RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 ACP2P11117 423 aa6.82□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 UQCRBP14927 111 aa6.82□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 PRTN3P24158 256 aa6.82□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 MAGEA4P43358 317 aa6.82□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 HTR3AP46098 478 aa6.82□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 EVX1P49640 407 aa6.82□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 SERPINB9P50453 376 aa6.82□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 MAP2K6P52564 334 aa6.82□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 OR2B6P58173 313 aa6.82□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 RPS23P62266 143 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 TEKQ02763 1124 aa6.82□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 TRIP10Q15642 601 aa6.82□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 CCNJQ5T5M9 372 aa6.82□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 DCAF12L2Q5VW00 463 aa6.82□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa6.82□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 ANKRD16Q6P6B7 361 aa6.82□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 AAED1Q7RTV5 226 aa6.82□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 GRINAQ7Z429 371 aa6.82□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC36Q8IYA8 594 aa6.82□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 CNPY4Q8N129 248 aa6.82□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC35F6Q8N357 371 aa6.82□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 NATD1Q8N6N6 113 aa6.82□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 SYT14Q8NB59 555 aa6.82□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 OR56A1Q8NGH5 318 aa6.82□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 CLDND2Q8NHS1 167 aa6.82□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 OIT3Q8WWZ8 545 aa6.82□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC25A28Q96A46 364 aa6.82□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 MOAP1Q96BY2 351 aa6.82□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 DDIT4LQ96D03 193 aa6.82□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 BOD1Q96IK1 185 aa6.82□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 DOK1Q99704 481 aa6.82□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC6A7Q99884 636 aa6.82□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 ERP44Q9BS26 406 aa6.82□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 LAT2Q9GZY6 243 aa6.82□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa6.82□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 SH3BP4Q9P0V3 963 aa6.82□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM181Q9P2C4 612 aa6.82□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 CHRNA9Q9UGM1 479 aa6.82□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 PCDHGB4Q9UN71 923 aa6.82□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 CORINQ9Y5Q5 1042 aa6.82□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa6.82□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 LOC105371242A0A075B767 164 aa6.81□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 A8MT66 165 aa6.81□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 PDLIM1O00151 329 aa6.81□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 TIMM23O14925 209 aa6.81□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 PPIHO43447 177 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 H6PDO95479 791 aa6.81□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 CSTAP01040 98 aa6.81□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 CHN1P15882 459 aa6.81□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 EDNRAP25101 427 aa6.81□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 GCH1P30793 250 aa6.81□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 LSP1P33241 339 aa6.81□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 ARR3P36575 388 aa6.81□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 ASMTP46597 345 aa6.81□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 SESN3P58005 492 aa6.81□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 SELENOVP59797 346 aa6.81□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 GUCY2DQ02846 1103 aa6.81□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 LCP2Q13094 533 aa6.81□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 DAG1Q14118 895 aa6.81□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 TBRG1Q3YBR2 411 aa6.81□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 SPDYE7PQ495Y7 208 aa6.81□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 DCST2Q5T1A1 773 aa6.81□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 TSPO2Q5TGU0 170 aa6.81□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 SAXO2Q658L1 398 aa6.81□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 NOXRED1Q6NXP6 359 aa6.81□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 CDC73Q6P1J9 531 aa6.81□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 C17orf107Q6ZR85 190 aa6.81□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 LCA5Q86VQ0 697 aa6.81□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 RETREG3Q86VR2 466 aa6.81□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 LRRC8AQ8IWT6 810 aa6.81□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 MGARPQ8TDB4 240 aa6.81□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 CDS1Q92903 461 aa6.81□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 UBE2FQ969M7 185 aa6.81□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM45BQ96B21 275 aa6.81□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 MTERF3Q96E29 417 aa6.81□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 ACTRT3Q9BYD9 372 aa6.81□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 RAB17Q9H0T7 212 aa6.81□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 DPH5Q9H2P9 285 aa6.81□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 NARFLQ9H6Q4 476 aa6.81□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP6.81□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC7A10Q9NS82 523 aa6.81□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 ACER3Q9NUN7 267 aa6.81□□□□□ -1.32
PGGT1B-201ENST00000296642 REV1Q9UBZ9 1251 aa6.81□□□□□ -1.32
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