RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295718.6

PTPRN-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRN, Length 3,784 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-201ENST00000295718 PLCL2Q9UPR0 1127 aa13.41□□□□□ -0.26
PTPRN-201ENST00000295718 CCSO14618 274 aa13.41□□□□□ -0.26
PTPRN-201ENST00000295718 FPR3P25089 353 aa13.41□□□□□ -0.26
PTPRN-201ENST00000295718 OPRD1P41143 372 aa13.41□□□□□ -0.26
PTPRN-201ENST00000295718 ENPP2Q13822 863 aa13.41□□□□□ -0.26
PTPRN-201ENST00000295718 TMEM201Q5SNT2 666 aa13.41□□□□□ -0.26
PTPRN-201ENST00000295718 CD163Q86VB7 1156 aa13.41□□□□□ -0.26
PTPRN-201ENST00000295718 FBXW5Q969U6 566 aa13.41□□□□□ -0.26
PTPRN-201ENST00000295718 SLC6A7Q99884 636 aa13.41□□□□□ -0.26
PTPRN-201ENST00000295718 MED18Q9BUE0 208 aa13.41□□□□□ -0.26
PTPRN-201ENST00000295718 ENKD1Q9H0I2 346 aa13.41□□□□□ -0.26
PTPRN-201ENST00000295718 SLC38A1Q9H2H9 487 aa13.41□□□□□ -0.26
PTPRN-201ENST00000295718 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa13.41□□□□□ -0.26
PTPRN-201ENST00000295718 ZNF236Q9UL36 1845 aa13.41□□□□□ -0.26
PTPRN-201ENST00000295718 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRN-201ENST00000295718 F5H5P2 479 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRN-201ENST00000295718 SGK494L7N484 410 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRN-201ENST00000295718 AMY2AP04746 511 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRN-201ENST00000295718 SIRPAP78324 504 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRN-201ENST00000295718 MC2RQ01718 297 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRN-201ENST00000295718 BTN2A1Q7KYR7 527 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRN-201ENST00000295718 SLC39A11Q8N1S5 342 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRN-201ENST00000295718 POMGNT2Q8NAT1 580 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRN-201ENST00000295718 OR5M1Q8NGP8 315 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRN-201ENST00000295718 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRN-201ENST00000295718 CMKLR1Q99788 373 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRN-201ENST00000295718 DLL4Q9NR61 685 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRN-201ENST00000295718 SPHK1Q9NYA1 384 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRN-201ENST00000295718 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
PTPRN-201ENST00000295718 KCND3Q9UK17 655 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRN-201ENST00000295718 CA5BQ9Y2D0 317 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRN-201ENST00000295718 V9GY05 133 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRN-201ENST00000295718 SIP14410 1827 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRN-201ENST00000295718 LRIT2A6NDA9 550 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRN-201ENST00000295718 XKRYO14609 159 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRN-201ENST00000295718 TNK1Q13470 666 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRN-201ENST00000295718 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
PTPRN-201ENST00000295718 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
PTPRN-201ENST00000295718 GRM7Q14831 915 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRN-201ENST00000295718 NIPAL3Q6P499 406 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRN-201ENST00000295718 THSD4Q6ZMP0 1018 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRN-201ENST00000295718 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRN-201ENST00000295718 OR2L5Q8NG80 312 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRN-201ENST00000295718 DPEP2Q9H4A9 486 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRN-201ENST00000295718 A0A1B0GV50 99 aa13.4□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 VEGFDO43915 354 aa13.4□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 RLN2P04090 185 aa13.4□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 ITGB8P26012 769 aa13.4□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 DNASE1L1P49184 302 aa13.4□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 SCRN3Q0VDG4 424 aa13.4□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 GSG1LQ6UXU4 331 aa13.4□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 Q6ZNB5 142 aa13.4□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 LNX2Q8N448 690 aa13.4□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 NXPE3Q969Y0 559 aa13.4□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 C3orf49Q96BT1 292 aa13.4□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 CSTAP01040 98 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 ATP1B1P05026 303 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 NUDT1P36639 197 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 HSD17B2P37059 387 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 ACTC1P68032 377 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 ACTA1P68133 377 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 CDK3Q00526 305 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 RNF165Q6ZSG1 346 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 PRSS42Q7Z5A4 293 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 OR7G2Q8NG99 324 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 OR10K1Q8NGX5 313 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 HRASLSQ9HDD0 168 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 FBXO34Q9NWN3 711 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 GSKIPQ9P0R6 139 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 AGAP14A8MT82 685 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 HIDE1A8MVS5 230 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 TPMTP51580 245 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 SLC7A9P82251 487 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 ERV3-1Q14264 604 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 CCDC157Q569K6 752 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 PRRT3Q5FWE3 981 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 FAM26DQ5JW98 314 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 ZNF836Q6ZNA1 936 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 ASPGQ86U10 573 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 ZNF546Q86UE3 836 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 ZNF227Q86WZ6 799 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 OR51D1Q8NGF3 324 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 OR5K2Q8NHB8 316 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 RASD2Q96D21 266 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 MS4A3Q96HJ5 214 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 TRIM2Q9C040 744 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 ARRDC5A6NEK1 342 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 S100A11P31949 105 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 CCR9P51686 369 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 LINC00303Q3SY05 128 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 DCST2Q5T1A1 773 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRN-201ENST00000295718 ZNF547Q8IVP9 402 aa13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.1 ms