RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438120.5

PTPRF-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRF, Length 6,377 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-209ENST00000438120 AGAP6Q5VW22 663 aa15.99■□□□□ 0.15
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PTPRF-209ENST00000438120 RETREG3Q86VR2 466 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRF-209ENST00000438120 MKXQ8IYA7 352 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRF-209ENST00000438120 ZNF595Q8IYB9 648 aa15.99■□□□□ 0.15
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PTPRF-209ENST00000438120 AGAP4Q96P64 663 aa15.99■□□□□ 0.15
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PTPRF-209ENST00000438120 EFNA3P52797 238 aa15.99■□□□□ 0.15
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PTPRF-209ENST00000438120 PRR14Q9BWN1 585 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRF-209ENST00000438120 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
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PTPRF-209ENST00000438120 ARGFXA6NJG6 315 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRF-209ENST00000438120 TRAPPC2LH3BP13 241 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRF-209ENST00000438120 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
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PTPRF-209ENST00000438120 CD79BP40259 229 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRF-209ENST00000438120 KCTD11Q693B1 232 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRF-209ENST00000438120 ZNF679Q8IYX0 411 aa15.99■□□□□ 0.15
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PTPRF-209ENST00000438120 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
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PTPRF-209ENST00000438120 ZNF91Q05481 1191 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRF-209ENST00000438120 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
PTPRF-209ENST00000438120 SULF2Q8IWU5 870 aa15.98■□□□□ 0.15
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PTPRF-209ENST00000438120 NICN1Q9BSH3 213 aa15.98■□□□□ 0.15
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PTPRF-209ENST00000438120 SIRPAP78324 504 aa15.98■□□□□ 0.15
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PTPRF-209ENST00000438120 BCL2A1Q16548 175 aa15.98■□□□□ 0.15
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PTPRF-209ENST00000438120 OR14A16Q8NHC5 309 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRF-209ENST00000438120 C22orf15Q8WYQ4 148 aa15.98■□□□□ 0.15
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PTPRF-209ENST00000438120 ZNF529Q6P280 563 aa15.98■□□□□ 0.15
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PTPRF-209ENST00000438120 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
PTPRF-209ENST00000438120 ALDH3B1P43353 468 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRF-209ENST00000438120 DAPP51397 102 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRF-209ENST00000438120 TAS2R20P59543 309 aa15.98■□□□□ 0.15
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PTPRF-209ENST00000438120 OR13H1Q8NG92 308 aa15.98■□□□□ 0.15
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PTPRF-209ENST00000438120 ALDH3B2P48448 385 aa15.97■□□□□ 0.15
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PTPRF-209ENST00000438120 SLC9A3R2Q15599 337 aa15.97■□□□□ 0.15
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PTPRF-209ENST00000438120 ZNF566Q969W8 418 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRF-209ENST00000438120 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
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PTPRF-209ENST00000438120 SSTR2P30874 369 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRF-209ENST00000438120 EVI2BP34910 448 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRF-209ENST00000438120 DYRK1AQ13627 763 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRF-209ENST00000438120 NMNAT3Q96T66 252 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRF-209ENST00000438120 SPIN2AQ99865 258 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRF-209ENST00000438120 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa15.97■□□□□ 0.15
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