RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380221.7

TRAPPC10-202, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC10, Length 1,763 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZFP64Q9NPA5 681 aa25.13■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 RFPL3SP0C7P2 107 aa25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 ATP6V1B1P15313 513 aa25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 CCNA2P20248 432 aa25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 DPP4P27487 766 aa25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 FOXK1P85037 733 aa25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 FOXF1Q12946 379 aa25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 APOFQ13790 326 aa25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 C6orf141Q5SZD1 244 aa25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 CD300LDQ6UXZ3 194 aa25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 CNIH3Q8TBE1 160 aa25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 PIGXQ8TBF5 258 aa25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 EXTL1Q92935 676 aa25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 HS6ST2Q96MM7 605 aa25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 GPA33Q99795 319 aa25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 ADNPQ9H2P0 1102 aa25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 MGAQ8IWI9 3026 aa25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 RFC3P40938 356 aa25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 NUP107P57740 925 aa25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 COX10Q12887 443 aa25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 CDK5R2Q13319 367 aa25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 C12orf10Q9HB07 376 aa25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 NCKAP5O14513 1909 aa25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 DPPA5A6NC42 116 aa25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 SOX14O95416 240 aa25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 CLPTM1O96005 669 aa25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 PDGFAP04085 211 aa25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 CXCR1P25024 350 aa25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 POU1F1P28069 291 aa25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 RBM34P42696 430 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 LAIR2Q6ISS4 152 aa25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 ADGRG3Q86Y34 549 aa25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 OR5M1Q8NGP8 315 aa25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 POC1BQ8TC44 478 aa25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 C20orf141Q9NUB4 165 aa25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 TRIM64A6NGJ6 449 aa25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 GSTM3P21266 225 aa25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 HTR3AP46098 478 aa25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 OMPP47874 163 aa25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 MEOX1P50221 254 aa25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 CDH15P55291 814 aa25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 DLX5P56178 289 aa25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 TOMM20Q15388 145 aa25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 SLC25A53Q5H9E4 307 aa25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 FAM81AQ8TBF8 368 aa25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 DKKL1Q9UK85 242 aa25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 TMED7Q9Y3B3 224 aa25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 MED31Q9Y3C7 131 aa25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa25.09■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 A6NHS1 94 aa25.09■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZAR1LA6NP61 321 aa25.09■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa25.09■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 ENTHD1Q8IYW4 607 aa25.09■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 TMEM178AQ8NBL3 297 aa25.09■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 UBE2FQ969M7 185 aa25.09■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 MRGPRX4Q96LA9 322 aa25.09■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 AASSQ9UDR5 926 aa25.09■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 H3BN98 237 aa25.08■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 MKRN2OSH3BPM6 223 aa25.08■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 K7EM74 188 aa25.08■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZIC3O60481 467 aa25.08■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 TP53P04637 393 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 HK1P19367 917 aa25.08■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 EGR4Q05215 589 aa25.08■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 TMEM236Q5W0B7 351 aa25.08■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 IGFL3Q6UXB1 125 aa25.08■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZADH2Q8N4Q0 377 aa25.08■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 TM9SF4Q92544 642 aa25.08■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 UBQLN3Q9H347 655 aa25.08■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 RASSF1Q9NS23 344 aa25.08■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 RNF6Q9Y252 685 aa25.08■■□□□ 1.61
TRAPPC10-202ENST00000380221 A0A087WZY1 265 aa25.08■■□□□ 1.6
TRAPPC10-202ENST00000380221 TMEM72A0PK05 275 aa25.08■■□□□ 1.6
TRAPPC10-202ENST00000380221 SUSD5O60279 629 aa25.08■■□□□ 1.6
TRAPPC10-202ENST00000380221 IFI30P13284 250 aa25.08■■□□□ 1.6
TRAPPC10-202ENST00000380221 CRHBPP24387 322 aa25.08■■□□□ 1.6
TRAPPC10-202ENST00000380221 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.6
TRAPPC10-202ENST00000380221 GPR4P46093 362 aa25.08■■□□□ 1.6
TRAPPC10-202ENST00000380221 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.6
TRAPPC10-202ENST00000380221 TSPAN31Q12999 210 aa25.08■■□□□ 1.6
TRAPPC10-202ENST00000380221 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.6
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