RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000256151.7

CCDC59-201, Transcript of coiled-coil domain containing 59, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC59, Length 1,983 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC59-201ENST00000256151 OR2M5A3KFT3 312 aa14.94□□□□□ -0.02
CCDC59-201ENST00000256151 KRT33AO76009 404 aa14.94□□□□□ -0.02
CCDC59-201ENST00000256151 NID1P14543 1247 aa14.94□□□□□ -0.02
CCDC59-201ENST00000256151 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP14.94□□□□□ -0.02
CCDC59-201ENST00000256151 SIRPAP78324 504 aa14.94□□□□□ -0.02
CCDC59-201ENST00000256151 KRT33BQ14525 404 aa14.94□□□□□ -0.02
CCDC59-201ENST00000256151 Q6ZTK2 550 aa14.94□□□□□ -0.02
CCDC59-201ENST00000256151 ESX1Q8N693 406 aa14.94□□□□□ -0.02
CCDC59-201ENST00000256151 ZNF671Q8TAW3 534 aa14.94□□□□□ -0.02
CCDC59-201ENST00000256151 KLHL15Q96M94 604 aa14.94□□□□□ -0.02
CCDC59-201ENST00000256151 SFXN2Q96NB2 322 aa14.94□□□□□ -0.02
CCDC59-201ENST00000256151 DPYSL5Q9BPU6 564 aa14.94□□□□□ -0.02
CCDC59-201ENST00000256151 TM7SF3Q9NS93 570 aa14.94□□□□□ -0.02
CCDC59-201ENST00000256151 C20orf141Q9NUB4 165 aa14.94□□□□□ -0.02
CCDC59-201ENST00000256151 OR6C2Q9NZP2 312 aa14.94□□□□□ -0.02
CCDC59-201ENST00000256151 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
CCDC59-201ENST00000256151 CA5BQ9Y2D0 317 aa14.94□□□□□ -0.02
CCDC59-201ENST00000256151 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
CCDC59-201ENST00000256151 A0A1W2PRG6 482 aa14.94□□□□□ -0.02
CCDC59-201ENST00000256151 HMSDA8MTL9 139 aa14.94□□□□□ -0.02
CCDC59-201ENST00000256151 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
CCDC59-201ENST00000256151 IFI6P09912 130 aa14.94□□□□□ -0.02
CCDC59-201ENST00000256151 DRD5P21918 477 aa14.94□□□□□ -0.02
CCDC59-201ENST00000256151 SLC6A6P31641 620 aa14.94□□□□□ -0.02
CCDC59-201ENST00000256151 LTB4RQ15722 352 aa14.94□□□□□ -0.02
CCDC59-201ENST00000256151 ZSWIM7Q19AV6 140 aa14.94□□□□□ -0.02
CCDC59-201ENST00000256151 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
CCDC59-201ENST00000256151 FAM111BQ6SJ93 734 aa14.94□□□□□ -0.02
CCDC59-201ENST00000256151 NAXDQ8IW45 347 aa14.94□□□□□ -0.02
CCDC59-201ENST00000256151 LGALS14Q8TCE9 139 aa14.94□□□□□ -0.02
CCDC59-201ENST00000256151 RPS4Y2Q8TD47 263 aa14.94□□□□□ -0.02
CCDC59-201ENST00000256151 GAL3ST3Q96A11 431 aa14.94□□□□□ -0.02
CCDC59-201ENST00000256151 DDOQ99489 341 aa14.94□□□□□ -0.02
CCDC59-201ENST00000256151 TIMM29Q9BSF4 260 aa14.94□□□□□ -0.02
CCDC59-201ENST00000256151 TEX101Q9BY14 249 aa14.94□□□□□ -0.02
CCDC59-201ENST00000256151 C12orf4Q9NQ89 552 aa14.94□□□□□ -0.02
CCDC59-201ENST00000256151 SDHAF2Q9NX18 166 aa14.94□□□□□ -0.02
CCDC59-201ENST00000256151 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
CCDC59-201ENST00000256151 L7N2F9 121 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC59-201ENST00000256151 GMDSO60547 372 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC59-201ENST00000256151 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
CCDC59-201ENST00000256151 AK1P00568 194 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC59-201ENST00000256151 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
CCDC59-201ENST00000256151 RAB40ALP0C0E4 278 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC59-201ENST00000256151 CEBPBP17676 345 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC59-201ENST00000256151 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
CCDC59-201ENST00000256151 RBM34P42696 430 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
CCDC59-201ENST00000256151 SLC16A1P53985 500 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC59-201ENST00000256151 CRMP1Q14194 572 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC59-201ENST00000256151 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
CCDC59-201ENST00000256151 ZNF626Q68DY1 528 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC59-201ENST00000256151 ZNF425Q6IV72 752 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC59-201ENST00000256151 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
