RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000291574.8

TRAPPC10-201, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC10, Length 6,976 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-201ENST00000291574 OR14A2Q96R54 314 aa12.7□□□□□ -0.38
TRAPPC10-201ENST00000291574 KATNB1Q9BVA0 655 aa12.7□□□□□ -0.38
TRAPPC10-201ENST00000291574 MICAL3Q7RTP6 2002 aa12.69□□□□□ -0.38
TRAPPC10-201ENST00000291574 CDC14CA4D256 554 aa12.69□□□□□ -0.38
TRAPPC10-201ENST00000291574 TAPBPO15533 448 aa12.69□□□□□ -0.38
TRAPPC10-201ENST00000291574 SIX6O95475 246 aa12.69□□□□□ -0.38
TRAPPC10-201ENST00000291574 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa12.69□□□□□ -0.38
TRAPPC10-201ENST00000291574 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa12.69□□□□□ -0.38
TRAPPC10-201ENST00000291574 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP12.69□□□□□ -0.38
TRAPPC10-201ENST00000291574 SUMF2Q8NBJ7 301 aa12.69□□□□□ -0.38
TRAPPC10-201ENST00000291574 OR5L2Q8NGL0 311 aa12.69□□□□□ -0.38
TRAPPC10-201ENST00000291574 SLC46A2Q9BY10 475 aa12.69□□□□□ -0.38
TRAPPC10-201ENST00000291574 A0A1W2PS29 197 aa12.69□□□□□ -0.38
TRAPPC10-201ENST00000291574 CCDC85CA6NKD9 419 aa12.69□□□□□ -0.38
TRAPPC10-201ENST00000291574 B3GALT4O96024 378 aa12.69□□□□□ -0.38
TRAPPC10-201ENST00000291574 SERPINE2P07093 398 aa12.69□□□□□ -0.38
TRAPPC10-201ENST00000291574 ITGB8P26012 769 aa12.69□□□□□ -0.38
TRAPPC10-201ENST00000291574 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
TRAPPC10-201ENST00000291574 UBA52P62987 128 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
TRAPPC10-201ENST00000291574 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
TRAPPC10-201ENST00000291574 UBE2NLQ5JXB2 153 aa12.69□□□□□ -0.38
TRAPPC10-201ENST00000291574 CREB3L2Q70SY1 520 aa12.69□□□□□ -0.38
TRAPPC10-201ENST00000291574 L3MBTL4Q8NA19 623 aa12.69□□□□□ -0.38
TRAPPC10-201ENST00000291574 OR6F1Q8NGZ6 308 aa12.69□□□□□ -0.38
TRAPPC10-201ENST00000291574 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP12.69□□□□□ -0.38
TRAPPC10-201ENST00000291574 NICN1Q9BSH3 213 aa12.69□□□□□ -0.38
TRAPPC10-201ENST00000291574 KDM3BQ7LBC6 1761 aa12.69□□□□□ -0.38
TRAPPC10-201ENST00000291574 GPRIN2O60269 458 aa12.69□□□□□ -0.38
TRAPPC10-201ENST00000291574 SRP9P49458 86 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
TRAPPC10-201ENST00000291574 IRF4Q15306 451 aa12.69□□□□□ -0.38
TRAPPC10-201ENST00000291574 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa12.69□□□□□ -0.38
TRAPPC10-201ENST00000291574 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
TRAPPC10-201ENST00000291574 OR5B2Q96R09 309 aa12.69□□□□□ -0.38
TRAPPC10-201ENST00000291574 SEC22CQ9BRL7 303 aa12.69□□□□□ -0.38
TRAPPC10-201ENST00000291574 FAM86C1Q9NVL1 165 aa12.69□□□□□ -0.38
TRAPPC10-201ENST00000291574 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa12.69□□□□□ -0.38
TRAPPC10-201ENST00000291574 OR6C6A6NF89 314 aa12.69□□□□□ -0.38
TRAPPC10-201ENST00000291574 ZNF195O14628 629 aa12.69□□□□□ -0.38
TRAPPC10-201ENST00000291574 DUX1O43812 170 aa12.69□□□□□ -0.38
TRAPPC10-201ENST00000291574 DOK2O60496 412 aa12.69□□□□□ -0.38
TRAPPC10-201ENST00000291574 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
TRAPPC10-201ENST00000291574 MALLQ13021 153 aa12.69□□□□□ -0.38
TRAPPC10-201ENST00000291574 TNK1Q13470 666 aa12.69□□□□□ -0.38
TRAPPC10-201ENST00000291574 DUSP7Q16829 419 aa12.69□□□□□ -0.38
TRAPPC10-201ENST00000291574 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa12.69□□□□□ -0.38
TRAPPC10-201ENST00000291574 OR1S1Q8NH92 325 aa12.69□□□□□ -0.38
TRAPPC10-201ENST00000291574 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
TRAPPC10-201ENST00000291574 DDIT4LQ96D03 193 aa12.69□□□□□ -0.38
