RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530120.5

CSRP1-213, Transcript of cysteine and glycine rich protein 1, human

TSL 4

Gene CSRP1, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSRP1-213	ENST00000530120	IL23R	Q5VWK5	629 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CSRP1-213	ENST00000530120	DHDDS	Q86SQ9	333 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CSRP1-213	ENST00000530120	P2RY8	Q86VZ1	359 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CSRP1-213	ENST00000530120	TUSC5	Q8IXB3	177 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CSRP1-213	ENST00000530120	PGAM4	Q8N0Y7	254 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CSRP1-213	ENST00000530120	ROBO4	Q8WZ75	1007 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CSRP1-213	ENST00000530120	AKAP1	Q92667	903 aa	Known RBP eCLIP	10.63	□□□□□ -0.71
CSRP1-213	ENST00000530120	TUBGCP3	Q96CW5	907 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CSRP1-213	ENST00000530120	OTUB1	Q96FW1	271 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
CSRP1-213	ENST00000530120	MAEL	Q96JY0	434 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
CSRP1-213	ENST00000530120	CLPTM1L	Q96KA5	538 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CSRP1-213	ENST00000530120	OR7D2	Q96RA2	312 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CSRP1-213	ENST00000530120	OR52B2	Q96RD2	323 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CSRP1-213	ENST00000530120	PSD2	Q9BQI7	771 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CSRP1-213	ENST00000530120	C1orf50	Q9BV19	199 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CSRP1-213	ENST00000530120	GRIP2	Q9C0E4	1043 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CSRP1-213	ENST00000530120	ZNF350	Q9GZX5	532 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CSRP1-213	ENST00000530120	SERINC1	Q9NRX5	453 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CSRP1-213	ENST00000530120	EXD2	Q9NVH0	621 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CSRP1-213	ENST00000530120	FAIM	Q9NVQ4	179 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CSRP1-213	ENST00000530120	EMC3	Q9P0I2	261 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CSRP1-213	ENST00000530120	PCNX3	Q9H6A9	2034 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CSRP1-213	ENST00000530120	MAGEA13P	A6NCF6	341 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CSRP1-213	ENST00000530120	SERINC4	A6NH21	518 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CSRP1-213	ENST00000530120	OVOL3	O00110	214 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CSRP1-213	ENST00000530120	ANKRD28	O15084	1053 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CSRP1-213	ENST00000530120	CFLAR	O15519	480 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CSRP1-213	ENST00000530120	DNPH1	O43598	174 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CSRP1-213	ENST00000530120	CYTIP	O60759	359 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CSRP1-213	ENST00000530120	SKAP2	O75563	359 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
CSRP1-213	ENST00000530120	OPN1LW	P04000	364 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CSRP1-213	ENST00000530120	PGC	P20142	388 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CSRP1-213	ENST00000530120	ENPP1	P22413	925 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CSRP1-213	ENST00000530120	SHC1	P29353	583 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CSRP1-213	ENST00000530120	SOAT1	P35610	550 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CSRP1-213	ENST00000530120	ACVR1B	P36896	505 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CSRP1-213	ENST00000530120	CCR4	P51679	360 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CSRP1-213	ENST00000530120	CLDN8	P56748	225 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CSRP1-213	ENST00000530120	HBA1	P69905	142 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CSRP1-213	ENST00000530120	IRX1	P78414	480 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
CSRP1-213	ENST00000530120	TXNL4A	P83876	142 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
CSRP1-213	ENST00000530120	EMX2	Q04743	252 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CSRP1-213	ENST00000530120	SKP2	Q13309	424 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CSRP1-213	ENST00000530120	CYLC2	Q14093	348 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
CSRP1-213	ENST00000530120	CCNI	Q14094	377 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CSRP1-213	ENST00000530120	SQLE	Q14534	574 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CSRP1-213	ENST00000530120	QPRT	Q15274	297 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CSRP1-213	ENST00000530120	TAB1	Q15750	504 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CSRP1-213	ENST00000530120	ZNF141	Q15928	474 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CSRP1-213	ENST00000530120	DPY19L1	Q2PZI1	675 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CSRP1-213	ENST00000530120	ZFP1	Q6P2D0	407 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CSRP1-213	ENST00000530120	EIF3M	Q7L2H7	374 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
CSRP1-213	ENST00000530120	SNX32	Q86XE0	403 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CSRP1-213	ENST00000530120	ZNF614	Q8N883	585 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CSRP1-213	ENST00000530120	VPS37A	Q8NEZ2	397 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CSRP1-213	ENST00000530120	OR8J2	Q8NGG1	315 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CSRP1-213	ENST00000530120	AGR3	Q8TD06	166 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CSRP1-213	ENST00000530120	MIPOL1	Q8TD10	442 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CSRP1-213	ENST00000530120	RADIL	Q96JH8	1075 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CSRP1-213	ENST00000530120	SDF2	Q99470	211 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CSRP1-213	ENST00000530120	ECSIT	Q9BQ95	431 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CSRP1-213	ENST00000530120	LAT2	Q9GZY6	243 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CSRP1-213	ENST00000530120	BARX1	Q9HBU1	254 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
CSRP1-213	ENST00000530120	LPAR3	Q9UBY5	353 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CSRP1-213	ENST00000530120	SCOC	Q9UIL1	159 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CSRP1-213	ENST00000530120	PCDHGB4	Q9UN71	923 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CSRP1-213	ENST00000530120	POMP	Q9Y244	141 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CSRP1-213	ENST00000530120	SLC35A3	Q9Y2D2	325 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CSRP1-213	ENST00000530120	RNF103-CHMP3	A0A140T963	221 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CSRP1-213	ENST00000530120	SDHD	O14521	159 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CSRP1-213	ENST00000530120	CASQ2	O14958	399 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
CSRP1-213	ENST00000530120	EFNA2	O43921	213 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CSRP1-213	ENST00000530120	KIAA0513	O60268	411 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CSRP1-213	ENST00000530120	BAG2	O95816	211 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CSRP1-213	ENST00000530120	PLAU	P00749	431 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CSRP1-213	ENST00000530120	G6PD	P11413	515 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CSRP1-213	ENST00000530120	COX5A	P20674	150 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CSRP1-213	ENST00000530120	NUDT2	P50583	147 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CSRP1-213	ENST00000530120	ATP4B	P51164	291 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CSRP1-213	ENST00000530120	RUNX1T1	Q06455	604 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CSRP1-213	ENST00000530120	RASGEF1B	Q0VAM2	473 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CSRP1-213	ENST00000530120	PDK3	Q15120	406 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CSRP1-213	ENST00000530120	ARHGAP11B	Q3KRB8	267 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CSRP1-213	ENST00000530120	ZNF672	Q499Z4	452 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
CSRP1-213	ENST00000530120	TIMM23B	Q5SRD1	257 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CSRP1-213	ENST00000530120	PDZK1	Q5T2W1	519 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CSRP1-213	ENST00000530120	C6orf52	Q5T4I8	152 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CSRP1-213	ENST00000530120	C1QTNF12	Q5T7M4	302 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CSRP1-213	ENST00000530120	ATAD3B	Q5T9A4	648 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CSRP1-213	ENST00000530120	ANXA8L1	Q5VT79	327 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CSRP1-213	ENST00000530120	AP1AR	Q63HQ0	302 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CSRP1-213	ENST00000530120	ABLIM2	Q6H8Q1	611 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CSRP1-213	ENST00000530120	BHLHA15	Q7RTS1	189 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
CSRP1-213	ENST00000530120	C16orf62	Q7Z3J2	963 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CSRP1-213	ENST00000530120	NUFIP2	Q7Z417	695 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
CSRP1-213	ENST00000530120	GALNT5	Q7Z7M9	940 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CSRP1-213	ENST00000530120	KRTCAP2	Q8N6L1	136 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CSRP1-213	ENST00000530120	FAM71C	Q8NEG0	241 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CSRP1-213	ENST00000530120	MUCL1	Q96DR8	90 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CSRP1-213	ENST00000530120	ZHX1-C8orf76	Q96EF9	292 aa		10.61	□□□□□ -0.71

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