RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551931.5

LETMD1-231, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

TSL 3

Gene LETMD1, Length 705 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-231	ENST00000551931	C1QC	P02747	245 aa		11.01	□□□□□ -0.65
LETMD1-231	ENST00000551931	OR12D1	P0DN82	309 aa		11.01	□□□□□ -0.65
LETMD1-231	ENST00000551931	USF1	P22415	310 aa	Predicted RBP	11.01	□□□□□ -0.65
LETMD1-231	ENST00000551931	CLDN8	P56748	225 aa		11.01	□□□□□ -0.65
LETMD1-231	ENST00000551931	OR2B6	P58173	313 aa		11.01	□□□□□ -0.65
LETMD1-231	ENST00000551931	LSM11	P83369	360 aa	Known RBP eCLIP	11.01	□□□□□ -0.65
LETMD1-231	ENST00000551931	TNFAIP8L2	Q6P589	184 aa	Predicted RBP	11.01	□□□□□ -0.65
LETMD1-231	ENST00000551931	FRRS1	Q6ZNA5	592 aa		11.01	□□□□□ -0.65
LETMD1-231	ENST00000551931	HOMEZ	Q8IX15	550 aa		11.01	□□□□□ -0.65
LETMD1-231	ENST00000551931	MIPOL1	Q8TD10	442 aa		11.01	□□□□□ -0.65
LETMD1-231	ENST00000551931	C19orf24	Q9BVV8	132 aa		11.01	□□□□□ -0.65
LETMD1-231	ENST00000551931	SLC17A5	Q9NRA2	495 aa		11.01	□□□□□ -0.65
LETMD1-231	ENST00000551931	EXD2	Q9NVH0	621 aa		11.01	□□□□□ -0.65
LETMD1-231	ENST00000551931	SLC35A3	Q9Y2D2	325 aa		11.01	□□□□□ -0.65
LETMD1-231	ENST00000551931	WDR45	Q9Y484	360 aa		11.01	□□□□□ -0.65
LETMD1-231	ENST00000551931	FLVCR1	Q9Y5Y0	555 aa		11.01	□□□□□ -0.65
LETMD1-231	ENST00000551931	PRAMEF27	A3QJZ7	478 aa		11	□□□□□ -0.65
LETMD1-231	ENST00000551931	VWC2L	B2RUY7	222 aa		11	□□□□□ -0.65
LETMD1-231	ENST00000551931	RNASET2	O00584	256 aa	Known RBP	11	□□□□□ -0.65
LETMD1-231	ENST00000551931	AP3D1	O14617	1153 aa		11	□□□□□ -0.65
LETMD1-231	ENST00000551931	ANKRD28	O15084	1053 aa		11	□□□□□ -0.65
LETMD1-231	ENST00000551931	SCN2B	O60939	215 aa		11	□□□□□ -0.65
LETMD1-231	ENST00000551931	SPAG7	O75391	227 aa		11	□□□□□ -0.65
LETMD1-231	ENST00000551931	CSF3	P09919	207 aa		11	□□□□□ -0.65
LETMD1-231	ENST00000551931	IMPDH2	P12268	514 aa		11	□□□□□ -0.65
LETMD1-231	ENST00000551931	APOBEC3A	P31941	199 aa	Predicted RBP	11	□□□□□ -0.65
LETMD1-231	ENST00000551931	MAGEA8	P43361	318 aa		11	□□□□□ -0.65
LETMD1-231	ENST00000551931	PHC1	P78364	1004 aa		11	□□□□□ -0.65
LETMD1-231	ENST00000551931	GGTLC2	Q14390	218 aa		11	□□□□□ -0.65
LETMD1-231	ENST00000551931	MST1L	Q2TV78	715 aa		11	□□□□□ -0.65
LETMD1-231	ENST00000551931	TSPO2	Q5TGU0	170 aa		11	□□□□□ -0.65
LETMD1-231	ENST00000551931	AP1AR	Q63HQ0	302 aa		11	□□□□□ -0.65
