RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454716.1

RPS3AP53-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 53, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP53, Length 778 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP53-201ENST00000454716 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
RPS3AP53-201ENST00000454716 ATRQ13535 2644 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP53-201ENST00000454716 TUBAL3A6NHL2 446 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP53-201ENST00000454716 M0QZ24 198 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP53-201ENST00000454716 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP53-201ENST00000454716 WWP2O00308 870 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP53-201ENST00000454716 CLDN4O14493 209 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP53-201ENST00000454716 ANKRD28O15084 1053 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP53-201ENST00000454716 ZBTB14O43829 449 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP53-201ENST00000454716 AVILO75366 819 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP53-201ENST00000454716 ZFAND5O76080 213 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP53-201ENST00000454716 SMIM10L1P0DMW3 83 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP53-201ENST00000454716 CCL3P10147 92 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP53-201ENST00000454716 RNH1P13489 461 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP53-201ENST00000454716 CNR1P21554 472 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP53-201ENST00000454716 STIP1P31948 543 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP53-201ENST00000454716 RPL22P35268 128 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP53-201ENST00000454716 PEX19P40855 299 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP53-201ENST00000454716 DNASE1L1P49184 302 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP53-201ENST00000454716 ASCL1P50553 236 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP53-201ENST00000454716 CCR8P51685 355 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP53-201ENST00000454716 LUMP51884 338 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP53-201ENST00000454716 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP53-201ENST00000454716 CLDN20P56880 219 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP53-201ENST00000454716 GNB1P62873 340 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP53-201ENST00000454716 SLC10A1Q14973 349 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP53-201ENST00000454716 SPA17Q15506 151 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP53-201ENST00000454716 HYAL4Q2M3T9 481 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP53-201ENST00000454716 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP53-201ENST00000454716 SVEP1Q4LDE5 3571 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP53-201ENST00000454716 WLSQ5T9L3 541 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP53-201ENST00000454716 SHEQ5VZ18 495 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP53-201ENST00000454716 AGTRAPQ6RW13 159 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP53-201ENST00000454716 FAM47EQ6ZV65 393 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP53-201ENST00000454716 ABHD13Q7L211 337 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP53-201ENST00000454716 RTTNQ86VV8 2226 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP53-201ENST00000454716 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP53-201ENST00000454716 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP53-201ENST00000454716 ZNF321PQ8N8H1 164 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP53-201ENST00000454716 OR4K1Q8NGD4 311 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP53-201ENST00000454716 NT5CQ8TCD5 201 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP53-201ENST00000454716 CD200R1Q8TD46 325 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP53-201ENST00000454716 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP53-201ENST00000454716 PYCR2Q96C36 320 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP53-201ENST00000454716 SMIM10Q96HG1 83 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP53-201ENST00000454716 OR4K3Q96R72 315 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP53-201ENST00000454716 GPR21Q99679 349 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP53-201ENST00000454716 FAM173AQ9BQD7 235 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP53-201ENST00000454716 CCDC77Q9BR77 488 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP53-201ENST00000454716 KIFC1Q9BW19 673 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP53-201ENST00000454716 IL22Q9GZX6 179 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP53-201ENST00000454716 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP53-201ENST00000454716 ADPRHL2Q9NX46 363 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP53-201ENST00000454716 BFARQ9NZS9 450 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP53-201ENST00000454716 PAK5Q9P286 719 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP53-201ENST00000454716 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP53-201ENST00000454716 ZNF148Q9UQR1 794 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP53-201ENST00000454716 PDE10AQ9Y233 779 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP53-201ENST00000454716 DHRS7Q9Y394 339 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP53-201ENST00000454716 JRKLQ9Y4A0 524 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP53-201ENST00000454716 ATG4BQ9Y4P1 393 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP53-201ENST00000454716 MXRA5Q9NR99 2828 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 A0A0G2JN53 185 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 TRBC2A0A5B9 178 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 TRIM64A6NGJ6 449 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 TRIM64BA6NI03 449 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 C15orf62A8K5M9 175 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 FAM90A26D6RGX4 464 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 LDLRAD4O15165 306 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 PFDN6O15212 129 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 CIDEAO60543 219 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 HCN1O60741 890 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 GABRA1P14867 456 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 OGNP20774 298 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 TRPC1P48995 793 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 NPY2RP49146 381 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 ZNF136P52737 540 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 SKP1P63208 163 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 BASP1P80723 227 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 REEP5Q00765 189 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 RGS1Q08116 209 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 PHKG1Q16816 387 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 FAM69AQ5T7M9 428 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 ZNF470Q6ECI4 717 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 NEPROQ6NW34 567 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 FAAP20Q6NZ36 180 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 HSDL2Q6YN16 418 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 ZNF497Q6ZNH5 498 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 RTL4Q6ZR62 310 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP53-201ENST00000454716 PEX26Q7Z412 305 aa4.58□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms