RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490813.5

CEP170-216, Transcript of centrosomal protein 170, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene CEP170, Length 1,070 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CEP170-216	ENST00000490813	MYO1G	B0I1T2	1018 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	PPIAL4D	F5H284	164 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	GTPBP1	O00178	669 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	SULT2B1	O00204	365 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	UPK1A	O00322	258 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	ANKRD28	O15084	1053 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	PDPK1	O15530	556 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	SYNGR3	O43761	229 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	EIF4E2	O60573	245 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	EIF1B	O60739	113 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	NKX2-2	O95096	273 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	MPZL1	O95297	269 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	PSMG1	O95456	288 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	KRT6A	P02538	564 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	KRT6B	P04259	564 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	CRYBA1	P05813	215 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	GSN	P06396	782 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	NUDT17	P0C025	328 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	PPIAL4F	P0DN26	164 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	PRPS2	P11908	318 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	TSPAN8	P19075	237 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	MTNR1A	P48039	350 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	KRT6C	P48668	564 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	NCBP2	P52298	156 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	SLC16A1	P53985	500 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	UBE2N	P61088	152 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	LMO4	P61968	165 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	TEK	Q02763	1124 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	ACSM2A	Q08AH3	577 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	ZP4	Q12836	540 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	FOXF1	Q12946	379 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	BAMBI	Q13145	260 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	TRIP10	Q15642	601 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	PFKFB4	Q16877	469 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	FAM209A	Q5JX71	171 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	GRTP1	Q5TC63	336 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	FAM205BP	Q63HN1	556 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	ACSM2B	Q68CK6	577 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	ABLIM2	Q6H8Q1	611 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	TTC27	Q6P3X3	843 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	APOOL	Q6UXV4	268 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	SYT10	Q6XYQ8	523 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	SPATA21	Q7Z572	469 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	RIBC1	Q8N443	379 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	C1orf52	Q8N6N3	182 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	OR4F5	Q8NH21	305 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	OR4C3	Q8NH37	302 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	PHOSPHO1	Q8TCT1	267 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	MAGEE2	Q8TD90	523 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	CKAP2	Q8WWK9	683 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	TMEM234	Q8WY98	164 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	ZNF75CP	Q92670	426 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	EXOSC8	Q96B26	276 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	ANAPC16	Q96DE5	110 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	ELP4	Q96EB1	424 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	SH3YL1	Q96HL8	342 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	OR5B2	Q96R09	309 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	ZNF300	Q96RE9	604 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	DIRC2	Q96SL1	478 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	RBBP8	Q99708	897 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	DESI2	Q9BSY9	194 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	SERHL2	Q9H4I8	314 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	ZNF385D	Q9H6B1	395 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	NOL11	Q9H8H0	719 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	PLAC1	Q9HBJ0	212 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	LPAR2	Q9HBW0	351 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	MIEF1	Q9NQG6	463 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	ACSS1	Q9NUB1	689 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	TMEM45A	Q9NWC5	275 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	TAS2R7	Q9NYW3	318 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	SLC9A8	Q9Y2E8	581 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	CMAHP	Q9Y471	501 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	TENM3	Q9P273	2699 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	IGHV3-15	A0A0B4J1V0	119 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813		C9JVG2	144 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813		M0R233	179 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	PDLIM1	O00151	329 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	ETV2	O00321	342 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	PCDH7	O60245	1069 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	SLU7	O95391	586 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	PMS2P2	O95744	297 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	OTC	P00480	354 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	IGHV3-9	P01782	118 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	JUN	P05412	331 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	ITGA5	P08648	1049 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	IL3	P08700	152 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	PRKCA	P17252	672 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	DDC	P20711	480 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	ATP6V1C1	P21283	382 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	PRIM2	P49643	509 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	DIO1	P49895	249 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	ATP4B	P51164	291 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	ZNF75D	P51815	510 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	RPL15	P61313	204 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	RPS23	P62266	143 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	NAAA	Q02083	359 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	GALNT1	Q10472	559 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	CBFB	Q13951	182 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	HLX	Q14774	488 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CEP170-216	ENST00000490813	PDCD1	Q15116	288 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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