RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493436.5

SH3BP4-211, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 481 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-211ENST00000493436 EMC3Q9P0I2 261 aa14.84□□□□□ -0.03
SH3BP4-211ENST00000493436 SLAMF8Q9P0V8 285 aa14.84□□□□□ -0.03
SH3BP4-211ENST00000493436 TRAPPC4Q9Y296 219 aa14.84□□□□□ -0.03
SH3BP4-211ENST00000493436 CADP27708 2225 aa14.83□□□□□ -0.04
SH3BP4-211ENST00000493436 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa14.83□□□□□ -0.04
SH3BP4-211ENST00000493436 SASH3O75995 380 aa14.83□□□□□ -0.04
SH3BP4-211ENST00000493436 BMP2P12643 396 aa14.83□□□□□ -0.04
SH3BP4-211ENST00000493436 CD99P14209 185 aa14.83□□□□□ -0.04
SH3BP4-211ENST00000493436 EDNRAP25101 427 aa14.83□□□□□ -0.04
SH3BP4-211ENST00000493436 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
SH3BP4-211ENST00000493436 MAP2K6P52564 334 aa14.83□□□□□ -0.04
SH3BP4-211ENST00000493436 NR1H2P55055 460 aa14.83□□□□□ -0.04
SH3BP4-211ENST00000493436 COPZ1P61923 177 aa14.83□□□□□ -0.04
SH3BP4-211ENST00000493436 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
SH3BP4-211ENST00000493436 ITGADQ13349 1161 aa14.83□□□□□ -0.04
SH3BP4-211ENST00000493436 ACKR1Q16570 336 aa14.83□□□□□ -0.04
SH3BP4-211ENST00000493436 ZSWIM7Q19AV6 140 aa14.83□□□□□ -0.04
SH3BP4-211ENST00000493436 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa14.83□□□□□ -0.04
SH3BP4-211ENST00000493436 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa14.83□□□□□ -0.04
SH3BP4-211ENST00000493436 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
SH3BP4-211ENST00000493436 CCDC103Q8IW40 242 aa14.83□□□□□ -0.04
SH3BP4-211ENST00000493436 MSRB3Q8IXL7 192 aa14.83□□□□□ -0.04
SH3BP4-211ENST00000493436 ZNF100Q8IYN0 542 aa14.83□□□□□ -0.04
SH3BP4-211ENST00000493436 CADM2Q8N3J6 435 aa14.83□□□□□ -0.04
SH3BP4-211ENST00000493436 PLPPR2Q96GM1 343 aa14.83□□□□□ -0.04
SH3BP4-211ENST00000493436 SPATA9Q9BWV2 254 aa14.83□□□□□ -0.04
SH3BP4-211ENST00000493436 BCL2L10Q9HD36 194 aa14.83□□□□□ -0.04
SH3BP4-211ENST00000493436 TMEM45AQ9NWC5 275 aa14.83□□□□□ -0.04
SH3BP4-211ENST00000493436 PRDM4Q9UKN5 801 aa14.83□□□□□ -0.04
SH3BP4-211ENST00000493436 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
SH3BP4-211ENST00000493436 IFT52Q9Y366 437 aa14.83□□□□□ -0.04
SH3BP4-211ENST00000493436 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
SH3BP4-211ENST00000493436 ZNF716A6NP11 495 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP4-211ENST00000493436 C5orf58C9J3I9 102 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP4-211ENST00000493436 GPR171O14626 319 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP4-211ENST00000493436 IMPDH2P12268 514 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP4-211ENST00000493436 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
SH3BP4-211ENST00000493436 FPR1P21462 350 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP4-211ENST00000493436 PPIBP23284 216 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
SH3BP4-211ENST00000493436 CXCR1P25024 350 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP4-211ENST00000493436 ADAM8P78325 824 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP4-211ENST00000493436 SLC35A1P78382 337 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP4-211ENST00000493436 ZNF311Q5JNZ3 666 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP4-211ENST00000493436 GCNT6Q5T4J0 391 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP4-211ENST00000493436 WBP2NLQ6ICG8 309 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP4-211ENST00000493436 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
SH3BP4-211ENST00000493436 BBS10Q8TAM1 723 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP4-211ENST00000493436 TMUB1Q9BVT8 246 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP4-211ENST00000493436 RABEP2Q9H5N1 569 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP4-211ENST00000493436 VAPAQ9P0L0 249 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP4-211ENST00000493436 CHST2Q9Y4C5 530 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP4-211ENST00000493436 ACANP16112 2415 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP4-211ENST00000493436 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4-211ENST00000493436 RAMP1O60894 148 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4-211ENST00000493436 LYZL6O75951 148 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4-211ENST00000493436 PGM3O95394 542 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4-211ENST00000493436 ARAFP10398 606 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4-211ENST00000493436 PRG2P13727 222 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4-211ENST00000493436 SLC16A1P53985 500 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4-211ENST00000493436 H3F3AP84243 136 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4-211ENST00000493436 TAB1Q15750 504 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4-211ENST00000493436 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4-211ENST00000493436 C20orf204Q6ZNR8 217 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4-211ENST00000493436 SERPINA11Q86U17 422 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4-211ENST00000493436 NFKBIDQ8NI38 313 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4-211ENST00000493436 STON2Q8WXE9 905 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4-211ENST00000493436 HSD17B8Q92506 261 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4-211ENST00000493436 PIGTQ969N2 578 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4-211ENST00000493436 CCL19Q99731 98 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4-211ENST00000493436 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4-211ENST00000493436 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4-211ENST00000493436 POTEKPQ9BYX7 375 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4-211ENST00000493436 NPHS2Q9NP85 383 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4-211ENST00000493436 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4-211ENST00000493436 DCTN4Q9UJW0 460 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4-211ENST00000493436 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP4-211ENST00000493436 A0A1W2PP18 115 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP4-211ENST00000493436 EDF1O60869 148 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
SH3BP4-211ENST00000493436 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
SH3BP4-211ENST00000493436 PLAUP00749 431 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP4-211ENST00000493436 IGHV3-9P01782 118 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP4-211ENST00000493436 IGHV1-2P23083 117 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP4-211ENST00000493436 IDUAP35475 653 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP4-211ENST00000493436 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
SH3BP4-211ENST00000493436 BNIP2Q12982 314 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP4-211ENST00000493436 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
SH3BP4-211ENST00000493436 UBE2J2Q8N2K1 259 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP4-211ENST00000493436 C10orf111Q8N326 155 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP4-211ENST00000493436 APH1AQ96BI3 265 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP4-211ENST00000493436 PIP5K1AQ99755 562 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP4-211ENST00000493436 NGBQ9NPG2 151 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP4-211ENST00000493436 CORO2BQ9UQ03 480 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP4-211ENST00000493436 GMEB1Q9Y692 573 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP4-211ENST00000493436 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
SH3BP4-211ENST00000493436 C2CD3Q4AC94 2353 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP4-211ENST00000493436 EVPLLA8MZ36 301 aa14.79□□□□□ -0.04
SH3BP4-211ENST00000493436 FRS3O43559 492 aa14.79□□□□□ -0.04
SH3BP4-211ENST00000493436 SMPD2O60906 423 aa14.79□□□□□ -0.04
SH3BP4-211ENST00000493436 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
SH3BP4-211ENST00000493436 GPIP06744 558 aa14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms