RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485459.5

RABGGTB-210, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 788 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-210ENST00000485459 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 ERVV-1B6SEH8 477 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 WWP2O00308 870 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 MRASO14807 208 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 CHMP2AO43633 222 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 SMPD2O60906 423 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 LRCH4O75427 683 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 LYPLA2O95372 231 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 CLDN1O95832 211 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 C1QAP02745 245 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 MT-ND2P03891 347 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 IL6P05231 212 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 S100A9P06702 114 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 GPIP06744 558 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 HEXBP07686 556 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 ACSM4P0C7M7 580 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 CSH1P0DML2 217 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 CSH2P0DML3 217 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 PSMA2P25787 234 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 S100PP25815 95 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 ACSL1P33121 698 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 TGFBR1P36897 503 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 TGFBR2P37173 567 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 ETV6P41212 452 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 EIF1P41567 113 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 GCLMP48507 274 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 POU3F4P49335 361 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 SLC7A2P52569 658 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 NAPAP54920 295 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 SLC12A3P55017 1021 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 HERVK_113P63132 956 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 CD47Q08722 323 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 STX5Q13190 355 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 GRB7Q14451 532 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 GRK1Q15835 563 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 HLA-BQ31612 363 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 CBWD6Q4V339 395 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 FBXO48Q5FWF7 155 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 XKR3Q5GH77 459 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 ARMCX4Q5H9R4 360 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 RAB41Q5JT25 222 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 CBWD3Q5JTY5 395 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 TEX30Q5JUR7 227 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 GLRA4Q5JXX5 417 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 SPANXN2Q5MJ10 180 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 LIN9Q5TKA1 542 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 SEL1L3Q68CR1 1132 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 GLYATQ6IB77 296 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 TBPL2Q6SJ96 375 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 TEX261Q6UWH6 196 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 HACD2Q6Y1H2 254 aa3.62□□□□□ -1.83
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RABGGTB-210ENST00000485459 DEFB132Q7Z7B7 95 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 SYVN1Q86TM6 617 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 SLC47A2Q86VL8 602 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 HOGA1Q86XE5 327 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 MCOLN2Q8IZK6 566 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 CLEC4FQ8N1N0 589 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 STX19Q8N4C7 294 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 GDPD1Q8N9F7 314 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF555Q8NEP9 628 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 OR5AP2Q8NGF4 316 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF461Q8TAF7 563 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 TBCKQ8TEA7 893 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 CCDC107Q8WV48 283 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 SLC13A3Q8WWT9 602 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 NSMAFQ92636 917 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 SLC38A4Q969I6 547 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 MYLPFQ96A32 169 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 C19orf60Q96EN9 201 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 PPP1R36Q96LQ0 422 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 HYLS1Q96M11 299 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 ZBTB18Q99592 522 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 TXN2Q99757 166 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF251Q9BRH9 671 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 FAM213AQ9BRX8 229 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 MND1Q9BWT6 205 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 RNF121Q9H920 327 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 CAB39LQ9H9S4 337 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 TBC1D17Q9HA65 648 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 C6orf50Q9HD87 102 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 UFSP2Q9NUQ7 469 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 DNAJC11Q9NVH1 559 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 MCUBQ9NWR8 336 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 RDH8Q9NYR8 311 aa3.62□□□□□ -1.83
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