RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325438.12

PACS2-201, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACS2, Length 3,708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS2-201ENST00000325438 SMIM4Q8WVI0 70 aa22.16■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 SOSTQ9BQB4 213 aa22.16■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 PRAMEF2O60811 474 aa22.16■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 MAKP20794 623 aa22.16■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 TNFRSF17Q02223 184 aa22.16■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 TEAD2Q15562 447 aa22.16■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 OR1Q1Q15612 314 aa22.16■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 LCTLQ6UWM7 567 aa22.16■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 THEM6Q8WUY1 208 aa22.16■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 RRAGCQ9HB90 399 aa22.16■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 V9GY05 133 aa22.16■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 GPNMBQ14956 572 aa22.15■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 TSSK4Q6SA08 328 aa22.15■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 PXT1Q8NFP0 134 aa22.15■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 OR4E2Q8NGC2 313 aa22.15■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 NDOR1Q9UHB4 597 aa22.15■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 LAMA3Q16787 3333 aa22.15■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa22.15■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 FOXRED2Q8IWF2 684 aa22.15■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 CHST4Q8NCG5 386 aa22.15■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 WNT2BQ93097 391 aa22.15■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 TCEAL4Q96EI5 215 aa22.15■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 MBD2Q9UBB5 411 aa22.15■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa22.15■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 E9PQ18 207 aa22.15■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 RPS27P42677 84 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 KCNAB1Q14722 419 aa22.15■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 SSX6Q7RTT6 188 aa22.15■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 RFLNBQ8N5W9 214 aa22.15■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 PEX11GQ96HA9 241 aa22.15■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 FOXN4Q96NZ1 517 aa22.15■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 ACTRT3Q9BYD9 372 aa22.15■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 EVA1AQ9H8M9 152 aa22.15■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 SLC23A2Q9UGH3 650 aa22.15■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa22.15■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 OR8G3PP0DMU2 310 aa22.14■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 CDK2P24941 298 aa22.14■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 TMEM255AQ5JRV8 349 aa22.14■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 GATSQ8NAP1 163 aa22.14■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 OR51Q1Q8NH59 317 aa22.14■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 DIO2Q92813 273 aa22.14■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 LGR4Q9BXB1 951 aa22.14■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 BRCA2P51587 3418 aa22.14■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 ATG2BQ96BY7 2078 aa22.14■■□□□ 1.13
PACS2-201ENST00000325438 AGPAT2O15120 278 aa22.14■■□□□ 1.13
PACS2-201ENST00000325438 IFNGR1P15260 489 aa22.14■■□□□ 1.13
PACS2-201ENST00000325438 SRMP19623 302 aa22.14■■□□□ 1.13
PACS2-201ENST00000325438 GABRA3P34903 492 aa22.14■■□□□ 1.13
PACS2-201ENST00000325438 AQP2P41181 271 aa22.14■■□□□ 1.13
PACS2-201ENST00000325438 UBE2NLQ5JXB2 153 aa22.14■■□□□ 1.13
PACS2-201ENST00000325438 OR8D1Q8WZ84 308 aa22.14■■□□□ 1.13
PACS2-201ENST00000325438 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
PACS2-201ENST00000325438 TMEM231Q9H6L2 316 aa22.14■■□□□ 1.13
PACS2-201ENST00000325438 FKRPQ9H9S5 495 aa22.14■■□□□ 1.13
PACS2-201ENST00000325438 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
PACS2-201ENST00000325438 SUSD5O60279 629 aa22.14■■□□□ 1.13
PACS2-201ENST00000325438 OR10H2O60403 315 aa22.14■■□□□ 1.13
PACS2-201ENST00000325438 SYN1P17600 705 aa22.14■■□□□ 1.13
PACS2-201ENST00000325438 SLC6A6P31641 620 aa22.14■■□□□ 1.13
PACS2-201ENST00000325438 CBFBQ13951 182 aa22.14■■□□□ 1.13
PACS2-201ENST00000325438 DECR1Q16698 335 aa22.14■■□□□ 1.13
PACS2-201ENST00000325438 EIPR1Q53HC9 387 aa22.14■■□□□ 1.13
PACS2-201ENST00000325438 HACD4Q5VWC8 232 aa22.14■■□□□ 1.13
PACS2-201ENST00000325438 SLC35F2Q8IXU6 374 aa22.14■■□□□ 1.13
PACS2-201ENST00000325438 OR51S1Q8NGJ8 323 aa22.14■■□□□ 1.13
PACS2-201ENST00000325438 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
PACS2-201ENST00000325438 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
PACS2-201ENST00000325438 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
PACS2-201ENST00000325438 PEX12O00623 359 aa22.13■■□□□ 1.13
PACS2-201ENST00000325438 SOD2P04179 222 aa22.13■■□□□ 1.13
PACS2-201ENST00000325438 CLRN3Q8NCR9 226 aa22.13■■□□□ 1.13
PACS2-201ENST00000325438 THAP6Q8TBB0 222 aa22.13■■□□□ 1.13
PACS2-201ENST00000325438 DOCK6Q96HP0 2047 aa22.13■■□□□ 1.13
PACS2-201ENST00000325438 TVP23AA6NH52 213 aa22.13■■□□□ 1.13
PACS2-201ENST00000325438 ACOT7O00154 380 aa22.13■■□□□ 1.13
PACS2-201ENST00000325438 SELENOFO60613 162 aa22.13■■□□□ 1.13
PACS2-201ENST00000325438 CXCL14O95715 111 aa22.13■■□□□ 1.13
PACS2-201ENST00000325438 GIPP09681 153 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
PACS2-201ENST00000325438 GAS6Q14393 721 aa22.13■■□□□ 1.13
PACS2-201ENST00000325438 C17orf99Q6UX52 265 aa22.13■■□□□ 1.13
PACS2-201ENST00000325438 DTD2Q96FN9 168 aa22.13■■□□□ 1.13
PACS2-201ENST00000325438 SLC35A4Q96G79 324 aa22.13■■□□□ 1.13
PACS2-201ENST00000325438 ATG5Q9H1Y0 275 aa22.13■■□□□ 1.13
PACS2-201ENST00000325438 NRIP3Q9NQ35 241 aa22.13■■□□□ 1.13
PACS2-201ENST00000325438 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa22.13■■□□□ 1.13
PACS2-201ENST00000325438 KCNMB2Q9Y691 235 aa22.13■■□□□ 1.13
PACS2-201ENST00000325438 PRNPP04156 253 aa22.13■■□□□ 1.13
PACS2-201ENST00000325438 GLAP06280 429 aa22.13■■□□□ 1.13
PACS2-201ENST00000325438 CTSLP07711 333 aa22.13■■□□□ 1.13
PACS2-201ENST00000325438 HPGDP15428 266 aa22.13■■□□□ 1.13
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