RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 MCCC2Q9HCC0 563 aa18.67■□□□□ 0.58
ACTB-211ENST00000480301 ELOVL5Q9NYP7 299 aa18.67■□□□□ 0.58
ACTB-211ENST00000480301 KLHL13Q9P2N7 655 aa18.67■□□□□ 0.58
ACTB-211ENST00000480301 TRAPPC4Q9Y296 219 aa18.67■□□□□ 0.58
ACTB-211ENST00000480301 M0QX08 132 aa18.66■□□□□ 0.58
ACTB-211ENST00000480301 SNX3O60493 162 aa18.66■□□□□ 0.58
ACTB-211ENST00000480301 FESP07332 822 aa18.66■□□□□ 0.58
ACTB-211ENST00000480301 YES1P07947 543 aa18.66■□□□□ 0.58
ACTB-211ENST00000480301 IMPDH2P12268 514 aa18.66■□□□□ 0.58
ACTB-211ENST00000480301 COX4I1P13073 169 aa18.66■□□□□ 0.58
ACTB-211ENST00000480301 CXCR1P25024 350 aa18.66■□□□□ 0.58
ACTB-211ENST00000480301 PCGF2P35227 344 aa18.66■□□□□ 0.58
ACTB-211ENST00000480301 GNGT1P63211 74 aa18.66■□□□□ 0.58
ACTB-211ENST00000480301 VMACQ2NL98 169 aa18.66■□□□□ 0.58
ACTB-211ENST00000480301 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP18.66■□□□□ 0.58
ACTB-211ENST00000480301 TREML1Q86YW5 311 aa18.66■□□□□ 0.58
ACTB-211ENST00000480301 FAM222BQ8WU58 562 aa18.66■□□□□ 0.58
ACTB-211ENST00000480301 WFDC6Q9BQY6 131 aa18.66■□□□□ 0.58
ACTB-211ENST00000480301 MYLK2Q9H1R3 596 aa18.66■□□□□ 0.58
ACTB-211ENST00000480301 PIF1Q9H611 641 aa18.66■□□□□ 0.58
ACTB-211ENST00000480301 BCO1Q9HAY6 547 aa18.66■□□□□ 0.58
ACTB-211ENST00000480301 GID8Q9NWU2 228 aa18.66■□□□□ 0.58
ACTB-211ENST00000480301 TMEM181Q9P2C4 612 aa18.66■□□□□ 0.58
ACTB-211ENST00000480301 HTR2AP28223 471 aa18.65■□□□□ 0.58
ACTB-211ENST00000480301 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa18.65■□□□□ 0.58
ACTB-211ENST00000480301 BNIP2Q12982 314 aa18.65■□□□□ 0.58
ACTB-211ENST00000480301 TMEM201Q5SNT2 666 aa18.65■□□□□ 0.58
ACTB-211ENST00000480301 CPLX4Q7Z7G2 160 aa18.65■□□□□ 0.58
ACTB-211ENST00000480301 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP18.65■□□□□ 0.58
ACTB-211ENST00000480301 SLC30A8Q8IWU4 369 aa18.65■□□□□ 0.58
ACTB-211ENST00000480301 SMYD1Q8NB12 490 aa18.65■□□□□ 0.58
ACTB-211ENST00000480301 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP18.65■□□□□ 0.58
ACTB-211ENST00000480301 LURAP1Q96LR2 239 aa18.65■□□□□ 0.58
ACTB-211ENST00000480301 ZNF583Q96ND8 569 aa18.65■□□□□ 0.58
ACTB-211ENST00000480301 ECSITQ9BQ95 431 aa18.65■□□□□ 0.58
ACTB-211ENST00000480301 PRR14Q9BWN1 585 aa18.65■□□□□ 0.58
ACTB-211ENST00000480301 POTEKPQ9BYX7 375 aa18.65■□□□□ 0.58
ACTB-211ENST00000480301 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP18.65■□□□□ 0.58
ACTB-211ENST00000480301 KLHL9Q9P2J3 617 aa18.65■□□□□ 0.58
ACTB-211ENST00000480301 MPDZO75970 2070 aa18.65■□□□□ 0.58
ACTB-211ENST00000480301 FBN2P35556 2912 aa18.65■□□□□ 0.58
ACTB-211ENST00000480301 FAM221AA4D161 298 aa18.64■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 ZNF814B7Z6K7 855 aa18.64■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 DNPH1O43598 174 aa18.64■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 OPN1SWP03999 348 aa18.64■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 EPXP11678 715 aa18.64■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 POU2F1P14859 743 aa18.64■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 OR2B6P58173 313 aa18.64■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 DUSP7Q16829 419 aa18.64■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa18.64■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP18.64■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 LSMEM1Q8N8F7 131 aa18.64■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 GPR32P1Q8NGA4 272 aa18.64■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 C12orf49Q9H741 205 aa18.64■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 USP22Q9UPT9 525 aa18.64■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 ZNF724A8MTY0 619 aa18.63■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 TMEM229AB2RXF0 380 aa18.63■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 TPST2O60704 377 aa18.63■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 NPIPB7O75200 414 aa18.63■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 KCNJ5P48544 419 aa18.63■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 H3F3AP84243 136 aa18.63■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP18.63■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 PDK3Q15120 406 aa18.63■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 CCDC80Q76M96 950 aa18.63■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP18.63■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 TAMM41Q96BW9 452 aa18.63■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa18.63■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 DACH2Q96NX9 599 aa18.63■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP18.63■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP18.63■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP18.63■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 APCP25054 2843 aa18.62■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa18.62■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 A0A1B0GWA3 101 aa18.62■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 ZNF716A6NP11 495 aa18.62■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 A8MVM7 634 aa18.62■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 RAMP1O60894 148 aa18.62■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 CTAG2O75638 210 aa18.62■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 LGI1O95970 557 aa18.62■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 CD247P20963 164 aa18.62■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 FPR1P21462 350 aa18.62■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 CCKARP32238 428 aa18.62■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 UGT2B10P36537 528 aa18.62■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 CRYBA2P53672 197 aa18.62■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP18.62■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 SLC35A1P78382 337 aa18.62■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa18.62■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP18.62■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 TFAP2EQ6VUC0 442 aa18.62■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 PIGWQ7Z7B1 504 aa18.62■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 CCDC103Q8IW40 242 aa18.62■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 OR52E4Q8NGH9 312 aa18.62■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 ARHGDIGQ99819 225 aa18.62■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 TRIM2Q9C040 744 aa18.62■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 EVA1AQ9H8M9 152 aa18.62■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 C12orf10Q9HB07 376 aa18.62■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 CMTM6Q9NX76 183 aa18.62■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 KLHL28Q9NXS3 571 aa18.62■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa18.62■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP18.62■□□□□ 0.57
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