LETMD1-231	ENST00000551931	ANKRD46	Q86W74	232 aa		11	□□□□□ -0.65
LETMD1-231	ENST00000551931	C17orf78	Q8N4C9	275 aa		11	□□□□□ -0.65
LETMD1-231	ENST00000551931	C1orf162	Q8NEQ5	155 aa	Predicted RBP	11	□□□□□ -0.65
LETMD1-231	ENST00000551931	OR4A15	Q8NGL6	344 aa		11	□□□□□ -0.65
LETMD1-231	ENST00000551931	XAGE5	Q8WWM1	108 aa		11	□□□□□ -0.65
LETMD1-231	ENST00000551931	CNOT9	Q92600	299 aa	Known RBP	11	□□□□□ -0.65
LETMD1-231	ENST00000551931	ROPN1L	Q96C74	230 aa		11	□□□□□ -0.65
LETMD1-231	ENST00000551931	SORCS2	Q96PQ0	1159 aa		11	□□□□□ -0.65
LETMD1-231	ENST00000551931	PRR14	Q9BWN1	585 aa		11	□□□□□ -0.65
LETMD1-231	ENST00000551931	SAP130	Q9H0E3	1048 aa		11	□□□□□ -0.65
LETMD1-231	ENST00000551931	CHODL	Q9H9P2	273 aa		11	□□□□□ -0.65
LETMD1-231	ENST00000551931	FKRP	Q9H9S5	495 aa		11	□□□□□ -0.65
LETMD1-231	ENST00000551931	TMEM181	Q9P2C4	612 aa		11	□□□□□ -0.65
LETMD1-231	ENST00000551931	UPB1	Q9UBR1	384 aa		11	□□□□□ -0.65
LETMD1-231	ENST00000551931	DCTN4	Q9UJW0	460 aa		11	□□□□□ -0.65
LETMD1-231	ENST00000551931	TRAPPC4	Q9Y296	219 aa		11	□□□□□ -0.65
LETMD1-231	ENST00000551931	TMED7-TICAM2	A0A0A6YYA0	188 aa		10.99	□□□□□ -0.65
LETMD1-231	ENST00000551931	TLDC2	A0PJX2	215 aa		10.99	□□□□□ -0.65
LETMD1-231	ENST00000551931	TMEM72	A0PK05	275 aa		10.99	□□□□□ -0.65
LETMD1-231	ENST00000551931	ZC3H12D	A2A288	527 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65
LETMD1-231	ENST00000551931	C8B	P07358	591 aa		10.99	□□□□□ -0.65
LETMD1-231	ENST00000551931	GUSB	P08236	651 aa		10.99	□□□□□ -0.65
LETMD1-231	ENST00000551931	SRD5A1	P18405	259 aa		10.99	□□□□□ -0.65
LETMD1-231	ENST00000551931	THBS2	P35442	1172 aa		10.99	□□□□□ -0.65
LETMD1-231	ENST00000551931	IDH2	P48735	452 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65
LETMD1-231	ENST00000551931	CLK1	P49759	484 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65
LETMD1-231	ENST00000551931	GZMK	P49863	264 aa		10.99	□□□□□ -0.65
LETMD1-231	ENST00000551931	KCNJ10	P78508	379 aa		10.99	□□□□□ -0.65
LETMD1-231	ENST00000551931	EMX2	Q04743	252 aa		10.99	□□□□□ -0.65
LETMD1-231	ENST00000551931	CHRNB3	Q05901	458 aa		10.99	□□□□□ -0.65
LETMD1-231	ENST00000551931	SLC17A1	Q14916	467 aa		10.99	□□□□□ -0.65
LETMD1-231	ENST00000551931	SWI5	Q1ZZU3	235 aa		10.99	□□□□□ -0.65
LETMD1-231	ENST00000551931	ATAD3B	Q5T9A4	648 aa		10.99	□□□□□ -0.65
LETMD1-231	ENST00000551931	SAXO2	Q658L1	398 aa		10.99	□□□□□ -0.65
LETMD1-231	ENST00000551931	ARFGAP2	Q8N6H7	521 aa		10.99	□□□□□ -0.65
LETMD1-231	ENST00000551931	OR8J2	Q8NGG1	315 aa		10.99	□□□□□ -0.65
LETMD1-231	ENST00000551931	KIF18A	Q8NI77	898 aa		10.99	□□□□□ -0.65
LETMD1-231	ENST00000551931	TCP10L	Q8TDR4	215 aa		10.99	□□□□□ -0.65
LETMD1-231	ENST00000551931	OIT3	Q8WWZ8	545 aa		10.99	□□□□□ -0.65
LETMD1-231	ENST00000551931	C3orf49	Q96BT1	292 aa		10.99	□□□□□ -0.65
LETMD1-231	ENST00000551931	MSI2	Q96DH6	328 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65
LETMD1-231	ENST00000551931	FBXO17	Q96EF6	278 aa		10.99	□□□□□ -0.65
LETMD1-231	ENST00000551931	PPP1R36	Q96LQ0	422 aa		10.99	□□□□□ -0.65
LETMD1-231	ENST00000551931	EXOSC3	Q9NQT5	275 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65
LETMD1-231	ENST00000551931	POLE3	Q9NRF9	147 aa		10.99	□□□□□ -0.65
LETMD1-231	ENST00000551931	ASIC5	Q9NY37	505 aa		10.99	□□□□□ -0.65
LETMD1-231	ENST00000551931	NOP53	Q9NZM5	478 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65
LETMD1-231	ENST00000551931	OSGIN1	Q9UJX0	560 aa		10.99	□□□□□ -0.65
LETMD1-231	ENST00000551931	MOK	Q9UQ07	419 aa		10.99	□□□□□ -0.65
LETMD1-231	ENST00000551931	SLC9A8	Q9Y2E8	581 aa		10.99	□□□□□ -0.65
LETMD1-231	ENST00000551931	AMDHD2	Q9Y303	409 aa		10.99	□□□□□ -0.65
LETMD1-231	ENST00000551931	TMED7	Q9Y3B3	224 aa		10.99	□□□□□ -0.65
LETMD1-231	ENST00000551931	PMF1-BGLAP	U3KQ54	211 aa		10.99	□□□□□ -0.65
LETMD1-231	ENST00000551931	DYSF	O75923	2080 aa		10.98	□□□□□ -0.65
LETMD1-231	ENST00000551931	IGHV4-61	A0A0C4DH41	118 aa		10.98	□□□□□ -0.65
LETMD1-231	ENST00000551931	CPSF4	O95639	269 aa	Known RBP	10.98	□□□□□ -0.65
LETMD1-231	ENST00000551931	AGR2	O95994	175 aa		10.98	□□□□□ -0.65
LETMD1-231	ENST00000551931	BMP4	P12644	408 aa		10.98	□□□□□ -0.65
LETMD1-231	ENST00000551931	CREB1	P16220	341 aa		10.98	□□□□□ -0.65
LETMD1-231	ENST00000551931	FKBP2	P26885	142 aa	Known RBP	10.98	□□□□□ -0.65
LETMD1-231	ENST00000551931	SERPINB5	P36952	375 aa		10.98	□□□□□ -0.65
LETMD1-231	ENST00000551931	NR4A2	P43354	598 aa		10.98	□□□□□ -0.65
LETMD1-231	ENST00000551931	PDLIM4	P50479	330 aa		10.98	□□□□□ -0.65
LETMD1-231	ENST00000551931	SLC35A1	P78382	337 aa		10.98	□□□□□ -0.65
LETMD1-231	ENST00000551931	MAD2L1	Q13257	205 aa	Predicted RBP	10.98	□□□□□ -0.65
LETMD1-231	ENST00000551931	GPAT3	Q53EU6	434 aa		10.98	□□□□□ -0.65
LETMD1-231	ENST00000551931	HIKESHI	Q53FT3	197 aa		10.98	□□□□□ -0.65
LETMD1-231	ENST00000551931	FAM120AOS	Q5T036	256 aa		10.98	□□□□□ -0.65

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