RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557464.5

RBM23-230, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 5

Gene RBM23, Length 457 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-230	ENST00000557464	GPR52	Q9Y2T5	361 aa		10.86	□□□□□ -0.67
RBM23-230	ENST00000557464	HDGFL3	Q9Y3E1	203 aa		10.86	□□□□□ -0.67
RBM23-230	ENST00000557464		A0A1W2PP18	115 aa		10.85	□□□□□ -0.67
RBM23-230	ENST00000557464	TMEM247	A6NEH6	219 aa		10.85	□□□□□ -0.67
RBM23-230	ENST00000557464	ZNF716	A6NP11	495 aa		10.85	□□□□□ -0.67
RBM23-230	ENST00000557464	ZNF724	A8MTY0	619 aa		10.85	□□□□□ -0.67
RBM23-230	ENST00000557464	FRS3	O43559	492 aa		10.85	□□□□□ -0.67
RBM23-230	ENST00000557464	PGM3	O95394	542 aa		10.85	□□□□□ -0.67
RBM23-230	ENST00000557464	THBS1	P07996	1170 aa		10.85	□□□□□ -0.67
RBM23-230	ENST00000557464	PPP3CB	P16298	524 aa		10.85	□□□□□ -0.67
RBM23-230	ENST00000557464	CD53	P19397	219 aa		10.85	□□□□□ -0.67
RBM23-230	ENST00000557464	FKBP2	P26885	142 aa	Known RBP	10.85	□□□□□ -0.67
RBM23-230	ENST00000557464	OR3A2	P47893	321 aa		10.85	□□□□□ -0.67
RBM23-230	ENST00000557464	HOXC5	Q00444	222 aa		10.85	□□□□□ -0.67
RBM23-230	ENST00000557464	BNIP2	Q12982	314 aa		10.85	□□□□□ -0.67
RBM23-230	ENST00000557464	FADD	Q13158	208 aa		10.85	□□□□□ -0.67
RBM23-230	ENST00000557464	ZNF311	Q5JNZ3	666 aa		10.85	□□□□□ -0.67
RBM23-230	ENST00000557464	SFRP5	Q5T4F7	317 aa		10.85	□□□□□ -0.67
RBM23-230	ENST00000557464	RNF220	Q5VTB9	566 aa		10.85	□□□□□ -0.67
RBM23-230	ENST00000557464	ABLIM2	Q6H8Q1	611 aa		10.85	□□□□□ -0.67
RBM23-230	ENST00000557464	ALKBH2	Q6NS38	261 aa		10.85	□□□□□ -0.67
RBM23-230	ENST00000557464	DLEU7	Q6UYE1	221 aa		10.85	□□□□□ -0.67
RBM23-230	ENST00000557464	SERPINA11	Q86U17	422 aa		10.85	□□□□□ -0.67
RBM23-230	ENST00000557464	ZNF440	Q8IYI8	595 aa		10.85	□□□□□ -0.67
RBM23-230	ENST00000557464	NFKBID	Q8NI38	313 aa		10.85	□□□□□ -0.67
RBM23-230	ENST00000557464	MBD6	Q96DN6	1003 aa		10.85	□□□□□ -0.67
RBM23-230	ENST00000557464	TACO1	Q9BSH4	297 aa	Known RBP	10.85	□□□□□ -0.67
RBM23-230	ENST00000557464	TMEM45A	Q9NWC5	275 aa		10.85	□□□□□ -0.67
RBM23-230	ENST00000557464	TMEM181	Q9P2C4	612 aa		10.85	□□□□□ -0.67
RBM23-230	ENST00000557464	TRAPPC4	Q9Y296	219 aa		10.85	□□□□□ -0.67
RBM23-230	ENST00000557464	DSCAM	O60469	2012 aa		10.84	□□□□□ -0.67
RBM23-230	ENST00000557464	IGKV3D-15	A0A087WSY6	115 aa		10.84	□□□□□ -0.67
RBM23-230	ENST00000557464		A0A0G2JND7	137 aa		10.84	□□□□□ -0.67
RBM23-230	ENST00000557464	MBD3L2B	A0A1B0GVZ6	204 aa	Predicted RBP	10.84	□□□□□ -0.67
RBM23-230	ENST00000557464	C5orf58	C9J3I9	102 aa		10.84	□□□□□ -0.67
RBM23-230	ENST00000557464	ZNF208	O43345	1280 aa		10.84	□□□□□ -0.67
RBM23-230	ENST00000557464	PLAU	P00749	431 aa		10.84	□□□□□ -0.67
RBM23-230	ENST00000557464	ARAF	P10398	606 aa		10.84	□□□□□ -0.67
RBM23-230	ENST00000557464	UQCRB	P14927	111 aa		10.84	□□□□□ -0.67
RBM23-230	ENST00000557464	GPX2	P18283	190 aa		10.84	□□□□□ -0.67
RBM23-230	ENST00000557464	FPR1	P21462	350 aa		10.84	□□□□□ -0.67
RBM23-230	ENST00000557464	CXCR1	P25024	350 aa		10.84	□□□□□ -0.67
RBM23-230	ENST00000557464	IRX1	P78414	480 aa	Predicted RBP	10.84	□□□□□ -0.67
RBM23-230	ENST00000557464	H3F3A	P84243	136 aa		10.84	□□□□□ -0.67
RBM23-230	ENST00000557464	SF3A3	Q12874	501 aa	Known RBP eCLIP	10.84	□□□□□ -0.67
RBM23-230	ENST00000557464	PDK3	Q15120	406 aa		10.84	□□□□□ -0.67
RBM23-230	ENST00000557464	DEFB113	Q30KQ7	82 aa		10.84	□□□□□ -0.67
RBM23-230	ENST00000557464	RUNDC3A	Q59EK9	446 aa		10.84	□□□□□ -0.67
RBM23-230	ENST00000557464	GCNT6	Q5T4J0	391 aa		10.84	□□□□□ -0.67
RBM23-230	ENST00000557464	PRAMEF8	Q5VWM4	474 aa		10.84	□□□□□ -0.67
RBM23-230	ENST00000557464	PRAMEF7	Q5VXH5	474 aa		10.84	□□□□□ -0.67
