RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 ADAM5Q6NVV9 412 aa10.41□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 CBLN3Q6UW01 205 aa10.41□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 DLEU7Q6UYE1 221 aa10.41□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 HIPK1Q86Z02 1210 aa10.41□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 MSRB3Q8IXL7 192 aa10.41□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 ZNF619Q8N2I2 560 aa10.41□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 ANKFN1Q8N957 763 aa10.41□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa10.41□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa10.41□□□□□ -0.74
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PRAME-210ENST00000442481 ZNF350Q9GZX5 532 aa10.41□□□□□ -0.74
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PRAME-210ENST00000442481 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa10.4□□□□□ -0.74
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PRAME-210ENST00000442481 UGT2B17O75795 530 aa10.4□□□□□ -0.74
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PRAME-210ENST00000442481 TMEM204Q9BSN7 226 aa10.4□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 THTPAQ9BU02 230 aa10.4□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 ALG2Q9H553 416 aa10.4□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 P2RX2Q9UBL9 471 aa10.4□□□□□ -0.74
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PRAME-210ENST00000442481 GSC2O15499 205 aa10.39□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP10.39□□□□□ -0.75
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PRAME-210ENST00000442481 F12P00748 615 aaPredicted RBP10.39□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 THBDP07204 575 aa10.39□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 CD3EP07766 207 aa10.39□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 CHRM4P08173 479 aa10.39□□□□□ -0.75
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PRAME-210ENST00000442481 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP10.39□□□□□ -0.75
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PRAME-210ENST00000442481 PHC2Q8IXK0 858 aa10.39□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP10.39□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 OR5W2Q8NH69 310 aa10.39□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 CLPTM1LQ96KA5 538 aa10.39□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 HS6ST2Q96MM7 605 aa10.39□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 CDRT15Q96T59 188 aa10.39□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
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