RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000387416.2

MT-TS1-201, Transcript of mitochondrially encoded tRNA serine 1 (UCN), humanhuman

BASIC

Gene MT-TS1, Length 69 nt, Biotype Mt tRNA, Subcellular localisation Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-TS1-201ENST00000387416 OR2B6P58173 313 aa7.57□□□□□ -1.2
MT-TS1-201ENST00000387416 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
MT-TS1-201ENST00000387416 NFYCQ13952 458 aa7.57□□□□□ -1.2
MT-TS1-201ENST00000387416 SCARB2Q14108 478 aa7.57□□□□□ -1.2
MT-TS1-201ENST00000387416 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa7.57□□□□□ -1.2
MT-TS1-201ENST00000387416 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
MT-TS1-201ENST00000387416 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa7.57□□□□□ -1.2
MT-TS1-201ENST00000387416 STAC2Q6ZMT1 411 aa7.57□□□□□ -1.2
MT-TS1-201ENST00000387416 Q6ZT83 130 aa7.57□□□□□ -1.2
MT-TS1-201ENST00000387416 DHDDSQ86SQ9 333 aa7.57□□□□□ -1.2
MT-TS1-201ENST00000387416 CDC20BQ86Y33 519 aa7.57□□□□□ -1.2
MT-TS1-201ENST00000387416 MSRB3Q8IXL7 192 aa7.57□□□□□ -1.2
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF100Q8IYN0 542 aa7.57□□□□□ -1.2
MT-TS1-201ENST00000387416 CLIP4Q8N3C7 705 aa7.57□□□□□ -1.2
MT-TS1-201ENST00000387416 C11orf65Q8NCR3 313 aa7.57□□□□□ -1.2
MT-TS1-201ENST00000387416 HIPK4Q8NE63 616 aa7.57□□□□□ -1.2
MT-TS1-201ENST00000387416 STK35Q8TDR2 534 aa7.57□□□□□ -1.2
MT-TS1-201ENST00000387416 ABHD3Q8WU67 409 aa7.57□□□□□ -1.2
MT-TS1-201ENST00000387416 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
MT-TS1-201ENST00000387416 HSD17B8Q92506 261 aa7.57□□□□□ -1.2
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF524Q96C55 264 aa7.57□□□□□ -1.2
MT-TS1-201ENST00000387416 ANKRD27Q96NW4 1050 aa7.57□□□□□ -1.2
MT-TS1-201ENST00000387416 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa7.57□□□□□ -1.2
MT-TS1-201ENST00000387416 PSD2Q9BQI7 771 aa7.57□□□□□ -1.2
MT-TS1-201ENST00000387416 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa7.57□□□□□ -1.2
MT-TS1-201ENST00000387416 KLHL4Q9C0H6 718 aa7.57□□□□□ -1.2
MT-TS1-201ENST00000387416 SLAMF8Q9P0V8 285 aa7.57□□□□□ -1.2
MT-TS1-201ENST00000387416 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa7.57□□□□□ -1.2
MT-TS1-201ENST00000387416 SLC13A4Q9UKG4 626 aa7.57□□□□□ -1.2
MT-TS1-201ENST00000387416 CLEC4AQ9UMR7 237 aa7.57□□□□□ -1.2
MT-TS1-201ENST00000387416 ANGPT4Q9Y264 503 aa7.57□□□□□ -1.2
MT-TS1-201ENST00000387416 CADP27708 2225 aa7.56□□□□□ -1.2
MT-TS1-201ENST00000387416 PLCE1Q9P212 2302 aa7.56□□□□□ -1.2
MT-TS1-201ENST00000387416 PRR14LQ5THK1 2151 aa7.56□□□□□ -1.2
MT-TS1-201ENST00000387416 AP3D1O14617 1153 aa7.56□□□□□ -1.2
MT-TS1-201ENST00000387416 ADAM11O75078 769 aa7.56□□□□□ -1.2
MT-TS1-201ENST00000387416 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
MT-TS1-201ENST00000387416 HRGP04196 525 aa7.56□□□□□ -1.2
MT-TS1-201ENST00000387416 FESP07332 822 aa7.56□□□□□ -1.2
MT-TS1-201ENST00000387416 C8BP07358 591 aa7.56□□□□□ -1.2
MT-TS1-201ENST00000387416 NUDT7P0C024 238 aa7.56□□□□□ -1.2
MT-TS1-201ENST00000387416 PNMTP11086 282 aa7.56□□□□□ -1.2
MT-TS1-201ENST00000387416 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
MT-TS1-201ENST00000387416 IDUAP35475 653 aa7.56□□□□□ -1.2
MT-TS1-201ENST00000387416 MDH1P40925 334 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
MT-TS1-201ENST00000387416 NR1H2P55055 460 aa7.56□□□□□ -1.2
MT-TS1-201ENST00000387416 H3F3AP84243 136 aa7.56□□□□□ -1.2
MT-TS1-201ENST00000387416 PLAURQ03405 335 aa7.56□□□□□ -1.2
MT-TS1-201ENST00000387416 ITGADQ13349 1161 aa7.56□□□□□ -1.2
MT-TS1-201ENST00000387416 MFSD13AQ14CX5 517 aa7.56□□□□□ -1.2
MT-TS1-201ENST00000387416 CYP51A1Q16850 503 aa7.56□□□□□ -1.2
MT-TS1-201ENST00000387416 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
MT-TS1-201ENST00000387416 MMEL1Q495T6 779 aa7.56□□□□□ -1.2
MT-TS1-201ENST00000387416 BEX5Q5H9J7 111 aa7.56□□□□□ -1.2
MT-TS1-201ENST00000387416 SFRP5Q5T4F7 317 aa7.56□□□□□ -1.2
MT-TS1-201ENST00000387416 FAM91A1Q658Y4 838 aa7.56□□□□□ -1.2
MT-TS1-201ENST00000387416 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa7.56□□□□□ -1.2
MT-TS1-201ENST00000387416 PAQR6Q6TCH4 344 aa7.56□□□□□ -1.2
MT-TS1-201ENST00000387416 TFAP2EQ6VUC0 442 aa7.56□□□□□ -1.2
MT-TS1-201ENST00000387416 SPNS3Q6ZMD2 512 aa7.56□□□□□ -1.2
MT-TS1-201ENST00000387416 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
MT-TS1-201ENST00000387416 HMGN2P46Q86SG4 172 aa7.56□□□□□ -1.2
MT-TS1-201ENST00000387416 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
MT-TS1-201ENST00000387416 SERPINA11Q86U17 422 aa7.56□□□□□ -1.2
MT-TS1-201ENST00000387416 P2RY8Q86VZ1 359 aa7.56□□□□□ -1.2
MT-TS1-201ENST00000387416 ARMC8Q8IUR7 673 aa7.56□□□□□ -1.2
MT-TS1-201ENST00000387416 GABRG1Q8N1C3 465 aa7.56□□□□□ -1.2
MT-TS1-201ENST00000387416 CADM2Q8N3J6 435 aa7.56□□□□□ -1.2
MT-TS1-201ENST00000387416 LSMEM1Q8N8F7 131 aa7.56□□□□□ -1.2
MT-TS1-201ENST00000387416 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa7.56□□□□□ -1.2
MT-TS1-201ENST00000387416 NFKBIDQ8NI38 313 aa7.56□□□□□ -1.2
MT-TS1-201ENST00000387416 RASSF5Q8WWW0 418 aa7.56□□□□□ -1.2
MT-TS1-201ENST00000387416 MAL2Q969L2 176 aa7.56□□□□□ -1.2
MT-TS1-201ENST00000387416 MBD6Q96DN6 1003 aa7.56□□□□□ -1.2
MT-TS1-201ENST00000387416 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
MT-TS1-201ENST00000387416 ARL5BQ96KC2 179 aa7.56□□□□□ -1.2
MT-TS1-201ENST00000387416 FOXC2Q99958 501 aa7.56□□□□□ -1.2
MT-TS1-201ENST00000387416 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
MT-TS1-201ENST00000387416 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
MT-TS1-201ENST00000387416 TAPBPLQ9BX59 468 aa7.56□□□□□ -1.2
MT-TS1-201ENST00000387416 C12orf49Q9H741 205 aa7.56□□□□□ -1.2
MT-TS1-201ENST00000387416 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa7.56□□□□□ -1.2
MT-TS1-201ENST00000387416 RLIMQ9NVW2 624 aa7.56□□□□□ -1.2
MT-TS1-201ENST00000387416 SELENONQ9NZV5 590 aa7.56□□□□□ -1.2
MT-TS1-201ENST00000387416 KLHL14Q9P2G3 628 aa7.56□□□□□ -1.2
MT-TS1-201ENST00000387416 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa7.56□□□□□ -1.2
MT-TS1-201ENST00000387416 AP3M1Q9Y2T2 418 aa7.56□□□□□ -1.2
MT-TS1-201ENST00000387416 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
MT-TS1-201ENST00000387416 ACANP16112 2415 aa7.56□□□□□ -1.2
MT-TS1-201ENST00000387416 MED13LQ71F56 2210 aa7.55□□□□□ -1.2
MT-TS1-201ENST00000387416 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
MT-TS1-201ENST00000387416 TMEM72A0PK05 275 aa7.55□□□□□ -1.2
MT-TS1-201ENST00000387416 OR6C65A6NJZ3 312 aa7.55□□□□□ -1.2
MT-TS1-201ENST00000387416 LIPT2A6NK58 231 aa7.55□□□□□ -1.2
MT-TS1-201ENST00000387416 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
MT-TS1-201ENST00000387416 OR2T1O43869 369 aa7.55□□□□□ -1.2
MT-TS1-201ENST00000387416 FMO6PO60774 539 aa7.55□□□□□ -1.2
MT-TS1-201ENST00000387416 CCDC22O60826 627 aa7.55□□□□□ -1.2
MT-TS1-201ENST00000387416 TMCC2O75069 709 aa7.55□□□□□ -1.2
MT-TS1-201ENST00000387416 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms