RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325103.10

HPS1-201, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene HPS1, Length 3,703 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-201ENST00000325103 TMEM99Q8N816 258 aa11.89□□□□□ -0.51
HPS1-201ENST00000325103 OR6N2Q8NGY6 317 aa11.89□□□□□ -0.51
HPS1-201ENST00000325103 MOSPD2Q8NHP6 518 aa11.89□□□□□ -0.51
HPS1-201ENST00000325103 MVB12AQ96EY5 273 aa11.89□□□□□ -0.51
HPS1-201ENST00000325103 ANKRD19PQ9H560 264 aa11.89□□□□□ -0.51
HPS1-201ENST00000325103 ERVK13-1Q9NX77 482 aa11.89□□□□□ -0.51
HPS1-201ENST00000325103 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa11.89□□□□□ -0.51
HPS1-201ENST00000325103 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
HPS1-201ENST00000325103 PPM1BO75688 479 aa11.89□□□□□ -0.51
HPS1-201ENST00000325103 GPX5O75715 221 aa11.89□□□□□ -0.51
HPS1-201ENST00000325103 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
HPS1-201ENST00000325103 RORCP51449 518 aa11.89□□□□□ -0.51
HPS1-201ENST00000325103 SIGLEC14Q08ET2 396 aa11.89□□□□□ -0.51
HPS1-201ENST00000325103 PYDC2Q56P42 97 aa11.89□□□□□ -0.51
HPS1-201ENST00000325103 ARMC4Q5T2S8 1044 aa11.89□□□□□ -0.51
HPS1-201ENST00000325103 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa11.89□□□□□ -0.51
HPS1-201ENST00000325103 RPTNQ6XPR3 784 aa11.89□□□□□ -0.51
HPS1-201ENST00000325103 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
HPS1-201ENST00000325103 ZNF511Q8NB15 262 aa11.89□□□□□ -0.51
HPS1-201ENST00000325103 OR7G1Q8NGA0 311 aa11.89□□□□□ -0.51
HPS1-201ENST00000325103 FKBP10Q96AY3 582 aa11.89□□□□□ -0.51
HPS1-201ENST00000325103 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
HPS1-201ENST00000325103 WWTR1Q9GZV5 400 aa11.89□□□□□ -0.51
HPS1-201ENST00000325103 IL20Q9NYY1 176 aa11.89□□□□□ -0.51
HPS1-201ENST00000325103 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
HPS1-201ENST00000325103 A0A0B4J2E0 115 aa11.89□□□□□ -0.51
HPS1-201ENST00000325103 A0A1B0GX12 115 aa11.89□□□□□ -0.51
HPS1-201ENST00000325103 SLC22A31A6NKX4 558 aa11.89□□□□□ -0.51
HPS1-201ENST00000325103 NCR1O76036 304 aa11.89□□□□□ -0.51
HPS1-201ENST00000325103 ABCD3P28288 659 aa11.89□□□□□ -0.51
HPS1-201ENST00000325103 FGFBP1Q14512 234 aa11.89□□□□□ -0.51
HPS1-201ENST00000325103 INSL4Q14641 139 aa11.89□□□□□ -0.51
HPS1-201ENST00000325103 OCLNQ16625 522 aa11.89□□□□□ -0.51
HPS1-201ENST00000325103 TMEM44Q2T9K0 475 aa11.89□□□□□ -0.51
HPS1-201ENST00000325103 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
HPS1-201ENST00000325103 OR4K17Q8NGC6 315 aa11.89□□□□□ -0.51
HPS1-201ENST00000325103 OPALINQ96PE5 141 aa11.89□□□□□ -0.51
HPS1-201ENST00000325103 PRSS27Q9BQR3 290 aa11.89□□□□□ -0.51
HPS1-201ENST00000325103 UCK1Q9HA47 277 aa11.89□□□□□ -0.51
HPS1-201ENST00000325103 TIGARQ9NQ88 270 aa11.89□□□□□ -0.51
HPS1-201ENST00000325103 GPR27Q9NS67 375 aa11.89□□□□□ -0.51
HPS1-201ENST00000325103 LANCL2Q9NS86 450 aa11.89□□□□□ -0.51
HPS1-201ENST00000325103 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
HPS1-201ENST00000325103 PILRBQ9UKJ0 227 aa11.89□□□□□ -0.51
HPS1-201ENST00000325103 STUB1Q9UNE7 303 aa11.89□□□□□ -0.51
HPS1-201ENST00000325103 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa11.89□□□□□ -0.51
HPS1-201ENST00000325103 DSPPQ9NZW4 1301 aa11.89□□□□□ -0.51
HPS1-201ENST00000325103 HBQ1P09105 142 aa11.88□□□□□ -0.51
HPS1-201ENST00000325103 EDNRAP25101 427 aa11.88□□□□□ -0.51
