RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489247.1

ATG4A-208, Transcript of autophagy related 4A cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4A, Length 623 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4A-208ENST00000489247 ZNF730Q6ZMV8 503 aa5.08□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 WDR88Q6ZMY6 472 aa5.08□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 PTCHD4Q6ZW05 846 aa5.08□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 AHSA2Q719I0 299 aa5.08□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa5.08□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 P2RY8Q86VZ1 359 aa5.08□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 C1orf210Q8IVY1 113 aa5.08□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 NRMQ8IXM6 262 aa5.08□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 GPR135Q8IZ08 494 aa5.08□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 BCORP1Q8N888 145 aa5.08□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 PROKR2Q8NFJ6 384 aa5.08□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 OR8D4Q8NGM9 314 aa5.08□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 TEX47Q8TBZ9 253 aa5.08□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 TMEM163Q8TC26 289 aa5.08□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 ZNF721Q8TF20 911 aa5.08□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 RNF138Q8WVD3 245 aa5.08□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 TMEM239Q8WW34 195 aa5.08□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 LIPHQ8WWY8 451 aa5.08□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 ADIPOR1Q96A54 375 aa5.08□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 VMP1Q96GC9 406 aa5.08□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 LRFN5Q96NI6 719 aa5.08□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 FOXB1Q99853 325 aa5.08□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 NUDT22Q9BRQ3 303 aa5.08□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 NDC1Q9BTX1 674 aa5.08□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 TAPBPLQ9BX59 468 aa5.08□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 ITPAQ9BY32 194 aa5.08□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa5.08□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 SLC19A3Q9BZV2 496 aa5.08□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 SEMA4CQ9C0C4 833 aa5.08□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 SLC26A1Q9H2B4 701 aa5.08□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 FN3KQ9H479 309 aa5.08□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 SIAEQ9HAT2 523 aa5.08□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 C12orf10Q9HB07 376 aa5.08□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 ZNF304Q9HCX3 659 aa5.08□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 ISYNA1Q9NPH2 558 aa5.08□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 SLC22A11Q9NSA0 550 aa5.08□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 FGF21Q9NSA1 209 aa5.08□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 GALNT8Q9NY28 637 aa5.08□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 GPR83Q9NYM4 423 aa5.08□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 FLRT3Q9NZU0 649 aa5.08□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 AASSQ9UDR5 926 aa5.08□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 ICAM5Q9UMF0 924 aa5.08□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 BAIAP2Q9UQB8 552 aa5.08□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 ERVK-19Q9WJR5 959 aa5.08□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 DTX4Q9Y2E6 619 aa5.08□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 A3GALT2U3KPV4 340 aa5.08□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 EYSQ5T1H1 3165 aa5.08□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa5.07□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 A0A1B0GWA3 101 aa5.07□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 A0A1W2PQM1 296 aa5.07□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 TMEM129A0AVI4 362 aa5.07□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 SNTNA6NMZ2 147 aa5.07□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 C17orf105B2RV13 164 aa5.07□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 H3BN98 237 aa5.07□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 J3QRE1 110 aa5.07□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 BHLHE40O14503 412 aa5.07□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 CDC42EP2O14613 210 aa5.07□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 SURF4O15260 269 aa5.07□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 PRKYO43930 277 aa5.07□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 TSPAN2O60636 221 aa5.07□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 SOX14O95416 240 aa5.07□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 CER1O95813 267 aa5.07□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 FADS2O95864 444 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 PTHP01270 115 aa5.07□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 LCKP06239 509 aa5.07□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 ADRA2AP08913 450 aa5.07□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 HBQ1P09105 142 aa5.07□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 GAAP10253 952 aa5.07□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 DBTP11182 482 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 CDK4P11802 303 aa5.07□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 FGF5P12034 268 aa5.07□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 CKMT1AP12532 417 aa5.07□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 TNNI3P19429 210 aa5.07□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 ENPP1P22413 925 aa5.07□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 POU1F1P28069 291 aa5.07□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP5.07□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 LIPAP38571 399 aa5.07□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 PEX19P40855 299 aa5.07□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 DLX5P56178 289 aa5.07□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 FXYD6P3P58550 94 aa5.07□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 TUBA1BP68363 451 aa5.07□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 RAB40BQ12829 278 aa5.07□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 SKP2Q13309 424 aa5.07□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 FHL1Q13642 323 aa5.07□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 EBPQ15125 230 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 MOGQ16653 247 aa5.07□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 TIGD6Q17RP2 521 aa5.07□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 AMZ1Q400G9 498 aa5.07□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 KLHL22Q53GT1 634 aa5.07□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 PRR31Q5SQ13 230 aa5.07□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 ARMC4Q5T2S8 1044 aa5.07□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 PDZK1Q5T2W1 519 aa5.07□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms