RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000448352.1

RPS3AP46-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 46, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP46, Length 682 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP46-201ENST00000448352 SARAFQ96BY9 339 aa3.4□□□□□ -1.87
RPS3AP46-201ENST00000448352 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
RPS3AP46-201ENST00000448352 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
RPS3AP46-201ENST00000448352 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
RPS3AP46-201ENST00000448352 KCNA7Q96RP8 456 aa3.4□□□□□ -1.87
RPS3AP46-201ENST00000448352 SEPHS2Q99611 448 aa3.4□□□□□ -1.87
RPS3AP46-201ENST00000448352 CGREF1Q99674 301 aa3.4□□□□□ -1.87
RPS3AP46-201ENST00000448352 SLC39A3Q9BRY0 314 aa3.4□□□□□ -1.87
RPS3AP46-201ENST00000448352 C1orf50Q9BV19 199 aa3.4□□□□□ -1.87
RPS3AP46-201ENST00000448352 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
RPS3AP46-201ENST00000448352 CHID1Q9BWS9 393 aa3.4□□□□□ -1.87
RPS3AP46-201ENST00000448352 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
RPS3AP46-201ENST00000448352 OSBPL10Q9BXB5 764 aa3.4□□□□□ -1.87
RPS3AP46-201ENST00000448352 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
RPS3AP46-201ENST00000448352 HES7Q9BYE0 225 aa3.4□□□□□ -1.87
RPS3AP46-201ENST00000448352 DPY30Q9C005 99 aa3.4□□□□□ -1.87
RPS3AP46-201ENST00000448352 WWTR1Q9GZV5 400 aa3.4□□□□□ -1.87
RPS3AP46-201ENST00000448352 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
RPS3AP46-201ENST00000448352 EXO5Q9H790 373 aa3.4□□□□□ -1.87
RPS3AP46-201ENST00000448352 RMND5AQ9H871 391 aa3.4□□□□□ -1.87
RPS3AP46-201ENST00000448352 GORASP2Q9H8Y8 452 aa3.4□□□□□ -1.87
RPS3AP46-201ENST00000448352 CHST11Q9NPF2 352 aa3.4□□□□□ -1.87
RPS3AP46-201ENST00000448352 SLC52A3Q9NQ40 469 aa3.4□□□□□ -1.87
RPS3AP46-201ENST00000448352 MIEF1Q9NQG6 463 aa3.4□□□□□ -1.87
RPS3AP46-201ENST00000448352 TBC1D23Q9NUY8 699 aa3.4□□□□□ -1.87
RPS3AP46-201ENST00000448352 TBCCD1Q9NVR7 557 aa3.4□□□□□ -1.87
RPS3AP46-201ENST00000448352 ASIC5Q9NY37 505 aa3.4□□□□□ -1.87
RPS3AP46-201ENST00000448352 COQ3Q9NZJ6 369 aa3.4□□□□□ -1.87
RPS3AP46-201ENST00000448352 CNIH4Q9P003 139 aa3.4□□□□□ -1.87
RPS3AP46-201ENST00000448352 VPS29Q9UBQ0 182 aa3.4□□□□□ -1.87
RPS3AP46-201ENST00000448352 DNAJB9Q9UBS3 223 aa3.4□□□□□ -1.87
RPS3AP46-201ENST00000448352 GIMAP2Q9UG22 337 aa3.4□□□□□ -1.87
RPS3AP46-201ENST00000448352 ZNF639Q9UID6 485 aa3.4□□□□□ -1.87
RPS3AP46-201ENST00000448352 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa3.4□□□□□ -1.87
RPS3AP46-201ENST00000448352 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
RPS3AP46-201ENST00000448352 BLOC1S6Q9UL45 172 aa3.4□□□□□ -1.87
RPS3AP46-201ENST00000448352 PCDHGB4Q9UN71 923 aa3.4□□□□□ -1.87
RPS3AP46-201ENST00000448352 ERVK-19Q9WJR5 959 aa3.4□□□□□ -1.87
RPS3AP46-201ENST00000448352 ATG4BQ9Y4P1 393 aa3.4□□□□□ -1.87
RPS3AP46-201ENST00000448352 ASB4Q9Y574 426 aa3.4□□□□□ -1.87
RPS3AP46-201ENST00000448352 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa3.4□□□□□ -1.87
RPS3AP46-201ENST00000448352 CLDN16Q9Y5I7 305 aa3.4□□□□□ -1.87
RPS3AP46-201ENST00000448352 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
RPS3AP46-201ENST00000448352 SNX5Q9Y5X3 404 aa3.4□□□□□ -1.87
RPS3AP46-201ENST00000448352 MED13LQ71F56 2210 aa3.4□□□□□ -1.87
RPS3AP46-201ENST00000448352 ITPR2Q14571 2701 aa3.39□□□□□ -1.87
RPS3AP46-201ENST00000448352 UNC79Q9P2D8 2635 aa3.39□□□□□ -1.87
RPS3AP46-201ENST00000448352 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa3.39□□□□□ -1.87
RPS3AP46-201ENST00000448352 ELOVL7A1L3X0 281 aa3.39□□□□□ -1.87
RPS3AP46-201ENST00000448352 GLOD5A6NK44 160 aa3.39□□□□□ -1.87
RPS3AP46-201ENST00000448352 FAM166BA8MTA8 275 aa3.39□□□□□ -1.87
RPS3AP46-201ENST00000448352 EVPLLA8MZ36 301 aa3.39□□□□□ -1.87
RPS3AP46-201ENST00000448352 FAM220BPB1ANY3 271 aa3.39□□□□□ -1.87
RPS3AP46-201ENST00000448352 PRSS44E7EML9 344 aa3.39□□□□□ -1.87
RPS3AP46-201ENST00000448352 E9PLN8 166 aa3.39□□□□□ -1.87
RPS3AP46-201ENST00000448352 G3V2T6 193 aa3.39□□□□□ -1.87
RPS3AP46-201ENST00000448352 PLOD2O00469 737 aa3.39□□□□□ -1.87
RPS3AP46-201ENST00000448352 EI24O14681 340 aa3.39□□□□□ -1.87
RPS3AP46-201ENST00000448352 LSM1O15116 133 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RPS3AP46-201ENST00000448352 HS6ST1O60243 411 aa3.39□□□□□ -1.87
RPS3AP46-201ENST00000448352 TPST1O60507 370 aa3.39□□□□□ -1.87
RPS3AP46-201ENST00000448352 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RPS3AP46-201ENST00000448352 ZG16O60844 167 aa3.39□□□□□ -1.87
RPS3AP46-201ENST00000448352 COQ9O75208 318 aa3.39□□□□□ -1.87
RPS3AP46-201ENST00000448352 UGT2B11O75310 529 aa3.39□□□□□ -1.87
RPS3AP46-201ENST00000448352 SEC22BO75396 215 aa3.39□□□□□ -1.87
RPS3AP46-201ENST00000448352 ERN1O75460 977 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RPS3AP46-201ENST00000448352 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RPS3AP46-201ENST00000448352 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RPS3AP46-201ENST00000448352 PRSS23O95084 383 aa3.39□□□□□ -1.87
RPS3AP46-201ENST00000448352 SNX4O95219 450 aa3.39□□□□□ -1.87
RPS3AP46-201ENST00000448352 ETHE1O95571 254 aa3.39□□□□□ -1.87
RPS3AP46-201ENST00000448352 BCL10O95999 233 aa3.39□□□□□ -1.87
RPS3AP46-201ENST00000448352 CST1P01037 141 aa3.39□□□□□ -1.87
RPS3AP46-201ENST00000448352 GBAP04062 536 aa3.39□□□□□ -1.87
RPS3AP46-201ENST00000448352 IGKV3-11P04433 115 aa3.39□□□□□ -1.87
RPS3AP46-201ENST00000448352 AMY1AP04745 511 aa3.39□□□□□ -1.87
RPS3AP46-201ENST00000448352 ATP1B1P05026 303 aa3.39□□□□□ -1.87
RPS3AP46-201ENST00000448352 TPOP07202 933 aa3.39□□□□□ -1.87
RPS3AP46-201ENST00000448352 THRBP10828 461 aa3.39□□□□□ -1.87
RPS3AP46-201ENST00000448352 G6PDP11413 515 aa3.39□□□□□ -1.87
RPS3AP46-201ENST00000448352 CPMP14384 443 aa3.39□□□□□ -1.87
RPS3AP46-201ENST00000448352 COX6B1P14854 86 aa3.39□□□□□ -1.87
RPS3AP46-201ENST00000448352 NCK1P16333 377 aa3.39□□□□□ -1.87
RPS3AP46-201ENST00000448352 PORP16435 677 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RPS3AP46-201ENST00000448352 NAGAP17050 411 aa3.39□□□□□ -1.87
RPS3AP46-201ENST00000448352 CCNA2P20248 432 aa3.39□□□□□ -1.87
RPS3AP46-201ENST00000448352 CNR1P21554 472 aa3.39□□□□□ -1.87
RPS3AP46-201ENST00000448352 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RPS3AP46-201ENST00000448352 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RPS3AP46-201ENST00000448352 MST1P26927 711 aa3.39□□□□□ -1.87
RPS3AP46-201ENST00000448352 DCKP27707 260 aa3.39□□□□□ -1.87
RPS3AP46-201ENST00000448352 IL12AP29459 219 aa3.39□□□□□ -1.87
RPS3AP46-201ENST00000448352 NTSP30990 170 aa3.39□□□□□ -1.87
RPS3AP46-201ENST00000448352 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP3.39□□□□□ -1.87
RPS3AP46-201ENST00000448352 MPIP34949 423 aa3.39□□□□□ -1.87
RPS3AP46-201ENST00000448352 KRT20P35900 424 aa3.39□□□□□ -1.87
RPS3AP46-201ENST00000448352 RANBP1P43487 201 aa3.39□□□□□ -1.87
RPS3AP46-201ENST00000448352 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RPS3AP46-201ENST00000448352 RAD23AP54725 363 aa3.39□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms