RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	PUS1	Q9Y606	427 aa	Known RBP eCLIP	2.38	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	ALG6	Q9Y672	507 aa		2.38	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	IGHV2-70D	A0A0C4DH43	119 aa		2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A0J9YVX5	310 aa		2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A1B0GTI1	187 aa		2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	hCG_38984	A0A1B0GV85	526 aa		2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM213	A2RRL7	107 aa		2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	RAB19	A4D1S5	217 aa		2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM172BP	A6NC97	362 aa		2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	MGAT4D	A6NG13	374 aa		2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM74A7	A6NL05	159 aa		2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	LRRIQ3	A6PVS8	624 aa	Predicted RBP	2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	VGLL3	A8MV65	326 aa		2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957		G3V4G9	280 aa		2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM72C	H0Y354	149 aa		2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	RNASEK-C17orf49	H0YIS7	233 aa		2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957		M0R3G1	203 aa		2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	TRAFD1	O14545	582 aa	Predicted RBP	2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	ZBTB5	O15062	677 aa		2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	UGT2B17	O75795	530 aa		2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	ZMPSTE24	O75844	475 aa		2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	DIRAS1	O95057	198 aa		2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	F10	P00742	488 aa		2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	IGHV4-39	P01824	125 aa		2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	HLA-H	P01893	362 aa		2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	HOXB7	P09629	217 aa		2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	PRSS56	P0CW18	603 aa		2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	HLA-DOB	P13765	273 aa		2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	ITGA2	P17301	1181 aa		2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	BGN	P21810	368 aa		2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	IL12B	P29460	328 aa		2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	UGT1A3	P35503	534 aa		2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	RPL4	P36578	427 aa	Known RBP	2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	TNFSF9	P41273	254 aa		2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	BDKRB1	P46663	353 aa		2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	QARS	P47897	775 aa	Known RBP	2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	HNRNPA3	P51991	378 aa	Known RBP	2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	EMP2	P54851	167 aa		2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	ABCE1	P61221	599 aa	Known RBP	2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	TSPAN5	P62079	268 aa		2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	STX3	Q13277	289 aa		2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	CYLC2	Q14093	348 aa	Predicted RBP	2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	VGLL4	Q14135	290 aa		2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	GNA13	Q14344	377 aa		2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	CYTH1	Q15438	398 aa		2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	MAPRE2	Q15555	327 aa		2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	UBE2V2	Q15819	145 aa		2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	MRPL23	Q16540	153 aa	Known RBP	2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	DGUOK	Q16854	277 aa		2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	ISX	Q2M1V0	245 aa		2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	HLA-B	Q31612	363 aa		2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC22A6	Q4U2R8	563 aa		2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM74A3	Q4VXF1	159 aa		2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	LCE1C	Q5T751	118 aa		2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM72A	Q5TYM5	149 aa		2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM72D	Q6L9T8	149 aa		2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	REEP3	Q6NUK4	255 aa		2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	SCYL2	Q6P3W7	929 aa		2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM171B	Q6P995	826 aa		2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	UQCC3	Q6UW78	93 aa		2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	LRRC74B	Q6ZQY2	392 aa		2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC35D2	Q76EJ3	337 aa		2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	ABHD12B	Q7Z5M8	362 aa	Predicted RBP	2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	CEACAM19	Q7Z692	300 aa		2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM72B	Q86X60	149 aa		2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	RNF130	Q86XS8	419 aa		2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	NUDCD3	Q8IVD9	361 aa		2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC35F2	Q8IXU6	374 aa		2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	KLHDC8B	Q8IXV7	354 aa		2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC22A15	Q8IZD6	547 aa		2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	ARHGAP18	Q8N392	663 aa		2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	JAGN1	Q8N5M9	183 aa		2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF781	Q8N8C0	355 aa		2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	SNX31	Q8N9S9	440 aa		2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	ZSCAN4	Q8NAM6	433 aa	Predicted RBP	2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	INO80E	Q8NBZ0	244 aa	Predicted RBP	2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	ICA1L	Q8NDH6	482 aa		2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	SDR9C7	Q8NEX9	313 aa		2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	OR4D10	Q8NGI6	311 aa		2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	OR1L3	Q8NH93	324 aa		2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM76A	Q8TAV0	307 aa		2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	NUBPL	Q8TB37	319 aa		2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	IL1F10	Q8WWZ1	152 aa		2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM131C	Q96AQ9	280 aa		2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	SDSL	Q96GA7	329 aa		2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	NSL1	Q96IY1	281 aa		2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	PLEKHA8	Q96JA3	519 aa		2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	RCHY1	Q96PM5	261 aa		2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	DUX3	Q96PT4	197 aa		2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	FMO2	Q99518	471 aa		2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF670	Q9BS34	389 aa		2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC35A5	Q9BS91	424 aa		2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	APOO	Q9BUR5	198 aa		2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	MCRIP2	Q9BUT9	160 aa	Known RBP	2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	GPR174	Q9BXC1	333 aa		2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	ROGDI	Q9GZN7	287 aa		2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	NXF5	Q9H1B4	397 aa	Known RBP	2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	NHEJ1	Q9H9Q4	299 aa	Predicted RBP	2.37	□□□□□ -2.03

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