RBM23-230	ENST00000557464	WBP2NL	Q6ICG8	309 aa		10.84	□□□□□ -0.67
RBM23-230	ENST00000557464	GALNT5	Q7Z7M9	940 aa		10.84	□□□□□ -0.67
RBM23-230	ENST00000557464	RETREG3	Q86VR2	466 aa		10.84	□□□□□ -0.67
RBM23-230	ENST00000557464	STEAP2	Q8NFT2	490 aa		10.84	□□□□□ -0.67
RBM23-230	ENST00000557464	BBS10	Q8TAM1	723 aa		10.84	□□□□□ -0.67
RBM23-230	ENST00000557464	STON2	Q8WXE9	905 aa		10.84	□□□□□ -0.67
RBM23-230	ENST00000557464	DDIT4L	Q96D03	193 aa		10.84	□□□□□ -0.67
RBM23-230	ENST00000557464	ZHX1-C8orf76	Q96EF9	292 aa		10.84	□□□□□ -0.67
RBM23-230	ENST00000557464	HDHD5	Q9BXW7	423 aa		10.84	□□□□□ -0.67
RBM23-230	ENST00000557464	RABEP2	Q9H5N1	569 aa		10.84	□□□□□ -0.67
RBM23-230	ENST00000557464	NIPSNAP3A	Q9UFN0	247 aa	Predicted RBP	10.84	□□□□□ -0.67
RBM23-230	ENST00000557464	IFT52	Q9Y366	437 aa		10.84	□□□□□ -0.67
RBM23-230	ENST00000557464	GMEB1	Q9Y692	573 aa		10.84	□□□□□ -0.67
RBM23-230	ENST00000557464	RAI1	Q7Z5J4	1906 aa	Predicted RBP	10.84	□□□□□ -0.67
RBM23-230	ENST00000557464	ZNF469	Q96JG9	3925 aa	Predicted RBP	10.83	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	DNPH1	O43598	174 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	TPST1	O60507	370 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	LYZL6	O75951	148 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	IGHV3-9	P01782	118 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	ETS2	P15036	469 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	PPIB	P23284	216 aa	Known RBP	10.83	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	IL32	P24001	234 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	COPZ1	P61923	177 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	SLC35A1	P78382	337 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	CDK6	Q00534	326 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	ITGAD	Q13349	1161 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	CEACAM7	Q14002	265 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	SELPLG	Q14242	412 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	P2RY6	Q15077	328 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	TAB1	Q15750	504 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	ADRM1	Q16186	407 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	ACKR1	Q16570	336 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	ZSWIM7	Q19AV6	140 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	GLIPR1L2	Q4G1C9	344 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	BEX5	Q5H9J7	111 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	REEP3	Q6NUK4	255 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464		Q6ZT83	130 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	BHLHA15	Q7RTS1	189 aa	Predicted RBP	10.83	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	COMTD1	Q86VU5	262 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	ZNF100	Q8IYN0	542 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	TMEM99	Q8N816	258 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	PIGX	Q8TBF5	258 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	C3orf49	Q96BT1	292 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	PLPPR2	Q96GM1	343 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	ALPK1	Q96QP1	1244 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	CPPED1	Q9BRF8	314 aa	Predicted RBP	10.83	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	PRR14	Q9BWN1	585 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	TMEM120A	Q9BXJ8	343 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	POTEKP	Q9BYX7	375 aa		10.83	□□□□□ -0.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms