RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409189.7

CCL20-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 839 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-202ENST00000409189 ADAMTS15Q8TE58 950 aa6□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 RAB8BQ92930 207 aa6□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 UCN3Q969E3 161 aa6□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 ZNF566Q969W8 418 aa6□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 CTHRC1Q96CG8 243 aa6□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 PRRC1Q96M27 445 aa6□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 C5orf34Q96MH7 638 aa6□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 NEU1Q99519 415 aa6□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 ARHGDIGQ99819 225 aa6□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 APOL4Q9BPW4 351 aa6□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 ING2Q9H160 280 aa6□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 SLC38A1Q9H2H9 487 aa6□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 LRRN3Q9H3W5 708 aa6□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 PIGUQ9H490 435 aa6□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 ANKRD19PQ9H560 264 aa6□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 KRT84Q9NSB2 600 aa6□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 CUTCQ9NTM9 273 aa6□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 KLHL28Q9NXS3 571 aa6□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 MAT2BQ9NZL9 334 aa6□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 LUZP4Q9P127 313 aa6□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 SLC13A4Q9UKG4 626 aa6□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 CDC14AQ9UNH5 594 aa6□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 U3KQV3 271 aa6□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 VPS13CQ709C8 3753 aa6□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 A0A087WXM4 84 aa5.99□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 A0A1B0GX78 115 aa5.99□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 A0A1W2PRQ8 180 aa5.99□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 A0A1W2PS29 197 aa5.99□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 TRIM64CA6NLI5 447 aa5.99□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 TMEM150CB9EJG8 249 aa5.99□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 H3BMH7 237 aa5.99□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 I3L1I5 382 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 DSCR3O14972 297 aa5.99□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 CHST10O43529 356 aa5.99□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 HCRTR1O43613 425 aa5.99□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 RAD1O60671 282 aa5.99□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 CTNSO60931 367 aa5.99□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 OR2B3O76000 313 aa5.99□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 CCNB2O95067 398 aa5.99□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 GADD45GO95257 159 aa5.99□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 NADKO95544 446 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 CLPTM1O96005 669 aa5.99□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 GNAO1P09471 354 aa5.99□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 ALOX5P09917 674 aa5.99□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 HKR1P10072 659 aa5.99□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 NELFEP18615 380 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 AGXTP21549 392 aa5.99□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 NT5EP21589 574 aa5.99□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 ALDH4A1P30038 563 aa5.99□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 IFNA8P32881 189 aa5.99□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 RYKP34925 604 aa5.99□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 PIGAP37287 484 aa5.99□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 RPL5P46777 297 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 STT3AP46977 705 aa5.99□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 PRKAG1P54619 331 aa5.99□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 NR1H2P55055 460 aa5.99□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 OR1D5P58170 312 aa5.99□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 PSPHP78330 225 aa5.99□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 ACY1Q03154 408 aa5.99□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 DGCR6Q14129 220 aa5.99□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 SYPL1Q16563 259 aa5.99□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 ZSWIM7Q19AV6 140 aa5.99□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 MICAQ29983 383 aa5.99□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 ZNF750Q32MQ0 723 aa5.99□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa5.99□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 GPAT3Q53EU6 434 aa5.99□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 ABHD17BQ5VST6 288 aa5.99□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 TBPL2Q6SJ96 375 aa5.99□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 FRRS1Q6ZNA5 592 aa5.99□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 QSOX2Q6ZRP7 698 aa5.99□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa5.99□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 HS3ST5Q8IZT8 346 aa5.99□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 ZNF619Q8N2I2 560 aa5.99□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 ZNF786Q8N393 782 aa5.99□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 COX18Q8N8Q8 333 aa5.99□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 Q8NA96 180 aa5.99□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 SMYD1Q8NB12 490 aa5.99□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa5.99□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 TSPAN14Q8NG11 270 aa5.99□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa5.99□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 GIPC3Q8TF64 312 aa5.99□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55 ms