RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 ADRB1P08588 477 aa28.1■■■□□ 2.09
CAPNS1-206ENST00000588815 BMP7P18075 431 aa28.1■■■□□ 2.09
CAPNS1-206ENST00000588815 DPP4P27487 766 aa28.1■■■□□ 2.09
CAPNS1-206ENST00000588815 GIPRP48546 466 aa28.1■■■□□ 2.09
CAPNS1-206ENST00000588815 SMSP52788 366 aa28.1■■■□□ 2.09
CAPNS1-206ENST00000588815 CDK5Q00535 292 aa28.1■■■□□ 2.09
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC27A4Q6P1M0 643 aa28.1■■■□□ 2.09
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CAPNS1-206ENST00000588815 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
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CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF74Q16587 644 aa28.09■■■□□ 2.09
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CAPNS1-206ENST00000588815 CD47Q08722 323 aa28.06■■■□□ 2.08
CAPNS1-206ENST00000588815 FOXO1Q12778 655 aa28.06■■■□□ 2.08
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