RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CASP12Q6UXS9 341 aa11.54□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa11.54□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCDC103Q8IW40 242 aa11.54□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CLECL1Q8IZS7 167 aa11.54□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WDR31Q8NA23 367 aa11.54□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OIT3Q8WWZ8 545 aa11.54□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C19orf24Q9BVV8 132 aa11.54□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR11A1Q9GZK7 315 aa11.54□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR51I1Q9H343 314 aa11.54□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DCTN4Q9UJW0 460 aa11.54□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KCNS2Q9ULS6 477 aa11.54□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AMDHD2Q9Y303 409 aa11.54□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa11.54□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP11.53□□□□□ -0.562e-6■■■■□ 24.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 G6PDP11413 515 aa11.53□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RYKP34925 604 aa11.53□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CLK1P49759 484 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR2B6P58173 313 aa11.53□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C9orf135Q5VTT2 229 aa11.53□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR4F3Q6IEY1 312 aa11.53□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EMBQ6PCB8 327 aa11.53□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MIPOL1Q8TD10 442 aa11.53□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TUBGCP3Q96CW5 907 aa11.53□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CHODLQ9H9P2 273 aa11.53□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC17A5Q9NRA2 495 aa11.53□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 POLE3Q9NRF9 147 aa11.53□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM181Q9P2C4 612 aa11.53□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UPB1Q9UBR1 384 aa11.53□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa11.53□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WDR45Q9Y484 360 aa11.53□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FKBP7Q9Y680 259 aa11.53□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa11.53□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 VWC2LB2RUY7 222 aa11.52□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa11.52□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NDUFS8O00217 210 aa11.52□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AGR2O95994 175 aa11.52□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GUSBP08236 651 aa11.52□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR12D1P0DN82 309 aa11.52□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARRB2P32121 409 aa11.52□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SERPINB5P36952 375 aa11.52□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PDLIM4P50479 330 aa11.52□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CLDN8P56748 225 aa11.52□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 H3F3AP84243 136 aa11.52□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PLAURQ03405 335 aa11.52□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FUT5Q11128 374 aa11.52□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GGTLC2Q14390 218 aa11.52□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PGS1Q32NB8 556 aa11.52□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ATAD3BQ5T9A4 648 aa11.52□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM166AQ6J272 317 aa11.52□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FRRS1Q6ZNA5 592 aa11.52□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IL17RELQ6ZVW7 336 aa11.52□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ADGRG3Q86Y34 549 aa11.52□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR4A15Q8NGL6 344 aa11.52□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PIMREGQ9BSJ6 248 aa11.52□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC7A10Q9NS82 523 aa11.52□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC17A7Q9P2U7 560 aa11.52□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa11.52□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRAPPC4Q9Y296 219 aa11.52□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa11.52□□□□□ -0.56
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC35F4A4IF30 521 aa11.51□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCNA2P20248 432 aa11.51□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HTR3AP46098 478 aa11.51□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TGFBR3Q03167 851 aa11.51□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SWI5Q1ZZU3 235 aa11.51□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM120AOSQ5T036 256 aa11.51□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa11.51□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TSPO2Q5TGU0 170 aa11.51□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa11.51□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ROPN1LQ96C74 230 aa11.51□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FBXO17Q96EF6 278 aa11.51□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SORCS2Q96PQ0 1159 aa11.51□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PARD6BQ9BYG5 372 aa11.51□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SAP130Q9H0E3 1048 aa11.51□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PARPBPQ9NWS1 579 aa11.51□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ASIC5Q9NY37 505 aa11.51□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PCDHGB4Q9UN71 923 aa11.51□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa11.51□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CLDN24A6NM45 220 aa11.51□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WNT11O96014 354 aa11.51□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IMPDH2P12268 514 aa11.51□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HNF1AP20823 631 aa11.51□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MPGP29372 298 aa11.51□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NR4A2P43354 598 aa11.51□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IDH2P48735 452 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRPS1P60891 318 aa11.51□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC35A1P78382 337 aa11.51□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HPCAP84074 193 aa11.51□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EMX2Q04743 252 aa11.51□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC17A1Q14916 467 aa11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms