RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539804.1

PITX3-202, Transcript of paired like homeodomain 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PITX3, Length 1,187 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3-202ENST00000539804 TAPBPLQ9BX59 468 aa21.6■■□□□ 1.05
PITX3-202ENST00000539804 KLHL4Q9C0H6 718 aa21.6■■□□□ 1.05
PITX3-202ENST00000539804 AP3M1Q9Y2T2 418 aa21.6■■□□□ 1.05
PITX3-202ENST00000539804 APCP25054 2843 aa21.6■■□□□ 1.05
PITX3-202ENST00000539804 A8MVM7 634 aa21.59■■□□□ 1.05
PITX3-202ENST00000539804 GKN3PP0CG01 181 aa21.59■■□□□ 1.05
PITX3-202ENST00000539804 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
PITX3-202ENST00000539804 OR2B6P58173 313 aa21.59■■□□□ 1.05
PITX3-202ENST00000539804 PLAURQ03405 335 aa21.59■■□□□ 1.05
PITX3-202ENST00000539804 P2RY6Q15077 328 aa21.59■■□□□ 1.05
PITX3-202ENST00000539804 ARMC8Q8IUR7 673 aa21.59■■□□□ 1.05
PITX3-202ENST00000539804 CLIP4Q8N3C7 705 aa21.59■■□□□ 1.05
PITX3-202ENST00000539804 OR8J3Q8NGG0 315 aa21.59■■□□□ 1.05
PITX3-202ENST00000539804 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
PITX3-202ENST00000539804 TRIM2Q9C040 744 aa21.59■■□□□ 1.05
PITX3-202ENST00000539804 PIF1Q9H611 641 aa21.59■■□□□ 1.05
PITX3-202ENST00000539804 C12orf49Q9H741 205 aa21.59■■□□□ 1.05
PITX3-202ENST00000539804 CAPN7Q9Y6W3 813 aa21.59■■□□□ 1.05
PITX3-202ENST00000539804 TEX15Q9BXT5 2789 aa21.59■■□□□ 1.05
PITX3-202ENST00000539804 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa21.58■■□□□ 1.05
PITX3-202ENST00000539804 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
PITX3-202ENST00000539804 ADAM11O75078 769 aa21.58■■□□□ 1.05
PITX3-202ENST00000539804 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
PITX3-202ENST00000539804 IDUAP35475 653 aa21.58■■□□□ 1.05
PITX3-202ENST00000539804 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
PITX3-202ENST00000539804 STK35Q8TDR2 534 aa21.58■■□□□ 1.05
PITX3-202ENST00000539804 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
PITX3-202ENST00000539804 SAR1AQ9NR31 198 aa21.58■■□□□ 1.05
PITX3-202ENST00000539804 PARPBPQ9NWS1 579 aa21.58■■□□□ 1.05
PITX3-202ENST00000539804 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
PITX3-202ENST00000539804 TMEM72A0PK05 275 aa21.57■■□□□ 1.04
PITX3-202ENST00000539804 PNMTP11086 282 aa21.57■■□□□ 1.04
PITX3-202ENST00000539804 CCNA2P20248 432 aa21.57■■□□□ 1.04
PITX3-202ENST00000539804 KLF10Q13118 480 aa21.57■■□□□ 1.04
PITX3-202ENST00000539804 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa21.57■■□□□ 1.04
PITX3-202ENST00000539804 PAQR6Q6TCH4 344 aa21.57■■□□□ 1.04
PITX3-202ENST00000539804 TFAP2EQ6VUC0 442 aa21.57■■□□□ 1.04
PITX3-202ENST00000539804 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
PITX3-202ENST00000539804 ZNF100Q8IYN0 542 aa21.57■■□□□ 1.04
PITX3-202ENST00000539804 LSMEM1Q8N8F7 131 aa21.57■■□□□ 1.04
PITX3-202ENST00000539804 ARL5BQ96KC2 179 aa21.57■■□□□ 1.04
PITX3-202ENST00000539804 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
PITX3-202ENST00000539804 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa21.56■■□□□ 1.04
PITX3-202ENST00000539804 C8BP07358 591 aa21.56■■□□□ 1.04
PITX3-202ENST00000539804 OR3A2P47893 321 aa21.56■■□□□ 1.04
PITX3-202ENST00000539804 SLC16A1P53985 500 aa21.56■■□□□ 1.04
PITX3-202ENST00000539804 FAM91A1Q658Y4 838 aa21.56■■□□□ 1.04
PITX3-202ENST00000539804 ERICH5Q6P6B1 374 aa21.56■■□□□ 1.04