CCDC59-201ENST00000256151 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC59-201ENST00000256151 RPTNQ6XPR3 784 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC59-201ENST00000256151 MTSS1LQ765P7 747 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC59-201ENST00000256151 PRSS45Q7RTY3 260 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC59-201ENST00000256151 OR2L3Q8NG85 312 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC59-201ENST00000256151 FCAMRQ8WWV6 532 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC59-201ENST00000256151 RAB40AQ8WXH6 277 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC59-201ENST00000256151 NSMAFQ92636 917 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC59-201ENST00000256151 PELI1Q96FA3 418 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC59-201ENST00000256151 ZNF559Q9BR84 538 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC59-201ENST00000256151 AUNIPQ9H7T9 357 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC59-201ENST00000256151 POLE3Q9NRF9 147 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC59-201ENST00000256151 MGAT4CQ9UBM8 478 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC59-201ENST00000256151 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
CCDC59-201ENST00000256151 RCE1Q9Y256 329 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC59-201ENST00000256151 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC59-201ENST00000256151 A8MXK9 166 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC59-201ENST00000256151 MCRIP1C9JLW8 97 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC59-201ENST00000256151 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC59-201ENST00000256151 AIPO00170 330 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC59-201ENST00000256151 TSPAN9O75954 239 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC59-201ENST00000256151 ADH1CP00326 375 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC59-201ENST00000256151 LAMP2P13473 410 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC59-201ENST00000256151 CXCL2P19875 107 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC59-201ENST00000256151 NOS3P29474 1203 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC59-201ENST00000256151 CMPK1P30085 196 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC59-201ENST00000256151 MYO9BQ13459 2157 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC59-201ENST00000256151 DUSP5Q16690 384 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC59-201ENST00000256151 LINGO2Q7L985 606 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC59-201ENST00000256151 TDHQ8IZJ6 230 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC59-201ENST00000256151 OR13C5Q8NGS8 318 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC59-201ENST00000256151 OR13C2Q8NGS9 318 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC59-201ENST00000256151 NT5CQ8TCD5 201 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC59-201ENST00000256151 PEX11GQ96HA9 241 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC59-201ENST00000256151 DPP7Q9UHL4 492 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC59-201ENST00000256151 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
CCDC59-201ENST00000256151 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
CCDC59-201ENST00000256151 RGS11O94810 467 aa14.92□□□□□ -0.02
CCDC59-201ENST00000256151 WDPCPO95876 746 aa14.92□□□□□ -0.02
CCDC59-201ENST00000256151 PCCBP05166 539 aa14.92□□□□□ -0.02
CCDC59-201ENST00000256151 CALCBP10092 127 aa14.92□□□□□ -0.02
CCDC59-201ENST00000256151 IL32P24001 234 aa14.92□□□□□ -0.02
CCDC59-201ENST00000256151 DPP4P27487 766 aa14.92□□□□□ -0.02
CCDC59-201ENST00000256151 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
CCDC59-201ENST00000256151 VEGFCP49767 419 aa14.92□□□□□ -0.02
CCDC59-201ENST00000256151 TNFRSF17Q02223 184 aa14.92□□□□□ -0.02
CCDC59-201ENST00000256151 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms