RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586851.5

CAPNS1-202, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 616 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-202ENST00000586851 HIST1H2ABP04908 130 aa7.13□□□□□ -1.27
CAPNS1-202ENST00000586851 RHOP08100 348 aa7.13□□□□□ -1.27
CAPNS1-202ENST00000586851 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
CAPNS1-202ENST00000586851 FGF2P09038 288 aa7.13□□□□□ -1.27
CAPNS1-202ENST00000586851 CD3GP09693 182 aa7.13□□□□□ -1.27
CAPNS1-202ENST00000586851 ACSM4P0C7M7 580 aa7.13□□□□□ -1.27
CAPNS1-202ENST00000586851 CPMP14384 443 aa7.13□□□□□ -1.27
CAPNS1-202ENST00000586851 ATF1P18846 271 aa7.13□□□□□ -1.27
CAPNS1-202ENST00000586851 SRMP19623 302 aa7.13□□□□□ -1.27
CAPNS1-202ENST00000586851 CXCL3P19876 107 aa7.13□□□□□ -1.27
CAPNS1-202ENST00000586851 RAB3AP20336 220 aa7.13□□□□□ -1.27
CAPNS1-202ENST00000586851 CD79BP40259 229 aa7.13□□□□□ -1.27
CAPNS1-202ENST00000586851 PDX1P52945 283 aa7.13□□□□□ -1.27
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC16A1P53985 500 aa7.13□□□□□ -1.27
CAPNS1-202ENST00000586851 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
CAPNS1-202ENST00000586851 DGCR2P98153 550 aa7.13□□□□□ -1.27
CAPNS1-202ENST00000586851 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
CAPNS1-202ENST00000586851 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa7.13□□□□□ -1.27
CAPNS1-202ENST00000586851 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
CAPNS1-202ENST00000586851 BIKQ13323 160 aa7.13□□□□□ -1.27
CAPNS1-202ENST00000586851 CRMP1Q14194 572 aa7.13□□□□□ -1.27
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF345Q14585 488 aa7.13□□□□□ -1.27
CAPNS1-202ENST00000586851 TEAD2Q15562 447 aa7.13□□□□□ -1.27
CAPNS1-202ENST00000586851 RPE65Q16518 533 aa7.13□□□□□ -1.27
CAPNS1-202ENST00000586851 DCST2Q5T1A1 773 aa7.13□□□□□ -1.27
CAPNS1-202ENST00000586851 FAAH2Q6GMR7 532 aa7.13□□□□□ -1.27
CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM65Q6PI78 240 aa7.13□□□□□ -1.27
CAPNS1-202ENST00000586851 ARSKQ6UWY0 536 aa7.13□□□□□ -1.27
CAPNS1-202ENST00000586851 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP7.13□□□□□ -1.27
CAPNS1-202ENST00000586851 PGAP1Q75T13 922 aa7.13□□□□□ -1.27
CAPNS1-202ENST00000586851 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa7.13□□□□□ -1.27
CAPNS1-202ENST00000586851 GLCCI1Q86VQ1 547 aa7.13□□□□□ -1.27
CAPNS1-202ENST00000586851 PAQR7Q86WK9 346 aa7.13□□□□□ -1.27
CAPNS1-202ENST00000586851 NR2C2APQ86WQ0 139 aa7.13□□□□□ -1.27
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF227Q86WZ6 799 aa7.13□□□□□ -1.27
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC35F2Q8IXU6 374 aa7.13□□□□□ -1.27
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC38A6Q8IZM9 456 aa7.13□□□□□ -1.27
CAPNS1-202ENST00000586851 OR4N4Q8N0Y3 316 aa7.13□□□□□ -1.27
CAPNS1-202ENST00000586851 SIX5Q8N196 739 aa7.13□□□□□ -1.27
CAPNS1-202ENST00000586851 ESX1Q8N693 406 aa7.13□□□□□ -1.27
CAPNS1-202ENST00000586851 LINC01555Q8NAE3 123 aa7.13□□□□□ -1.27
CAPNS1-202ENST00000586851 BBS1Q8NFJ9 593 aa7.13□□□□□ -1.27
CAPNS1-202ENST00000586851 OR11G2Q8NGC1 345 aa7.13□□□□□ -1.27
CAPNS1-202ENST00000586851 OR4E2Q8NGC2 313 aa7.13□□□□□ -1.27
CAPNS1-202ENST00000586851 OR9A2Q8NGT5 310 aa7.13□□□□□ -1.27
CAPNS1-202ENST00000586851 OR6K3Q8NGY3 331 aa7.13□□□□□ -1.27
CAPNS1-202ENST00000586851 OR6N1Q8NGY5 312 aa7.13□□□□□ -1.27
CAPNS1-202ENST00000586851 GPR148Q8TDV2 347 aa7.13□□□□□ -1.27
CAPNS1-202ENST00000586851 THEM6Q8WUY1 208 aa7.13□□□□□ -1.27
CAPNS1-202ENST00000586851 HSD17B8Q92506 261 aa7.13□□□□□ -1.27
CAPNS1-202ENST00000586851 HIST1H2ACQ93077 130 aa7.13□□□□□ -1.27
CAPNS1-202ENST00000586851 PTP4A1Q93096 173 aa7.13□□□□□ -1.27
CAPNS1-202ENST00000586851 NACC2Q96BF6 587 aa7.13□□□□□ -1.27
CAPNS1-202ENST00000586851 PELI1Q96FA3 418 aa7.13□□□□□ -1.27
CAPNS1-202ENST00000586851 SFXN2Q96NB2 322 aa7.13□□□□□ -1.27
CAPNS1-202ENST00000586851 WFDC6Q9BQY6 131 aa7.13□□□□□ -1.27
CAPNS1-202ENST00000586851 G6PC3Q9BUM1 346 aa7.13□□□□□ -1.27
CAPNS1-202ENST00000586851 GSDMCQ9BYG8 508 aa7.13□□□□□ -1.27
CAPNS1-202ENST00000586851 RBCK1Q9BYM8 510 aa7.13□□□□□ -1.27
CAPNS1-202ENST00000586851 DPH1Q9BZG8 443 aa7.13□□□□□ -1.27
CAPNS1-202ENST00000586851 COMMD4Q9H0A8 199 aa7.13□□□□□ -1.27
CAPNS1-202ENST00000586851 SHARPINQ9H0F6 387 aa7.13□□□□□ -1.27
CAPNS1-202ENST00000586851 NOX3Q9HBY0 568 aa7.13□□□□□ -1.27
CAPNS1-202ENST00000586851 TCF7L1Q9HCS4 588 aa7.13□□□□□ -1.27
CAPNS1-202ENST00000586851 C5AR2Q9P296 337 aa7.13□□□□□ -1.27
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa7.13□□□□□ -1.27
CAPNS1-202ENST00000586851 CHST2Q9Y4C5 530 aa7.13□□□□□ -1.27
CAPNS1-202ENST00000586851 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa7.13□□□□□ -1.27
CAPNS1-202ENST00000586851 SCN5AQ14524 2016 aa7.13□□□□□ -1.27
CAPNS1-202ENST00000586851 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa7.13□□□□□ -1.27
CAPNS1-202ENST00000586851 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa7.12□□□□□ -1.27
CAPNS1-202ENST00000586851 SMIM30A4D0T7 59 aa7.12□□□□□ -1.27
CAPNS1-202ENST00000586851 ACOD1A6NK06 481 aa7.12□□□□□ -1.27
CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM200CA6NKL6 621 aa7.12□□□□□ -1.27
CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM212A6NML5 194 aa7.12□□□□□ -1.27
CAPNS1-202ENST00000586851 MCRIP1C9JLW8 97 aa7.12□□□□□ -1.27
CAPNS1-202ENST00000586851 F5H5P2 479 aa7.12□□□□□ -1.27
CAPNS1-202ENST00000586851 K7ESM1 405 aa7.12□□□□□ -1.27
CAPNS1-202ENST00000586851 ABCD4O14678 606 aa7.12□□□□□ -1.27
CAPNS1-202ENST00000586851 MID1O15344 667 aa7.12□□□□□ -1.27
CAPNS1-202ENST00000586851 P2RX6O15547 441 aa7.12□□□□□ -1.27
CAPNS1-202ENST00000586851 XRCC3O43542 346 aa7.12□□□□□ -1.27
CAPNS1-202ENST00000586851 TNFSF14O43557 240 aa7.12□□□□□ -1.27
CAPNS1-202ENST00000586851 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CAPNS1-202ENST00000586851 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP7.12□□□□□ -1.27
CAPNS1-202ENST00000586851 CTNSO60931 367 aa7.12□□□□□ -1.27
CAPNS1-202ENST00000586851 GLCEO94923 617 aa7.12□□□□□ -1.27
CAPNS1-202ENST00000586851 LYPD3O95274 346 aa7.12□□□□□ -1.27
CAPNS1-202ENST00000586851 MPC2O95563 127 aa7.12□□□□□ -1.27
CAPNS1-202ENST00000586851 PMS2P2O95744 297 aa7.12□□□□□ -1.27
CAPNS1-202ENST00000586851 TFPIP10646 304 aa7.12□□□□□ -1.27
CAPNS1-202ENST00000586851 PNMTP11086 282 aa7.12□□□□□ -1.27
CAPNS1-202ENST00000586851 MGMTP16455 207 aa7.12□□□□□ -1.27
CAPNS1-202ENST00000586851 C5AR1P21730 350 aa7.12□□□□□ -1.27
CAPNS1-202ENST00000586851 EDNRAP25101 427 aa7.12□□□□□ -1.27
CAPNS1-202ENST00000586851 P2RY2P41231 377 aa7.12□□□□□ -1.27
CAPNS1-202ENST00000586851 RPS21P63220 83 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CAPNS1-202ENST00000586851 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CAPNS1-202ENST00000586851 EGR3Q06889 387 aa7.12□□□□□ -1.27
CAPNS1-202ENST00000586851 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
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