RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000413409.6

PTPRC-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,338 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-206ENST00000413409 PGGHGQ32M88 737 aa15.64■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 CT45A2Q5DJT8 189 aa15.64■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa15.64■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 TTLL10Q6ZVT0 673 aa15.64■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 NDC1Q9BTX1 674 aa15.64■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 CBLCQ9ULV8 474 aa15.64■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 A0A1B0GX78 115 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 A6NL46 340 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 C17orf105B2RV13 164 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 HMGN1P05114 100 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 GKN3PP0CG01 181 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 LIPAP38571 399 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 GPR4P46093 362 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP15.63■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 MINDY4Q4G0A6 757 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 ZNF440Q8IYI8 595 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 SLC43A2Q8N370 569 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 LSMEM1Q8N8F7 131 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 LRR1Q96L50 414 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 PTCHD1Q96NR3 888 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 MND1Q9BWT6 205 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 GPR87Q9BY21 358 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 PLGRKTQ9HBL7 147 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 SERTAD3Q9UJW9 196 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP15.63■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 UNC119BA6NIH7 251 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 RAB36O95755 333 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 INHBBP09529 407 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 FOLR1P15328 257 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 ITGA3P26006 1051 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 LCN1P31025 176 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 GRK5P34947 590 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 UGT2B10P36537 528 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 MOGQ16653 247 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 KLHL22Q53GT1 634 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 SPNS3Q6ZMD2 512 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 WDR88Q6ZMY6 472 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 CROCCP3Q8IVE0 287 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 BCORP1Q8N888 145 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 OR2T33Q8NG76 320 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 OR4N2Q8NGD1 307 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 OR4Q3Q8NH05 313 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 FANK1Q8TC84 345 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 ART5Q96L15 291 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 SH3GL3Q99963 347 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 ZNF426Q9BUY5 554 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 HOXD1Q9GZZ0 328 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 ZNF304Q9HCX3 659 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 MED31Q9Y3C7 131 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 OR10H1Q9Y4A9 318 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 MAU2Q9Y6X3 613 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 PCSK5Q92824 1860 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 A0A1B0GWA3 101 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 EFCAB9A8MZ26 197 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 M0R3G1 203 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 SURF4O15260 269 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 NTN1O95631 604 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 ADRA2AP08913 450 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 PPICP45877 212 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 OR1D4P47884 311 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 SERPINB10P48595 397 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 RAB40BQ12829 278 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 ARMCX4Q5H9R4 360 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 FAM71CQ8NEG0 241 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 OR14A16Q8NHC5 309 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 RFKQ969G6 155 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 OSGIN2Q9Y236 505 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 ERGIC3Q9Y282 383 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 FRG2CA6NGY1 282 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 SERINC4A6NH21 518 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 AIREO43918 545 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 IGKV3-11P04433 115 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 IFI30P13284 250 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 NR4A1P22736 598 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 RORAP35398 523 aa15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.7 ms