RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524325.5

TSNARE1-208, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-208ENST00000524325 SMIM11AP58511 58 aa20.49■□□□□ 0.87
TSNARE1-208ENST00000524325 SRYQ05066 204 aa20.49■□□□□ 0.87
TSNARE1-208ENST00000524325 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
TSNARE1-208ENST00000524325 NFATC3Q12968 1075 aa20.49■□□□□ 0.87
TSNARE1-208ENST00000524325 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM180AQ6UWF9 173 aa20.49■□□□□ 0.87
TSNARE1-208ENST00000524325 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
TSNARE1-208ENST00000524325 MPP4Q96JB8 637 aa20.49■□□□□ 0.87
TSNARE1-208ENST00000524325 GPA33Q99795 319 aa20.49■□□□□ 0.87
TSNARE1-208ENST00000524325 BMP7P18075 431 aa20.48■□□□□ 0.87
TSNARE1-208ENST00000524325 ADH6P28332 368 aa20.48■□□□□ 0.87
TSNARE1-208ENST00000524325 STK32CQ86UX6 486 aa20.48■□□□□ 0.87
TSNARE1-208ENST00000524325 NEIL3Q8TAT5 605 aa20.48■□□□□ 0.87
TSNARE1-208ENST00000524325 NR4A3Q92570 626 aa20.48■□□□□ 0.87
TSNARE1-208ENST00000524325 ASF1BQ9NVP2 202 aa20.48■□□□□ 0.87
TSNARE1-208ENST00000524325 QPCTLQ9NXS2 382 aa20.48■□□□□ 0.87
TSNARE1-208ENST00000524325 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
TSNARE1-208ENST00000524325 STOML1Q9UBI4 398 aa20.48■□□□□ 0.87
TSNARE1-208ENST00000524325 CCNB2O95067 398 aa20.48■□□□□ 0.87
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF17P17021 662 aa20.48■□□□□ 0.87
TSNARE1-208ENST00000524325 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
TSNARE1-208ENST00000524325 FPR1P21462 350 aa20.48■□□□□ 0.87
TSNARE1-208ENST00000524325 GPR4P46093 362 aa20.48■□□□□ 0.87
TSNARE1-208ENST00000524325 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
TSNARE1-208ENST00000524325 MLLT10P55197 1068 aa20.48■□□□□ 0.87
TSNARE1-208ENST00000524325 RIPK1Q13546 671 aa20.48■□□□□ 0.87
TSNARE1-208ENST00000524325 TRIP10Q15642 601 aa20.48■□□□□ 0.87
TSNARE1-208ENST00000524325 MICAQ29983 383 aa20.48■□□□□ 0.87
TSNARE1-208ENST00000524325 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
TSNARE1-208ENST00000524325 SYT14P1Q58G82 188 aa20.48■□□□□ 0.87
TSNARE1-208ENST00000524325 ZER1Q7Z7L7 766 aa20.48■□□□□ 0.87
TSNARE1-208ENST00000524325 TAAR8Q969N4 342 aa20.48■□□□□ 0.87
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
TSNARE1-208ENST00000524325 OR5B2Q96R09 309 aa20.48■□□□□ 0.87
TSNARE1-208ENST00000524325 SMURF2Q9HAU4 748 aa20.48■□□□□ 0.87
TSNARE1-208ENST00000524325 SERINC1Q9NRX5 453 aa20.48■□□□□ 0.87
TSNARE1-208ENST00000524325 G3V2T6 193 aa20.47■□□□□ 0.87
TSNARE1-208ENST00000524325 GASTP01350 101 aa20.47■□□□□ 0.87
TSNARE1-208ENST00000524325 PEX2P28328 305 aa20.47■□□□□ 0.87
TSNARE1-208ENST00000524325 CLDN15P56746 228 aa20.47■□□□□ 0.87
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC34A1Q06495 639 aa20.47■□□□□ 0.87
TSNARE1-208ENST00000524325 SELENBP1Q13228 472 aa20.47■□□□□ 0.87
TSNARE1-208ENST00000524325 C3orf33Q6P1S2 294 aa20.47■□□□□ 0.87
TSNARE1-208ENST00000524325 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
TSNARE1-208ENST00000524325 PLXDC2Q6UX71 529 aa20.47■□□□□ 0.87
TSNARE1-208ENST00000524325 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa20.47■□□□□ 0.87
TSNARE1-208ENST00000524325 LRRC17Q8N6Y2 441 aa20.47■□□□□ 0.87
TSNARE1-208ENST00000524325 OR10G2Q8NGC3 310 aa20.47■□□□□ 0.87
TSNARE1-208ENST00000524325 C12orf10Q9HB07 376 aa20.47■□□□□ 0.87
TSNARE1-208ENST00000524325 MED31Q9Y3C7 131 aa20.47■□□□□ 0.87
TSNARE1-208ENST00000524325 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa20.47■□□□□ 0.87
TSNARE1-208ENST00000524325 FREM3P0C091 2139 aa20.47■□□□□ 0.87
TSNARE1-208ENST00000524325 ENO4A6NNW6 628 aa20.46■□□□□ 0.87
TSNARE1-208ENST00000524325 TTLL8A6PVC2 850 aa20.46■□□□□ 0.87
TSNARE1-208ENST00000524325 A8MVM7 634 aa20.46■□□□□ 0.87
TSNARE1-208ENST00000524325 SFTPCP11686 197 aa20.46■□□□□ 0.87
TSNARE1-208ENST00000524325 IFI30P13284 250 aa20.46■□□□□ 0.87
TSNARE1-208ENST00000524325 MAKP20794 623 aa20.46■□□□□ 0.87
TSNARE1-208ENST00000524325 LTBQ06643 244 aa20.46■□□□□ 0.87
TSNARE1-208ENST00000524325 INAQ16352 499 aa20.46■□□□□ 0.87
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
TSNARE1-208ENST00000524325 RRM2BQ7LG56 351 aa20.46■□□□□ 0.87
TSNARE1-208ENST00000524325 C10orf53Q8N6V4 93 aa20.46■□□□□ 0.87
TSNARE1-208ENST00000524325 AQP11Q8NBQ7 271 aa20.46■□□□□ 0.87
TSNARE1-208ENST00000524325 OR5K1Q8NHB7 308 aa20.46■□□□□ 0.87
TSNARE1-208ENST00000524325 GIPC3Q8TF64 312 aa20.46■□□□□ 0.87
TSNARE1-208ENST00000524325 NRG4Q8WWG1 115 aa20.46■□□□□ 0.87
TSNARE1-208ENST00000524325 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
TSNARE1-208ENST00000524325 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC25A36Q96CQ1 311 aa20.46■□□□□ 0.87
TSNARE1-208ENST00000524325 MOGAT1Q96PD6 335 aa20.46■□□□□ 0.87
TSNARE1-208ENST00000524325 FEVQ99581 238 aa20.46■□□□□ 0.87
TSNARE1-208ENST00000524325 PTDSS2Q9BVG9 487 aa20.46■□□□□ 0.87
TSNARE1-208ENST00000524325 ANKRD19PQ9H560 264 aa20.46■□□□□ 0.87
TSNARE1-208ENST00000524325 KALRNO60229 2985 aa20.46■□□□□ 0.87
TSNARE1-208ENST00000524325 A0A1B0GTH9 108 aa20.46■□□□□ 0.87
TSNARE1-208ENST00000524325 TNFSF11O14788 317 aa20.46■□□□□ 0.87
TSNARE1-208ENST00000524325 CH25HO95992 272 aa20.46■□□□□ 0.87
TSNARE1-208ENST00000524325 CRYABP02511 175 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
TSNARE1-208ENST00000524325 KLK2P20151 261 aa20.46■□□□□ 0.87
TSNARE1-208ENST00000524325 LHX2P50458 406 aa20.46■□□□□ 0.87
TSNARE1-208ENST00000524325 RAC1P63000 192 aa20.46■□□□□ 0.87
TSNARE1-208ENST00000524325 GXYLT1Q4G148 440 aa20.46■□□□□ 0.87
TSNARE1-208ENST00000524325 C1orf140Q5VVS0 124 aa20.46■□□□□ 0.87
TSNARE1-208ENST00000524325 PGBD2Q6P3X8 592 aa20.46■□□□□ 0.87
TSNARE1-208ENST00000524325 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa20.46■□□□□ 0.87
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC29A1Q99808 456 aa20.46■□□□□ 0.87
TSNARE1-208ENST00000524325 SEC14L4Q9UDX3 406 aa20.46■□□□□ 0.87
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF407Q9C0G0 2248 aa20.46■□□□□ 0.87
TSNARE1-208ENST00000524325 A0A0J9YW62 118 aa20.45■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 SOCS2O14508 198 aa20.45■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 NPIPB7O75200 414 aa20.45■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 MYBPHQ13203 477 aa20.45■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 GGNQ86UU5 652 aa20.45■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 CBR4Q8N4T8 237 aa20.45■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 FAR1Q8WVX9 515 aa20.45■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 HS6ST2Q96MM7 605 aa20.45■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa20.45■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 TMEM43Q9BTV4 400 aa20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.6 ms