RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 BMP7P18075 431 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 GATA3P23771 443 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 ARRB2P32121 409 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 TIMP3P35625 211 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 CXCR3P49682 368 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 RAB5CP51148 216 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 AKR1C2P52895 323 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 AKR1C1Q04828 323 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 PRKCDQ05655 676 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 TTLL4Q14679 1199 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 PDZD11Q5EBL8 140 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 SAMD13Q5VXD3 122 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF529Q6P280 563 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 MOB2Q70IA6 237 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 SPRED2Q7Z698 418 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 C1orf216Q8TAB5 229 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 GHSRQ92847 366 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 COQ8BQ96D53 544 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 RAB18Q9NP72 206 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 PDGFCQ9NRA1 345 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 SCN3BQ9NY72 215 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 TRBC2A0A5B9 178 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM86C2PA6NEL3 165 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 TUBAL3A6NHL2 446 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 C4orf47A7E2U8 309 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 C9J4A7 227 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 ACOT8O14734 319 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 UBDO15205 165 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 KIAA0513O60268 411 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 RP2O75695 350 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 HOXC6P09630 235 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 PNMTP11086 282 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 HIST1H2ADP20671 130 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 ADCYAP1R1P41586 468 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 TECP42680 631 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 GCLMP48507 274 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 RAB25P57735 213 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 ST8SIA6P61647 398 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 DPYSL3Q14195 570 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 PHF19Q5T6S3 580 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 DRAM2Q6UX65 266 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 VRK3Q8IV63 474 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 CBR4Q8N4T8 237 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 SMIM20Q8N5G0 67 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 RNF152Q8N8N0 203 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 OR5M9Q8NGP3 310 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 OTULINQ96BN8 352 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC6A18Q96N87 628 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 PHB2Q99623 299 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 HIST1H2AJQ99878 128 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 ASCL2Q99929 193 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 NECTIN3Q9NQS3 549 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 KPTNQ9Y664 436 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 G3V3G9 751 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 IFNA5P01569 189 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 ACRP10323 421 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 AKAP5P24588 427 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 BTN3A2P78410 334 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 HMGCS1Q01581 520 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 CHRNB3Q05901 458 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF234Q14588 700 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 DCAF8Q5TAQ9 597 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 LIPMQ5VYY2 423 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 PLCXD3Q63HM9 321 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 C16orf46Q6P387 395 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 NPNTQ6UXI9 565 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 C10orf107Q8IVU9 208 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 DNAAF1Q8NEP3 725 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 OR52B6Q8NGF0 335 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 SEMA4DQ92854 862 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 LGALS12Q96DT0 336 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 C4orf36Q96KX1 117 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 CAPNS2Q96L46 248 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 MSL2Q9HCI7 577 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 FBXO7Q9Y3I1 522 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 ATRNL1Q5VV63 1379 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 F5H6K3 240 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 F6UZH7 168 aa6.29□□□□□ -1.4
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