HPS1-201ENST00000325103 FUT7Q11130 342 aa11.88□□□□□ -0.51
HPS1-201ENST00000325103 NEIL3Q8TAT5 605 aa11.88□□□□□ -0.51
HPS1-201ENST00000325103 C4orf36Q96KX1 117 aa11.88□□□□□ -0.51
HPS1-201ENST00000325103 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
HPS1-201ENST00000325103 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
HPS1-201ENST00000325103 POLE3Q9NRF9 147 aa11.88□□□□□ -0.51
HPS1-201ENST00000325103 TAS2R10Q9NYW0 307 aa11.88□□□□□ -0.51
HPS1-201ENST00000325103 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa11.88□□□□□ -0.51
HPS1-201ENST00000325103 MASP2O00187 686 aa11.88□□□□□ -0.51
HPS1-201ENST00000325103 TFECO14948 347 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
HPS1-201ENST00000325103 GABRB1P18505 474 aa11.88□□□□□ -0.51
HPS1-201ENST00000325103 TUBA1BP68363 451 aa11.88□□□□□ -0.51
HPS1-201ENST00000325103 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa11.88□□□□□ -0.51
HPS1-201ENST00000325103 TUBA1AQ71U36 451 aa11.88□□□□□ -0.51
HPS1-201ENST00000325103 SAP25Q8TEE9 199 aa11.88□□□□□ -0.51
HPS1-201ENST00000325103 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
HPS1-201ENST00000325103 TRIM36Q9NQ86 728 aa11.88□□□□□ -0.51
HPS1-201ENST00000325103 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
HPS1-201ENST00000325103 RAD1O60671 282 aa11.88□□□□□ -0.51
HPS1-201ENST00000325103 DRD5P21918 477 aa11.88□□□□□ -0.51
HPS1-201ENST00000325103 SNTA1Q13424 505 aa11.88□□□□□ -0.51
HPS1-201ENST00000325103 C1QL3Q5VWW1 255 aa11.88□□□□□ -0.51
HPS1-201ENST00000325103 LYPD4Q6UWN0 246 aa11.88□□□□□ -0.51
HPS1-201ENST00000325103 APOOLQ6UXV4 268 aa11.88□□□□□ -0.51
HPS1-201ENST00000325103 FAM220AQ7Z4H9 259 aa11.88□□□□□ -0.51
HPS1-201ENST00000325103 ZNF440Q8IYI8 595 aa11.88□□□□□ -0.51
HPS1-201ENST00000325103 SIRT6Q8N6T7 355 aa11.88□□□□□ -0.51
HPS1-201ENST00000325103 NANOGP1Q8N7R0 232 aa11.88□□□□□ -0.51
HPS1-201ENST00000325103 ZNF615Q8N8J6 731 aa11.88□□□□□ -0.51
HPS1-201ENST00000325103 GALNT6Q8NCL4 622 aa11.88□□□□□ -0.51
HPS1-201ENST00000325103 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
HPS1-201ENST00000325103 OR8K3Q8NH51 312 aa11.88□□□□□ -0.51
HPS1-201ENST00000325103 ZNF671Q8TAW3 534 aa11.88□□□□□ -0.51
HPS1-201ENST00000325103 CDCA4Q9BXL8 241 aa11.88□□□□□ -0.51
HPS1-201ENST00000325103 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
HPS1-201ENST00000325103 SIGLEC7Q9Y286 467 aa11.88□□□□□ -0.51
HPS1-201ENST00000325103 A0A1B0GVC2 190 aa11.87□□□□□ -0.51
HPS1-201ENST00000325103 A6NIN4 97 aa11.87□□□□□ -0.51
HPS1-201ENST00000325103 FMO6PO60774 539 aa11.87□□□□□ -0.51
HPS1-201ENST00000325103 RENP00797 406 aa11.87□□□□□ -0.51
HPS1-201ENST00000325103 MT-ND5P03915 603 aa11.87□□□□□ -0.51
HPS1-201ENST00000325103 BMP4P12644 408 aa11.87□□□□□ -0.51
HPS1-201ENST00000325103 IDUAP35475 653 aa11.87□□□□□ -0.51
HPS1-201ENST00000325103 SOX2P48431 317 aa11.87□□□□□ -0.51
HPS1-201ENST00000325103 DEFA1P59665 94 aa11.87□□□□□ -0.51
HPS1-201ENST00000325103 DEFA3P59666 94 aa11.87□□□□□ -0.51
HPS1-201ENST00000325103 RNF4P78317 190 aa11.87□□□□□ -0.51
HPS1-201ENST00000325103 EBPQ15125 230 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
HPS1-201ENST00000325103 QPRTQ15274 297 aa11.87□□□□□ -0.51
HPS1-201ENST00000325103 NXNL2Q5VZ03 156 aa11.87□□□□□ -0.51
HPS1-201ENST00000325103 C9orf40Q8IXQ3 194 aa11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.4 ms