RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455609.1

C9orf41-AS1-201, C9orf41 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf41-AS1, Length 719 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RABEP2Q9H5N1 569 aa13.81□□□□□ -0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 IKZF5Q9H5V7 419 aa13.81□□□□□ -0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZNF385DQ9H6B1 395 aa13.81□□□□□ -0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZNF446Q9NWS9 450 aa13.81□□□□□ -0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TMEM181Q9P2C4 612 aa13.81□□□□□ -0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP13.81□□□□□ -0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PRSS50Q9UI38 385 aa13.81□□□□□ -0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZNF232Q9UNY5 417 aa13.81□□□□□ -0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GMEB1Q9Y692 573 aa13.81□□□□□ -0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP13.81□□□□□ -0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa13.8□□□□□ -0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 A0A0G2JND7 137 aa13.8□□□□□ -0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP13.8□□□□□ -0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP13.8□□□□□ -0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZNF716A6NP11 495 aa13.8□□□□□ -0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KLF4O43474 513 aa13.8□□□□□ -0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RAMP1O60894 148 aa13.8□□□□□ -0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PGM3O95394 542 aa13.8□□□□□ -0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ADAP00813 363 aa13.8□□□□□ -0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ARAFP10398 606 aa13.8□□□□□ -0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 IMPDH2P12268 514 aa13.8□□□□□ -0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CD53P19397 219 aa13.8□□□□□ -0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 COPZ1P61923 177 aa13.8□□□□□ -0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PDK3Q15120 406 aa13.8□□□□□ -0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SFRP5Q5T4F7 317 aa13.8□□□□□ -0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 WBP2NLQ6ICG8 309 aa13.8□□□□□ -0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GALNT5Q7Z7M9 940 aa13.8□□□□□ -0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SERPINA11Q86U17 422 aa13.8□□□□□ -0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CCDC103Q8IW40 242 aa13.8□□□□□ -0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PIGXQ8TBF5 258 aa13.8□□□□□ -0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ALPK1Q96QP1 1244 aa13.8□□□□□ -0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SIKE1Q9BRV8 207 aa13.8□□□□□ -0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 HDHD5Q9BXW7 423 aa13.8□□□□□ -0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ARMC7Q9H6L4 198 aa13.8□□□□□ -0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 EMC3Q9P0I2 261 aa13.8□□□□□ -0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TRIM33Q9UPN9 1127 aa13.8□□□□□ -0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TRAPPC4Q9Y296 219 aa13.8□□□□□ -0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FREM1Q5H8C1 2179 aa13.8□□□□□ -0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ITPR3Q14573 2671 aa13.79□□□□□ -0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FRS3O43559 492 aa13.79□□□□□ -0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 IL32P24001 234 aa13.79□□□□□ -0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CXCR1P25024 350 aa13.79□□□□□ -0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MAP2K6P52564 334 aa13.79□□□□□ -0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 H3F3AP84243 136 aa13.79□□□□□ -0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 P2RY6Q15077 328 aa13.79□□□□□ -0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DEFB113Q30KQ7 82 aa13.79□□□□□ -0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 BEX5Q5H9J7 111 aa13.79□□□□□ -0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DLEU7Q6UYE1 221 aa13.79□□□□□ -0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 Q6ZT83 130 aa13.79□□□□□ -0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZNF100Q8IYN0 542 aa13.79□□□□□ -0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP13.79□□□□□ -0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP13.79□□□□□ -0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP13.79□□□□□ -0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 UBTD1Q9HAC8 227 aa13.79□□□□□ -0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP13.79□□□□□ -0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PRDM4Q9UKN5 801 aa13.79□□□□□ -0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP13.79□□□□□ -0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 VPS13CQ709C8 3753 aa13.78□□□□□ -0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 EVPLLA8MZ36 301 aa13.78□□□□□ -0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ETS2P15036 469 aa13.78□□□□□ -0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GPX2P18283 190 aa13.78□□□□□ -0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FPR1P21462 350 aa13.78□□□□□ -0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 IDUAP35475 653 aa13.78□□□□□ -0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SLC16A1P53985 500 aa13.78□□□□□ -0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SLC35A1P78382 337 aa13.78□□□□□ -0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 HOXC5Q00444 222 aa13.78□□□□□ -0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CDK6Q00534 326 aa13.78□□□□□ -0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 BNIP2Q12982 314 aa13.78□□□□□ -0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ITGADQ13349 1161 aa13.78□□□□□ -0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ALKBH2Q6NS38 261 aa13.78□□□□□ -0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 REEP3Q6NUK4 255 aa13.78□□□□□ -0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DHDDSQ86SQ9 333 aa13.78□□□□□ -0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RETREG3Q86VR2 466 aa13.78□□□□□ -0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PLPPR2Q96GM1 343 aa13.78□□□□□ -0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 POTEKPQ9BYX7 375 aa13.78□□□□□ -0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CORO2BQ9UQ03 480 aa13.78□□□□□ -0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NDUFAF1Q9Y375 327 aa13.78□□□□□ -0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GPR171O14626 319 aa13.77□□□□□ -0.21
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ANGPT2O15123 496 aa13.77□□□□□ -0.21
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP13.77□□□□□ -0.21
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LYZL6O75951 148 aa13.77□□□□□ -0.21
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PRKAR1BP31321 381 aa13.77□□□□□ -0.21
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NTF4P34130 210 aa13.77□□□□□ -0.21
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CEACAM7Q14002 265 aa13.77□□□□□ -0.21
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SCARB2Q14108 478 aa13.77□□□□□ -0.21
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TAB1Q15750 504 aa13.77□□□□□ -0.21
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ADRM1Q16186 407 aa13.77□□□□□ -0.21
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ACKR1Q16570 336 aa13.77□□□□□ -0.21
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RUNDC3AQ59EK9 446 aa13.77□□□□□ -0.21
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP13.77□□□□□ -0.21
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 COMTD1Q86VU5 262 aa13.77□□□□□ -0.21
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DPP10Q8N608 796 aa13.77□□□□□ -0.21
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SLC35B4Q969S0 331 aa13.77□□□□□ -0.21
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 C3orf49Q96BT1 292 aa13.77□□□□□ -0.21
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP13.77□□□□□ -0.21
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa13.77□□□□□ -0.21
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TMEM38AQ9H6F2 299 aa13.77□□□□□ -0.21
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LIPT2A6NK58 231 aa13.76□□□□□ -0.21
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 A8MVM7 634 aa13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 101.2 ms