RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504971.1

FBXO38-208, Transcript of F-box protein 38, human

TSL 3

Gene FBXO38, Length 492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FBXO38-208	ENST00000504971	EBF3	Q9H4W6	596 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	UGT1A7	Q9HAW7	530 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	UGT1A10	Q9HAW8	530 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	UGT1A8	Q9HAW9	530 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	IL1RL2	Q9HB29	575 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	EML4	Q9HC35	981 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	LYRM4	Q9HD34	91 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	HMG20A	Q9NP66	347 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	TRIM36	Q9NQ86	728 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	NLE1	Q9NVX2	485 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	DUS2	Q9NX74	493 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	KCMF1	Q9P0J7	381 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	COPS7A	Q9UBW8	275 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	SLC25A13	Q9UJS0	675 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	GSTK1	Q9Y2Q3	226 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	ENTPD2	Q9Y5L3	495 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	RAI2	Q9Y5P3	530 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	MMP24	Q9Y5R2	645 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	TRAV26-1	A0A087WT03	109 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	FAM95C	A0A1B0GW59	222 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	C9orf170	A2RU37	121 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	SH2D7	A6NKC9	451 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	GJE1	A6NN92	205 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	SMLR1	H3BR10	107 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	TRAFD1	O14545	582 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	COPE	O14579	308 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	KLF11	O14901	512 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	ARPC5	O15511	151 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	EIF4EBP3	O60516	100 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	SDC3	O75056	442 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	UPK3A	O75631	287 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	VAPB	O95292	243 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	PSMG1	O95456	288 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	ALDOA	P04075	364 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	CRYGB	P07316	175 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	SYP	P08247	313 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	ADH5	P11766	374 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	FGF5	P12034	268 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF23	P17027	643 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	AMD1	P17707	334 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	CD22	P20273	847 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	ZP3	P21754	424 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	FCAR	P24071	287 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	CD6	P30203	668 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	SSTR2	P30874	369 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	RPA3	P35244	121 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	CPOX	P36551	454 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	RPS19	P39019	145 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	MRPL19	P49406	292 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	RBP2	P50120	134 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	PPT1	P50897	306 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF140	P52738	457 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	MLF1	P58340	268 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	TIRAP	P58753	221 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	IRF9	Q00978	393 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	PAX5	Q02548	391 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	RBPJ	Q06330	500 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	ZFP36L1	Q07352	338 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	BCL2L1	Q07817	233 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	DBP	Q10586	325 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	BNIP3	Q12983	259 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	SLC13A2	Q13183	592 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	BIK	Q13323	160 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	IKZF1	Q13422	519 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	SERTAD2	Q14140	314 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	UBXN2B	Q14CS0	331 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	EIF4H	Q15056	248 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	RNF151	Q2KHN1	245 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	ITPRIPL2	Q3MIP1	535 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	CDNF	Q49AH0	187 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	CARD16	Q5EG05	197 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	TCEAL5	Q5H9L2	206 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	FAM78A	Q5JUQ0	283 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	MROH9	Q5TGP6	573 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	TTC23	Q5W5X9	447 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	CES5A	Q6NT32	575 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	LETMD1	Q6P1Q0	360 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	MED27	Q6P2C8	311 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	C22orf39	Q6P5X5	142 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	PAQR3	Q6TCH7	311 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	SPESP1	Q6UW49	350 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	KYAT3	Q6YP21	454 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	DEF8	Q6ZN54	512 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	ESPNL	Q6ZVH7	1005 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	TMPRSS11F	Q6ZWK6	438 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	TMPRSS7	Q7RTY8	843 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	CLEC14A	Q86T13	490 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	ADIPOR2	Q86V24	386 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	ZC3HC1	Q86WB0	502 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	TGIF2LX	Q8IUE1	241 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	C10orf107	Q8IVU9	208 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	MFSD6L	Q8IWD5	586 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	PUSL1	Q8N0Z8	303 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	C4orf33	Q8N1A6	199 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	C12orf76	Q8N812	135 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	OR5H6	Q8NGV6	325 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	OR11L1	Q8NGX0	322 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	M1AP	Q8TC57	530 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	MRAP	Q8TCY5	172 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	C16orf78	Q8WTQ4	265 aa		6.23	□□□□□ -1.41

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