RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253122.9

SLC6A8-201, Transcript of solute carrier family 6 member 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC6A8, Length 3,763 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A8-201ENST00000253122 ACTA2P62736 377 aa14.72□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 ACTG2P63267 376 aa14.72□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 OR1Q1Q15612 314 aa14.72□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 NNATQ16517 81 aa14.72□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 MPP7Q5T2T1 576 aa14.72□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 THAP6Q8TBB0 222 aa14.72□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 MOAP1Q96BY2 351 aa14.72□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa14.72□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 KIF25Q9UIL4 384 aa14.72□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 MYO16Q9Y6X6 1858 aa14.72□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 GXYLT2A0PJZ3 443 aa14.72□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 D6RAR5 112 aa14.72□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 HLA-DQB1P01920 261 aa14.72□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 MMP15P51511 669 aa14.72□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 LINC00303Q3SY05 128 aa14.72□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 AMZ1Q400G9 498 aa14.72□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 TSSK4Q6SA08 328 aa14.72□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 ZNF227Q86WZ6 799 aa14.72□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 SLC35F2Q8IXU6 374 aa14.72□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 OR4K14Q8NGD5 310 aa14.72□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 DTD2Q96FN9 168 aa14.72□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 ATG5Q9H1Y0 275 aa14.72□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 OR2S2Q9NQN1 319 aa14.72□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 DNAH12Q6ZR08 3092 aa14.72□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 TSC2P49815 1807 aa14.72□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 OR52A4PA6NMU1 304 aa14.72□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 PPM1BO75688 479 aa14.72□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 TACSTD2P09758 323 aa14.72□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 ANKRD34CP0C6C1 535 aa14.72□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 DEFB103AP81534 67 aa14.72□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 NSMAFQ92636 917 aa14.72□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 MS4A3Q96HJ5 214 aa14.72□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 GDF15Q99988 308 aa14.72□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa14.72□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa14.71□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 FARS2O95363 451 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 CBX7O95931 251 aa14.71□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 TIMP1P01033 207 aa14.71□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 IFNA6P05013 189 aa14.71□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 GIPP09681 153 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 IFNGR1P15260 489 aa14.71□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 GAS6Q14393 721 aa14.71□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 PARGQ86W56 976 aa14.71□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 NRROSQ86YC3 692 aa14.71□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 PXT1Q8NFP0 134 aa14.71□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 NRIP3Q9NQ35 241 aa14.71□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa14.71□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 IL20Q9NYY1 176 aa14.71□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 OR1A2Q9Y585 309 aa14.71□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 CDC42EP2O14613 210 aa14.71□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 AGR2O95994 175 aa14.71□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 GXYLT1Q4G148 440 aa14.71□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 ARMC10Q8N2F6 343 aa14.71□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 DNAAF1Q8NEP3 725 aa14.71□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 SMIM4Q8WVI0 70 aa14.71□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 LMLNQ96KR4 655 aa14.71□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 HHIPQ96QV1 700 aa14.71□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 DEC1Q9P2X7 70 aa14.71□□□□□ -0.05
SLC6A8-201ENST00000253122 TANC1Q9C0D5 1861 aa14.71□□□□□ -0.06
SLC6A8-201ENST00000253122 OR5K3A6NET4 321 aa14.71□□□□□ -0.06
SLC6A8-201ENST00000253122 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa14.71□□□□□ -0.06
SLC6A8-201ENST00000253122 HIST1H2ABP04908 130 aa14.71□□□□□ -0.06
SLC6A8-201ENST00000253122 ADH1AP07327 375 aa14.71□□□□□ -0.06
SLC6A8-201ENST00000253122 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
SLC6A8-201ENST00000253122 NKPD1Q17RQ9 610 aa14.71□□□□□ -0.06
SLC6A8-201ENST00000253122 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
SLC6A8-201ENST00000253122 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa14.71□□□□□ -0.06
SLC6A8-201ENST00000253122 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
SLC6A8-201ENST00000253122 C15orf40Q8WUR7 153 aa14.71□□□□□ -0.06
SLC6A8-201ENST00000253122 HIST1H2ACQ93077 130 aa14.71□□□□□ -0.06
SLC6A8-201ENST00000253122 SLC38A3Q99624 504 aa14.71□□□□□ -0.06
SLC6A8-201ENST00000253122 HCAR1Q9BXC0 346 aa14.71□□□□□ -0.06
SLC6A8-201ENST00000253122 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa14.71□□□□□ -0.06
SLC6A8-201ENST00000253122 PELI2Q9HAT8 420 aa14.71□□□□□ -0.06
SLC6A8-201ENST00000253122 SYT5O00445 386 aa14.7□□□□□ -0.06
SLC6A8-201ENST00000253122 SYN1P17600 705 aa14.7□□□□□ -0.06
SLC6A8-201ENST00000253122 SRMP19623 302 aa14.7□□□□□ -0.06
SLC6A8-201ENST00000253122 TBXA2RP21731 343 aa14.7□□□□□ -0.06
SLC6A8-201ENST00000253122 DYRK1AQ13627 763 aa14.7□□□□□ -0.06
SLC6A8-201ENST00000253122 ALG10BQ5I7T1 473 aa14.7□□□□□ -0.06
SLC6A8-201ENST00000253122 DPPA4Q7L190 304 aa14.7□□□□□ -0.06
SLC6A8-201ENST00000253122 COMTD1Q86VU5 262 aa14.7□□□□□ -0.06
SLC6A8-201ENST00000253122 FOXRED2Q8IWF2 684 aa14.7□□□□□ -0.06
SLC6A8-201ENST00000253122 OR6N2Q8NGY6 317 aa14.7□□□□□ -0.06
SLC6A8-201ENST00000253122 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SLC6A8-201ENST00000253122 LRIG1Q96JA1 1093 aa14.7□□□□□ -0.06
SLC6A8-201ENST00000253122 A0A1W2PR48 441 aa14.7□□□□□ -0.06
SLC6A8-201ENST00000253122 AMY2AP04746 511 aa14.7□□□□□ -0.06
SLC6A8-201ENST00000253122 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SLC6A8-201ENST00000253122 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa14.7□□□□□ -0.06
SLC6A8-201ENST00000253122 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa14.7□□□□□ -0.06
SLC6A8-201ENST00000253122 CD300LDQ6UXZ3 194 aa14.7□□□□□ -0.06
SLC6A8-201ENST00000253122 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms