	Q10713	525 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RPA4	Q13156	261 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CDH18	Q13634	790 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NFE2L1	Q14494	772 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PTPRCAP	Q14761	206 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MAPK11	Q15759	364 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CHRNA6	Q15825	494 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TAF12	Q16514	161 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TST	Q16762	297 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	COL28A1	Q2UY09	1125 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TBRG1	Q3YBR2	411 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	BCL7A	Q4VC05	210 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	KLHL12	Q53G59	568 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	XKR6	Q5GH73	641 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	DCAF12L2	Q5VW00	463 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TRIQK	Q629K1	86 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SIGIRR	Q6IA17	410 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	FAM71E1	Q6IPT2	247 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ZNF770	Q6IQ21	691 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	GDPD4	Q6W3E5	623 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TMEM64	Q6YI46	380 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ZNF730	Q6ZMV8	503 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MBOAT1	Q6ZNC8	495 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NRARP	Q7Z6K4	114 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	VTCN1	Q7Z7D3	282 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	DSG4	Q86SJ6	1040 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	THOC6	Q86W42	341 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PHC2	Q8IXK0	858 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	GPALPP1	Q8IXQ4	340 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NAGS	Q8N159	534 aa		4.2	□□□□□ -1.74

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