TRAPPC10-201ENST00000291574 SPIN2AQ99865 258 aa12.69□□□□□ -0.38
TRAPPC10-201ENST00000291574 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa12.69□□□□□ -0.38
TRAPPC10-201ENST00000291574 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP12.69□□□□□ -0.38
TRAPPC10-201ENST00000291574 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
TRAPPC10-201ENST00000291574 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa12.69□□□□□ -0.38
TRAPPC10-201ENST00000291574 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
TRAPPC10-201ENST00000291574 ZNF337Q9Y3M9 751 aa12.69□□□□□ -0.38
TRAPPC10-201ENST00000291574 OR2T1O43869 369 aa12.69□□□□□ -0.38
TRAPPC10-201ENST00000291574 ITGB7P26010 798 aa12.69□□□□□ -0.38
TRAPPC10-201ENST00000291574 ERV3-1Q14264 604 aa12.69□□□□□ -0.38
TRAPPC10-201ENST00000291574 FAM122CQ6P4D5 195 aa12.69□□□□□ -0.38
TRAPPC10-201ENST00000291574 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP12.69□□□□□ -0.38
TRAPPC10-201ENST00000291574 PLEK2Q9NYT0 353 aa12.69□□□□□ -0.38
TRAPPC10-201ENST00000291574 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa12.68□□□□□ -0.38
TRAPPC10-201ENST00000291574 SEMA3BQ13214 749 aa12.68□□□□□ -0.38
TRAPPC10-201ENST00000291574 SLC14A1Q13336 389 aa12.68□□□□□ -0.38
TRAPPC10-201ENST00000291574 PXDC1Q5TGL8 231 aa12.68□□□□□ -0.38
TRAPPC10-201ENST00000291574 PRSS45Q7RTY3 260 aa12.68□□□□□ -0.38
TRAPPC10-201ENST00000291574 DPY19L4Q7Z388 723 aa12.68□□□□□ -0.38
TRAPPC10-201ENST00000291574 TANKQ92844 425 aa12.68□□□□□ -0.38
TRAPPC10-201ENST00000291574 C3orf49Q96BT1 292 aa12.68□□□□□ -0.38
TRAPPC10-201ENST00000291574 NELFAQ9H3P2 528 aa12.68□□□□□ -0.38
TRAPPC10-201ENST00000291574 OPRD1P41143 372 aa12.68□□□□□ -0.38
TRAPPC10-201ENST00000291574 SERTAD2Q14140 314 aa12.68□□□□□ -0.38
TRAPPC10-201ENST00000291574 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
TRAPPC10-201ENST00000291574 BBS1Q8NFJ9 593 aa12.68□□□□□ -0.38
TRAPPC10-201ENST00000291574 APOOQ9BUR5 198 aa12.68□□□□□ -0.38
TRAPPC10-201ENST00000291574 LTBP3Q9NS15 1303 aa12.68□□□□□ -0.38
TRAPPC10-201ENST00000291574 MYO7AQ13402 2215 aa12.68□□□□□ -0.38
TRAPPC10-201ENST00000291574 TNFRSF10AO00220 468 aa12.68□□□□□ -0.38
TRAPPC10-201ENST00000291574 DPM1O60762 260 aa12.68□□□□□ -0.38
TRAPPC10-201ENST00000291574 BMP1P13497 986 aa12.68□□□□□ -0.38
TRAPPC10-201ENST00000291574 XCR1P46094 333 aa12.68□□□□□ -0.38
TRAPPC10-201ENST00000291574 CX3CR1P49238 355 aa12.68□□□□□ -0.38
TRAPPC10-201ENST00000291574 TAS2R20P59543 309 aa12.68□□□□□ -0.38
TRAPPC10-201ENST00000291574 PEA15Q15121 130 aa12.68□□□□□ -0.38
TRAPPC10-201ENST00000291574 TPSD1Q9BZJ3 242 aa12.68□□□□□ -0.38
TRAPPC10-201ENST00000291574 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
TRAPPC10-201ENST00000291574 TP53P04637 393 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
TRAPPC10-201ENST00000291574 CPMP14384 443 aa12.68□□□□□ -0.38
TRAPPC10-201ENST00000291574 DDOSTP39656 456 aa12.68□□□□□ -0.38
TRAPPC10-201ENST00000291574 P2RY2P41231 377 aa12.68□□□□□ -0.38
TRAPPC10-201ENST00000291574 GPLD1P80108 840 aa12.68□□□□□ -0.38
TRAPPC10-201ENST00000291574 CCSMST1Q4G0I0 132 aa12.68□□□□□ -0.38
TRAPPC10-201ENST00000291574 FAM111BQ6SJ93 734 aa12.68□□□□□ -0.38
TRAPPC10-201ENST00000291574 CMTM1Q8IZ96 169 aa12.68□□□□□ -0.38
TRAPPC10-201ENST00000291574 IL17RCQ8NAC3 791 aa12.68□□□□□ -0.38
TRAPPC10-201ENST00000291574 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
TRAPPC10-201ENST00000291574 EHFQ9NZC4 300 aa12.68□□□□□ -0.38
TRAPPC10-201ENST00000291574 P2RX6O15547 441 aa12.68□□□□□ -0.38
TRAPPC10-201ENST00000291574 B4GALT3O60512 393 aa12.68□□□□□ -0.38
TRAPPC10-201ENST00000291574 CBR1P16152 277 aa12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.8 ms