PITX3-202ENST00000539804 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
PITX3-202ENST00000539804 RETREG3Q86VR2 466 aa21.56■■□□□ 1.04
PITX3-202ENST00000539804 LRRC58Q96CX6 371 aa21.56■■□□□ 1.04
PITX3-202ENST00000539804 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa21.56■■□□□ 1.04
PITX3-202ENST00000539804 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
PITX3-202ENST00000539804 ECSITQ9BQ95 431 aa21.56■■□□□ 1.04
PITX3-202ENST00000539804 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
PITX3-202ENST00000539804 IKZF5Q9H5V7 419 aa21.56■■□□□ 1.04
PITX3-202ENST00000539804 TMEM27Q9HBJ8 222 aa21.56■■□□□ 1.04
PITX3-202ENST00000539804 NGBQ9NPG2 151 aa21.56■■□□□ 1.04
PITX3-202ENST00000539804 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
PITX3-202ENST00000539804 ABCA12Q86UK0 2595 aa21.55■■□□□ 1.04
PITX3-202ENST00000539804 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
PITX3-202ENST00000539804 MRASO14807 208 aa21.55■■□□□ 1.04
PITX3-202ENST00000539804 VAMP5O95183 116 aa21.55■■□□□ 1.04
PITX3-202ENST00000539804 CRYGSP22914 178 aa21.55■■□□□ 1.04
PITX3-202ENST00000539804 MTPNP58546 118 aa21.55■■□□□ 1.04
PITX3-202ENST00000539804 KRTAP10-9P60411 292 aa21.55■■□□□ 1.04
PITX3-202ENST00000539804 ADRM1Q16186 407 aa21.55■■□□□ 1.04
PITX3-202ENST00000539804 ELOA3BQ3SY89 546 aa21.55■■□□□ 1.04
PITX3-202ENST00000539804 Q6ZT83 130 aa21.55■■□□□ 1.04
PITX3-202ENST00000539804 CDC20BQ86Y33 519 aa21.55■■□□□ 1.04
PITX3-202ENST00000539804 ELOA3Q8NG57 546 aa21.55■■□□□ 1.04
PITX3-202ENST00000539804 SLC26A7Q8TE54 656 aa21.55■■□□□ 1.04
PITX3-202ENST00000539804 OR11A1Q9GZK7 315 aa21.55■■□□□ 1.04
PITX3-202ENST00000539804 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa21.55■■□□□ 1.04
PITX3-202ENST00000539804 DCHS2Q6V1P9 2916 aa21.55■■□□□ 1.04
PITX3-202ENST00000539804 OR2T1O43869 369 aa21.54■■□□□ 1.04
PITX3-202ENST00000539804 AHSA1O95433 338 aa21.54■■□□□ 1.04
PITX3-202ENST00000539804 IFNA14P01570 189 aa21.54■■□□□ 1.04
PITX3-202ENST00000539804 IL32P24001 234 aa21.54■■□□□ 1.04
PITX3-202ENST00000539804 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
PITX3-202ENST00000539804 PCGF2P35227 344 aa21.54■■□□□ 1.04
PITX3-202ENST00000539804 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
PITX3-202ENST00000539804 H3F3AP84243 136 aa21.54■■□□□ 1.04
PITX3-202ENST00000539804 NANOGP8Q6NSW7 305 aa21.54■■□□□ 1.04
PITX3-202ENST00000539804 CGB2Q6NT52 195 aa21.54■■□□□ 1.04
PITX3-202ENST00000539804 ULK3Q6PHR2 472 aa21.54■■□□□ 1.04
PITX3-202ENST00000539804 C6orf89Q6UWU4 347 aa21.54■■□□□ 1.04
PITX3-202ENST00000539804 STAC2Q6ZMT1 411 aa21.54■■□□□ 1.04
PITX3-202ENST00000539804 ARPINQ7Z6K5 226 aa21.54■■□□□ 1.04
PITX3-202ENST00000539804 OR52E4Q8NGH9 312 aa21.54■■□□□ 1.04
PITX3-202ENST00000539804 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
PITX3-202ENST00000539804 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
PITX3-202ENST00000539804 C3orf49Q96BT1 292 aa21.54■■□□□ 1.04
PITX3-202ENST00000539804 NANOGQ9H9S0 305 aa21.54■■□□□ 1.04
PITX3-202ENST00000539804 CREBBPQ92793 2442 aa21.53■■□□□ 1.04
PITX3-202ENST00000539804 FMO6PO60774 539 aa21.53■■□□□ 1.04
PITX3-202ENST00000539804 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
PITX3-202ENST00000539804 FPR1P21462 350 aa21.53■■□□□ 1.04
PITX3-202ENST00000539804 DNASE1P24855 282 aa21.53■■□□□ 1.04
PITX3-202ENST00000539804 NR1H2P55055 460 aa21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms