RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429738.1

MRPL28-203, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L28, human

TSL 2 BASIC

Gene MRPL28, Length 310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC16A1	P53985	500 aa		15.67	■□□□□ 0.1
MRPL28-203	ENST00000429738	H3F3A	P84243	136 aa		15.67	■□□□□ 0.1
MRPL28-203	ENST00000429738	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		15.67	■□□□□ 0.1
MRPL28-203	ENST00000429738	EPS8	Q12929	822 aa		15.67	■□□□□ 0.1
MRPL28-203	ENST00000429738	MRPL2	Q5T653	305 aa	Known RBP	15.67	■□□□□ 0.1
MRPL28-203	ENST00000429738	DNAJC14	Q6Y2X3	702 aa	Predicted RBP	15.67	■□□□□ 0.1
MRPL28-203	ENST00000429738	BHLHA15	Q7RTS1	189 aa	Predicted RBP	15.67	■□□□□ 0.1
MRPL28-203	ENST00000429738	OR9I1	Q8NGQ6	314 aa		15.67	■□□□□ 0.1
MRPL28-203	ENST00000429738	OR11A1	Q9GZK7	315 aa		15.67	■□□□□ 0.1
MRPL28-203	ENST00000429738	EMC3	Q9P0I2	261 aa		15.67	■□□□□ 0.1
MRPL28-203	ENST00000429738	P2RX2	Q9UBL9	471 aa		15.67	■□□□□ 0.1
MRPL28-203	ENST00000429738	OSGIN1	Q9UJX0	560 aa		15.67	■□□□□ 0.1
MRPL28-203	ENST00000429738	TRAPPC4	Q9Y296	219 aa		15.67	■□□□□ 0.1
MRPL28-203	ENST00000429738	TMED7-TICAM2	A0A0A6YYA0	188 aa		15.66	■□□□□ 0.1
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM72	A0PK05	275 aa		15.66	■□□□□ 0.1
MRPL28-203	ENST00000429738	UBD	O15205	165 aa		15.66	■□□□□ 0.1
MRPL28-203	ENST00000429738	LYZL6	O75951	148 aa		15.66	■□□□□ 0.1
MRPL28-203	ENST00000429738	PGM3	O95394	542 aa		15.66	■□□□□ 0.1
MRPL28-203	ENST00000429738	NTF4	P34130	210 aa		15.66	■□□□□ 0.1
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC1A3	P43003	542 aa		15.66	■□□□□ 0.1
MRPL28-203	ENST00000429738	MRPL19	P49406	292 aa	Known RBP	15.66	■□□□□ 0.1
MRPL28-203	ENST00000429738	POLR2H	P52434	150 aa	Known RBP	15.66	■□□□□ 0.1
MRPL28-203	ENST00000429738	MAP2K6	P52564	334 aa		15.66	■□□□□ 0.1
MRPL28-203	ENST00000429738	ATP5J2	P56134	94 aa		15.66	■□□□□ 0.1
MRPL28-203	ENST00000429738	TNK1	Q13470	666 aa		15.66	■□□□□ 0.1
MRPL28-203	ENST00000429738	GNA13	Q14344	377 aa		15.66	■□□□□ 0.1
MRPL28-203	ENST00000429738	GTDC1	Q4AE62	458 aa		15.66	■□□□□ 0.1
MRPL28-203	ENST00000429738	AGBL2	Q5U5Z8	902 aa		15.66	■□□□□ 0.1
MRPL28-203	ENST00000429738	EPGN	Q6UW88	154 aa		15.66	■□□□□ 0.1
MRPL28-203	ENST00000429738	ZC3HAV1	Q7Z2W4	902 aa	Known RBP	15.66	■□□□□ 0.1
MRPL28-203	ENST00000429738	PIGX	Q8TBF5	258 aa		15.66	■□□□□ 0.1
MRPL28-203	ENST00000429738	AKAP1	Q92667	903 aa	Known RBP eCLIP	15.66	■□□□□ 0.1	5e-7	■□□□□ 10.9
MRPL28-203	ENST00000429738	ZHX1-C8orf76	Q96EF9	292 aa		15.66	■□□□□ 0.1
MRPL28-203	ENST00000429738	ADAM19	Q9H013	955 aa		15.66	■□□□□ 0.1
MRPL28-203	ENST00000429738	TPT1P8	Q9HAU6	139 aa		15.66	■□□□□ 0.1
MRPL28-203	ENST00000429738	NGB	Q9NPG2	151 aa		15.66	■□□□□ 0.1
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM181	Q9P2C4	612 aa		15.66	■□□□□ 0.1
MRPL28-203	ENST00000429738	PRDM4	Q9UKN5	801 aa		15.66	■□□□□ 0.1
MRPL28-203	ENST00000429738	TMED7	Q9Y3B3	224 aa		15.66	■□□□□ 0.1
MRPL28-203	ENST00000429738	RNF115	Q9Y4L5	304 aa		15.66	■□□□□ 0.1
MRPL28-203	ENST00000429738	USH1C	Q9Y6N9	552 aa		15.66	■□□□□ 0.1
MRPL28-203	ENST00000429738	NBEAL1	Q6ZS30	2694 aa		15.66	■□□□□ 0.1
MRPL28-203	ENST00000429738	CDHR4	A6H8M9	788 aa		15.65	■□□□□ 0.1
MRPL28-203	ENST00000429738	CFAP73	A6NFT4	308 aa		15.65	■□□□□ 0.1
MRPL28-203	ENST00000429738	RAMP1	O60894	148 aa		15.65	■□□□□ 0.1
MRPL28-203	ENST00000429738	TFPT	P0C1Z6	253 aa		15.65	■□□□□ 0.1
MRPL28-203	ENST00000429738	IMPDH2	P12268	514 aa		15.65	■□□□□ 0.1
MRPL28-203	ENST00000429738	ETFA	P13804	333 aa		15.65	■□□□□ 0.1
MRPL28-203	ENST00000429738	TACR3	P29371	465 aa		15.65	■□□□□ 0.1
MRPL28-203	ENST00000429738	POLR2J	P52435	117 aa	Known RBP	15.65	■□□□□ 0.1
MRPL28-203	ENST00000429738	FBXW9	Q5XUX1	488 aa		15.65	■□□□□ 0.1
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF836	Q6ZNA1	936 aa		15.65	■□□□□ 0.1
MRPL28-203	ENST00000429738	ATG4D	Q86TL0	474 aa	Predicted RBP	15.65	■□□□□ 0.1
MRPL28-203	ENST00000429738	LSR	Q86X29	649 aa	Predicted RBP	15.65	■□□□□ 0.1
MRPL28-203	ENST00000429738	CCDC103	Q8IW40	242 aa		15.65	■□□□□ 0.1
MRPL28-203	ENST00000429738	PEX5L	Q8IYB4	626 aa		15.65	■□□□□ 0.1
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF100	Q8IYN0	542 aa		15.65	■□□□□ 0.1
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF433	Q8N7K0	673 aa	Predicted RBP	15.65	■□□□□ 0.1
MRPL28-203	ENST00000429738	GTF2H4	Q92759	462 aa		15.65	■□□□□ 0.1
MRPL28-203	ENST00000429738	VPS33A	Q96AX1	596 aa		15.65	■□□□□ 0.1
MRPL28-203	ENST00000429738	DDIT4L	Q96D03	193 aa		15.65	■□□□□ 0.1
MRPL28-203	ENST00000429738	DNAJA3	Q96EY1	480 aa		15.65	■□□□□ 0.1
MRPL28-203	ENST00000429738	C7orf26	Q96N11	449 aa		15.65	■□□□□ 0.1
MRPL28-203	ENST00000429738	ESRP2	Q9H6T0	727 aa	Known RBP	15.65	■□□□□ 0.1
MRPL28-203	ENST00000429738	RMND5A	Q9H871	391 aa		15.65	■□□□□ 0.1
MRPL28-203	ENST00000429738	RLIM	Q9NVW2	624 aa		15.65	■□□□□ 0.1
MRPL28-203	ENST00000429738	CALML5	Q9NZT1	146 aa		15.65	■□□□□ 0.1
MRPL28-203	ENST00000429738	NOSIP	Q9Y314	301 aa	Known RBP	15.65	■□□□□ 0.1
MRPL28-203	ENST00000429738	DPRX	A6NFQ7	191 aa		15.64	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	RNF212B	A8MTL3	300 aa		15.64	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	GPR171	O14626	319 aa		15.64	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	HOXB9	P17482	250 aa	Predicted RBP	15.64	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	ACAA2	P42765	397 aa	Known RBP	15.64	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	CRAT	P43155	626 aa		15.64	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	CRISP3	P54108	245 aa		15.64	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	DSTN	P60981	165 aa		15.64	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	LIN52	Q52LA3	116 aa		15.64	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	TIMM23B	Q5SRD1	257 aa		15.64	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	HMBOX1	Q6NT76	420 aa		15.64	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	SSX8	Q7RTT4	187 aa		15.64	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	VRK2	Q86Y07	508 aa		15.64	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF440	Q8IYI8	595 aa		15.64	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	MIER2	Q8N344	545 aa		15.64	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	OR52P1P	Q8NH57	321 aa		15.64	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC38A5	Q8WUX1	472 aa		15.64	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	AURKB	Q96GD4	344 aa	Predicted RBP	15.64	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	ITCH	Q96J02	903 aa		15.64	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	PAIP1	Q9H074	479 aa	Known RBP	15.64	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	MALT1	Q9UDY8	824 aa		15.64	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	CHST2	Q9Y4C5	530 aa		15.64	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	ZC3H12D	A2A288	527 aa	Known RBP	15.63	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM234B	A2RU67	622 aa		15.63	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	OVOL3	O00110	214 aa		15.63	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	EIF1B	O60739	113 aa	Known RBP	15.63	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	ANP32D	O95626	131 aa		15.63	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	BCHE	P06276	602 aa		15.63	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	CD3E	P07766	207 aa		15.63	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	THBS1	P07996	1170 aa		15.63	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	DANCR	P0C864	163 aa		15.63	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	UQCRB	P14927	111 aa		15.63	■□□□□ 0.09

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