RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 ABHD17CQ6PCB6 329 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 OR2L13Q8N349 312 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 OR52N1Q8NH53 320 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 ZFP90Q8TF47 636 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 CCDC120Q96HB5 630 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 VN1R3Q9BXE9 311 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 PISDQ9UG56 409 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 MUTYHQ9UIF7 546 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 KLK4Q9Y5K2 254 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF587BE7ETH6 402 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF749O43361 778 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF254O75437 659 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 IST1P53990 364 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 SRYQ05066 204 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 AAED1Q7RTV5 226 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 GRINAQ7Z429 371 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 TP53INP2Q8IXH6 220 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 PGBD5Q8N414 524 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 LILRB2Q8N423 598 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 CLDN22Q8N7P3 220 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 POGLUT1Q8NBL1 392 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 MOCOSQ96EN8 888 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 TSSK2Q96PF2 358 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 TBX21Q9UL17 535 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 TRAV18A0A075B6X5 111 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 LILRA5A6NI73 299 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 S100A12P80511 92 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 ACSM3Q53FZ2 586 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 SLC16A14Q7RTX9 510 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 OR9K2Q8NGE7 335 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 OR5J2Q8NH18 312 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 DYNLRB1Q9NP97 96 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 STEAP1Q9UHE8 339 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 PCDHB10Q9UN67 800 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 LRRC30A6NM36 301 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 NSA2O95478 260 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 DDAH2O95865 285 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 NPR2P20594 1047 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 HTR1FP30939 366 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 LAPTM4AQ15012 233 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 RAB6CQ53S08 254 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 RNF165Q6ZSG1 346 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 RDH10Q8IZV5 341 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 SPEM1Q8N4L4 309 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 KCNG3Q8TAE7 436 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 FNDC9Q8TBE3 224 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 OR2M2Q96R28 347 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 RAB6CQ9H0N0 254 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 TMEM168Q9H0V1 697 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 TMED7Q9Y3B3 224 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 NME7Q9Y5B8 376 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 PRSS56P0CW18 603 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 RPS5P46782 204 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 RGS19P49795 217 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 PCGF3Q3KNV8 242 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 ELMOD2Q8IZ81 293 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 OR51A2Q8NGJ7 313 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 RSPRY1Q96DX4 576 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 ISYNA1Q9NPH2 558 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 CDC14CA4D256 554 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 C17orf112F2Z3M2 114 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 DSCR3O14972 297 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 MPPED1O15442 326 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 FABP1P07148 127 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 UQCRC1P31930 480 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 RGRP47804 291 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF81P51508 661 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 P2RX1P51575 399 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 CSNK1G2P78368 415 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 Q6ZNB5 142 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 B3GNT7Q8NFL0 401 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 OR1S1Q8NH92 325 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 NT5CQ8TCD5 201 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 ST8SIA1Q92185 356 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 MSLNLQ96KJ4 702 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 PSD2Q9BQI7 771 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 NICN1Q9BSH3 213 aa7.91□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms