RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 THBS4P35443 961 aa16.69■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 SLC1A3P43003 542 aa16.69■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 ASMTP46597 345 aa16.69■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 HGFACQ04756 655 aa16.69■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 ADRM1Q16186 407 aa16.69■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 TBRG1Q3YBR2 411 aa16.69■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 USP43Q70EL4 1123 aa16.69■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 CARM1Q86X55 608 aa16.69■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 ADGRG3Q86Y34 549 aa16.69■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 OR5D16Q8NGK9 328 aa16.69■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 OR2T11Q8NH01 316 aa16.69■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 CLDND2Q8NHS1 167 aa16.69■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 BOD1Q96IK1 185 aa16.69■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 FCMRO60667 390 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 UGT2B17O75795 530 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 URI1O94763 535 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 GSTA1P08263 222 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 CECR9P0C854 216 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 DDX5P17844 614 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 TUBA1BP68363 451 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 TUBA4AP68366 448 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 SCGB2A2Q13296 93 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 SLC17A1Q14916 467 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF141Q15928 474 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 CLEC6AQ6EIG7 209 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 TIFABQ6ZNK6 161 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 TUBA1AQ71U36 451 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 SPATA21Q7Z572 469 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 RELL1Q8IUW5 271 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF563Q8TA94 476 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 MTERF3Q96E29 417 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 LRRC37BQ96QE4 947 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF747Q9BV97 191 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 NMUR2Q9GZQ4 415 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 NARFLQ9H6Q4 476 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 OBP2BQ9NPH6 170 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM181Q9P2C4 612 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 USP22Q9UPT9 525 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 A0A0G2JK05 382 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 SLC28A1O00337 649 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 NR5A2O00482 541 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 MSMBP08118 114 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 KRT16P08779 473 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 UROSP10746 265 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 IMPDH2P12268 514 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 NPR2P20594 1047 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 EPHA1P21709 976 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 KHKP50053 298 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 RPL38P63173 70 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 IL1RL1Q01638 556 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 CDK20Q8IZL9 346 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 ZIC4Q8N9L1 334 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 OR7A2PQ8NGA2 310 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 OR4F15Q8NGB8 312 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 OR56A1Q8NGH5 318 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 OR1K1Q8NGR3 316 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 TPK1Q9H3S4 243 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 ATP6V1HQ9UI12 483 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 MKLN1Q9UL63 735 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 TRAPPC4Q9Y296 219 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 G3V2L1 256 aa16.66■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 LGI1O95970 557 aa16.66■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 AVPP01185 164 aa16.66■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 LAMP1P11279 417 aa16.66■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 RYKP34925 604 aa16.66■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 PGM1P36871 562 aa16.66■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 LIMS1P48059 325 aa16.66■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 CLK1P49759 484 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 MAPK14Q16539 360 aa16.66■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 SPDYE7PQ495Y7 208 aa16.66■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 FRMD7Q6ZUT3 714 aa16.66■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 AAED1Q7RTV5 226 aa16.66■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 GRINAQ7Z429 371 aa16.66■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 NUP37Q8NFH4 326 aa16.66■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 PSMA8Q8TAA3 256 aa16.66■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 OR5P2Q8WZ92 322 aa16.66■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM45BQ96B21 275 aa16.66■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 FAHD2AQ96GK7 314 aa16.66■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 JMJD8Q96S16 334 aa16.66■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF442Q9H7R0 627 aa16.66■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 DYNLRB1Q9NP97 96 aa16.66■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM45AQ9NWC5 275 aa16.66■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 H3BQF6 201 aa16.65■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 WNT9BO14905 357 aa16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18 ms