RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426965.1

HOXD-AS2-201, HOXD cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD-AS2, Length 927 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LURAP1Q96LR2 239 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PSD2Q9BQI7 771 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FAM107BQ9H098 131 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 C12orf49Q9H741 205 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZNF814B7Z6K7 855 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CCDC22O60826 627 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 IMPDH2P12268 514 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 HTR2AP28223 471 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CCKARP32238 428 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PCGF2P35227 344 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CD79BP40259 229 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PCYT1AP49585 367 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MAP2K6P52564 334 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 BNIP2Q12982 314 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ARMC8Q8IUR7 673 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DDIT4LQ96D03 193 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RCN3Q96D15 328 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PRR14Q9BWN1 585 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 BCO1Q9HAY6 547 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GP6Q9HCN6 339 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GMNCA6NCL1 334 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 M0QX08 132 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SNX3O60493 162 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SERPINB7O75635 380 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 YES1P07947 543 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CXCR1P25024 350 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SMYD1Q8NB12 490 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SH3GL1Q99961 368 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MYLK2Q9H1R3 596 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ELOVL5Q9NYP7 299 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TMEM181Q9P2C4 612 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 USP22Q9UPT9 525 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TRAPPC4Q9Y296 219 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 POLQO75417 2590 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FAM221AA4D161 298 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PRORSD1PA6NEY8 169 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RAMP1O60894 148 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 OPN1SWP03999 348 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 EPXP11678 715 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 COX4I1P13073 169 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 POU2F1P14859 743 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 UGT2B10P36537 528 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KCNJ5P48544 419 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CRYBA2P53672 197 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 OR2B6P58173 313 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GNGT1P63211 74 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 H3F3AP84243 136 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DUSP7Q16829 419 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 VMACQ2NL98 169 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TMEM201Q5SNT2 666 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GPR32P1Q8NGA4 272 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZNF583Q96ND8 569 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KLHL9Q9P2J3 617 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TMEM229AB2RXF0 380 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DNPH1O43598 174 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TPST2O60704 377 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CTAG2O75638 210 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CCDC103Q8IW40 242 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SLC30A8Q8IWU4 369 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LSMEM1Q8N8F7 131 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TAMM41Q96BW9 452 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ECSITQ9BQ95 431 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 POTEKPQ9BYX7 375 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GID8Q9NWU2 228 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 A6NNC1 897 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZNF716A6NP11 495 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NPIPB7O75200 414 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXD-AS2-201ENST00000426965 EDNRAP25101 427 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TFAP2EQ6VUC0 442 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXD-AS2-201ENST00000426965 C22orf34Q6ZV56 151 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXD-AS2-201ENST00000426965 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DACH2Q96NX9 599 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TESMINQ9Y4I5 508 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXD-AS2-201ENST00000426965 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXD-AS2-201ENST00000426965 A0A1B0GWA3 101 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SH3D21A4FU49 640 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LIPT2A6NK58 231 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZNF724A8MTY0 619 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXD-AS2-201ENST00000426965 A8MVM7 634 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXD-AS2-201ENST00000426965 C16orf97H3BN30 126 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LGI1O95970 557 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CD247P20963 164 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FPR1P21462 350 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SLC35A1P78382 337 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PDK3Q15120 406 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXD-AS2-201ENST00000426965 C6orf89Q6UWU4 347 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXD-AS2-201ENST00000426965 STAC2Q6ZMT1 411 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CCDC80Q76M96 950 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CPLX4Q7Z7G2 160 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.7 ms