RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460297.1

NME4-209, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

TSL 5

Gene NME4, Length 1,652 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-209ENST00000460297 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
NME4-209ENST00000460297 ADI1Q9BV57 179 aa21.92■■□□□ 1.1
NME4-209ENST00000460297 TTTY12Q9BZ98 90 aa21.92■■□□□ 1.1
NME4-209ENST00000460297 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
NME4-209ENST00000460297 K7EM74 188 aa21.91■■□□□ 1.1
NME4-209ENST00000460297 NPIPB7O75200 414 aa21.91■■□□□ 1.1
NME4-209ENST00000460297 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
NME4-209ENST00000460297 COX10Q12887 443 aa21.91■■□□□ 1.1
NME4-209ENST00000460297 TOMM20Q15388 145 aa21.91■■□□□ 1.1
NME4-209ENST00000460297 C1QL3Q5VWW1 255 aa21.91■■□□□ 1.1
NME4-209ENST00000460297 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
NME4-209ENST00000460297 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
NME4-209ENST00000460297 GABARAPL3Q9BY60 117 aa21.91■■□□□ 1.1
NME4-209ENST00000460297 OR11A1Q9GZK7 315 aa21.91■■□□□ 1.1
NME4-209ENST00000460297 RIBC2Q9H4K1 309 aa21.91■■□□□ 1.1
NME4-209ENST00000460297 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
NME4-209ENST00000460297 TMEM5Q9Y2B1 443 aa21.91■■□□□ 1.1
NME4-209ENST00000460297 AP4B1Q9Y6B7 739 aa21.91■■□□□ 1.1
NME4-209ENST00000460297 TRAV17A0A0B4J275 112 aa21.91■■□□□ 1.1
NME4-209ENST00000460297 LRRN3E7EW58 273 aa21.91■■□□□ 1.1
NME4-209ENST00000460297 MKRN2OSH3BPM6 223 aa21.91■■□□□ 1.1
NME4-209ENST00000460297 GLSO94925 669 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
NME4-209ENST00000460297 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
NME4-209ENST00000460297 GDF1P27539 372 aa21.91■■□□□ 1.1
NME4-209ENST00000460297 NPRL3Q12980 569 aa21.91■■□□□ 1.1
NME4-209ENST00000460297 CDK20Q8IZL9 346 aa21.91■■□□□ 1.1
NME4-209ENST00000460297 ZADH2Q8N4Q0 377 aa21.91■■□□□ 1.1
NME4-209ENST00000460297 DHRSXQ8N5I4 330 aa21.91■■□□□ 1.1
NME4-209ENST00000460297 TM9SF4Q92544 642 aa21.91■■□□□ 1.1
NME4-209ENST00000460297 TFAP2CQ92754 450 aa21.91■■□□□ 1.1
NME4-209ENST00000460297 FAM118AQ9NWS6 357 aa21.91■■□□□ 1.1
NME4-209ENST00000460297 A8MVM7 634 aa21.9■■□□□ 1.1
NME4-209ENST00000460297 SOX14O95416 240 aa21.9■■□□□ 1.1
NME4-209ENST00000460297 IGF2P01344 180 aa21.9■■□□□ 1.1
NME4-209ENST00000460297 GSTM3P21266 225 aa21.9■■□□□ 1.1
NME4-209ENST00000460297 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
NME4-209ENST00000460297 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
NME4-209ENST00000460297 KIF18BQ86Y91 864 aa21.9■■□□□ 1.1
NME4-209ENST00000460297 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
NME4-209ENST00000460297 CYGBQ8WWM9 190 aa21.9■■□□□ 1.1
NME4-209ENST00000460297 TAAR8Q969N4 342 aa21.9■■□□□ 1.1
NME4-209ENST00000460297 RELTQ969Z4 430 aa21.9■■□□□ 1.1
NME4-209ENST00000460297 GRIP2Q9C0E4 1043 aa21.9■■□□□ 1.1
NME4-209ENST00000460297 RAB26Q9ULW5 256 aa21.9■■□□□ 1.1
NME4-209ENST00000460297 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
NME4-209ENST00000460297 DSPP15924 2871 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
NME4-209ENST00000460297 OR2M5A3KFT3 312 aa21.89■■□□□ 1.1
NME4-209ENST00000460297 CH25HO95992 272 aa21.89■■□□□ 1.1
NME4-209ENST00000460297 OSMP13725 252 aa21.89■■□□□ 1.1
NME4-209ENST00000460297 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.1
NME4-209ENST00000460297 B3GALT5-AS1P59052 145 aa21.89■■□□□ 1.1
NME4-209ENST00000460297 HYAL4Q2M3T9 481 aa21.89■■□□□ 1.1
NME4-209ENST00000460297 SLC36A3Q495N2 470 aa21.89■■□□□ 1.1
NME4-209ENST00000460297 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.1
NME4-209ENST00000460297 RAET1LQ5VY80 246 aa21.89■■□□□ 1.1
NME4-209ENST00000460297 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa21.89■■□□□ 1.1
NME4-209ENST00000460297 STK35Q8TDR2 534 aa21.89■■□□□ 1.1
NME4-209ENST00000460297 SGTBQ96EQ0 304 aa21.89■■□□□ 1.1
NME4-209ENST00000460297 DNAJA3Q96EY1 480 aa21.89■■□□□ 1.1
NME4-209ENST00000460297 PTDSS2Q9BVG9 487 aa21.89■■□□□ 1.1
NME4-209ENST00000460297 OR2B2Q9GZK3 357 aa21.89■■□□□ 1.1
NME4-209ENST00000460297 FAM166BA8MTA8 275 aa21.88■■□□□ 1.09
NME4-209ENST00000460297 EFCAB9A8MZ26 197 aa21.88■■□□□ 1.09
NME4-209ENST00000460297 ZNF208O43345 1280 aa21.88■■□□□ 1.09
NME4-209ENST00000460297 TRAPPC6AO75865 159 aa21.88■■□□□ 1.09
NME4-209ENST00000460297 SAGP10523 405 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
NME4-209ENST00000460297 RPS5P46782 204 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
NME4-209ENST00000460297 MAP2K6P52564 334 aa21.88■■□□□ 1.09
NME4-209ENST00000460297 PLGLB1Q02325 96 aa21.88■■□□□ 1.09
NME4-209ENST00000460297 LTBQ06643 244 aa21.88■■□□□ 1.09
NME4-209ENST00000460297 ZNF74Q16587 644 aa21.88■■□□□ 1.09
NME4-209ENST00000460297 C1orf140Q5VVS0 124 aa21.88■■□□□ 1.09
NME4-209ENST00000460297 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
NME4-209ENST00000460297 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa21.88■■□□□ 1.09
NME4-209ENST00000460297 TMEM251Q8N6I4 163 aa21.88■■□□□ 1.09
NME4-209ENST00000460297 LRRC17Q8N6Y2 441 aa21.88■■□□□ 1.09
NME4-209ENST00000460297 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa21.88■■□□□ 1.09
NME4-209ENST00000460297 OR14L1PQ8NHC6 308 aa21.88■■□□□ 1.09
NME4-209ENST00000460297 ABHD17AQ96GS6 310 aa21.88■■□□□ 1.09
NME4-209ENST00000460297 ARL5BQ96KC2 179 aa21.88■■□□□ 1.09
NME4-209ENST00000460297 MOGAT1Q96PD6 335 aa21.88■■□□□ 1.09
NME4-209ENST00000460297 B4GALT7Q9UBV7 327 aa21.88■■□□□ 1.09
NME4-209ENST00000460297 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa21.88■■□□□ 1.09
NME4-209ENST00000460297 UNC119BA6NIH7 251 aa21.88■■□□□ 1.09
NME4-209ENST00000460297 E9PQ18 207 aa21.88■■□□□ 1.09
NME4-209ENST00000460297 H3BML4 177 aa21.88■■□□□ 1.09
NME4-209ENST00000460297 CELA3AP09093 270 aa21.88■■□□□ 1.09
NME4-209ENST00000460297 GNAO1P09471 354 aa21.88■■□□□ 1.09
NME4-209ENST00000460297 PEPDP12955 493 aa21.88■■□□□ 1.09
NME4-209ENST00000460297 ZNF17P17021 662 aa21.88■■□□□ 1.09
NME4-209ENST00000460297 CHMP24386 653 aa21.88■■□□□ 1.09
NME4-209ENST00000460297 CAPGP40121 348 aa21.88■■□□□ 1.09
NME4-209ENST00000460297 MAGEA5P43359 124 aa21.88■■□□□ 1.09
NME4-209ENST00000460297 ESRRGP62508 458 aa21.88■■□□□ 1.09
NME4-209ENST00000460297 FHL1Q13642 323 aa21.88■■□□□ 1.09
NME4-209ENST00000460297 C3orf33Q6P1S2 294 aa21.88■■□□□ 1.09
NME4-209ENST00000460297 OR13C2Q8NGS9 318 aa21.88■■□□□ 1.09
NME4-209ENST00000460297 EGLN3Q9H6Z9 239 aa21.88■■□□□ 1.09
NME4-209ENST00000460297 TMEM185BQ9H7F4 350 aa21.88■■□□□ 1.09
NME4-209ENST00000460297 SERINC1Q9NRX5 453 aa21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.3 ms