RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000100237.3

Ttf1-201, Transcript of Transcription termination factor 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Ttf1, Length 4,160 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Gm10718D3Z1I7 227 aa6.45□□□□□ -1.38
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Gm20431E9PY39 371 aa6.45□□□□□ -1.38
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Vmn1r88E9Q235 316 aa6.45□□□□□ -1.38
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Dbx2F8VQH7 377 aa6.45□□□□□ -1.38
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Olfr190K7N5T5 307 aa6.45□□□□□ -1.38
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Opn1mwO35599 359 aa6.45□□□□□ -1.38
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Mid1O70583 680 aa6.45□□□□□ -1.38
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Grap2O89100 322 aa6.45□□□□□ -1.38
Ttf1-201ENSMUST00000100237 P04213 122 aa6.45□□□□□ -1.38
Ttf1-201ENSMUST00000100237 LifP09056 203 aa6.45□□□□□ -1.38
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Hoxd8P23463 289 aa6.45□□□□□ -1.38
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Htr7P32304 448 aa6.45□□□□□ -1.38
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Mmp2P33434 662 aa6.45□□□□□ -1.38
Ttf1-201ENSMUST00000100237 FhP97807 507 aa6.45□□□□□ -1.38
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Gm5460Q3UQ97 254 aa6.45□□□□□ -1.38
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Sez6l2Q4V9Z5 910 aa6.45□□□□□ -1.38
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Elfn2Q68FM6 823 aa6.45□□□□□ -1.38
Ttf1-201ENSMUST00000100237 ShbQ6PD21 503 aa6.45□□□□□ -1.38
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Doc2aQ7TNF0 405 aa6.45□□□□□ -1.38
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Tas2r3Q7TQA7 316 aa6.45□□□□□ -1.38
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Otop2Q80SX5 563 aa6.45□□□□□ -1.38
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Nceh1Q8BLF1 408 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
Ttf1-201ENSMUST00000100237 B4gat1Q8BWP8 415 aa6.45□□□□□ -1.38
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Dhcr24Q8VCH6 516 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Klhdc8aQ91XA8 350 aa6.45□□□□□ -1.38
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Lims2Q91XD2 341 aa6.45□□□□□ -1.38
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Slc25a46Q9CQS4 418 aa6.45□□□□□ -1.38
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Plekhj1Q9D240 164 aa6.45□□□□□ -1.38
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Samt4Q9D4X6 233 aa6.45□□□□□ -1.38
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Rhox2aQ9D4Y3 191 aa6.45□□□□□ -1.38
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Fam122cQ9D5J5 180 aa6.45□□□□□ -1.38
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Cdc20Q9JJ66 499 aa6.45□□□□□ -1.38
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Tmem37Q9JJV3 211 aa6.45□□□□□ -1.38
Ttf1-201ENSMUST00000100237 TrehQ9JLT2 576 aa6.45□□□□□ -1.38
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Dnajb8Q9QYI7 227 aa6.45□□□□□ -1.38
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Sema4gQ9WUH7 837 aa6.45□□□□□ -1.38
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Mapk7Q9WVS8 806 aa6.45□□□□□ -1.38
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Tcf7l1Q9Z1J1 584 aa6.45□□□□□ -1.38
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Shroom3Q9QXN0 1986 aa6.45□□□□□ -1.38
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Cacna1fQ9JIS7 1985 aa6.45□□□□□ -1.38
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Gm29276A0A087WNW5 222 aa6.45□□□□□ -1.38
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Gm21117A0A087WPJ9 222 aa6.45□□□□□ -1.38
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Gm20820A0A087WPP3 222 aa6.45□□□□□ -1.38
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Gm20937A0A087WQA3 222 aa6.45□□□□□ -1.38
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Gm21258A0A087WQC7 222 aa6.45□□□□□ -1.38
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Gm28102A0A087WQL3 222 aa6.45□□□□□ -1.38
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Gm21095A0A087WR14 222 aa6.45□□□□□ -1.38
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Gm20792A0A087WRF5 222 aa6.45□□□□□ -1.38
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Gm21497A0A087WRK3 222 aa6.45□□□□□ -1.38
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Zfp383A0A087WRR7 490 aa6.45□□□□□ -1.38
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Gm28490A0A087WRT9 222 aa6.45□□□□□ -1.38
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Gm21294A0A087WS79 222 aa6.45□□□□□ -1.38
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Gm20824A0A087WS97 222 aa6.45□□□□□ -1.38
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Gm21996A0A087WSS9 222 aa6.45□□□□□ -1.38
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Gm28870A0A0A6YW38 222 aa6.45□□□□□ -1.38
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Gm29866A0A0A6YX04 222 aa6.45□□□□□ -1.38
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Gm43796A0A0J9YV32 372 aa6.45□□□□□ -1.38
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Igkv10-96A0A140T8M1 115 aa6.45□□□□□ -1.38
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Zfp534A2A7A1 661 aa6.45□□□□□ -1.38
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Matn3O35701 481 aa6.45□□□□□ -1.38
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Entpd2O55026 495 aa6.45□□□□□ -1.38
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Wnt4P22724 351 aa6.45□□□□□ -1.38
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Timp2P25785 220 aa6.45□□□□□ -1.38
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Slc11a1P41251 548 aa6.45□□□□□ -1.38
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Map2k4P47809 397 aa6.45□□□□□ -1.38
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Atxn1P54254 791 aa6.45□□□□□ -1.38
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Nup43P59235 380 aa6.45□□□□□ -1.38
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Isl1P61372 349 aa6.45□□□□□ -1.38
Ttf1-201ENSMUST00000100237 St8sia5P70126 412 aa6.45□□□□□ -1.38
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Glycam1Q02596 151 aa6.45□□□□□ -1.38
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Dusp5Q1HL35 384 aa6.45□□□□□ -1.38
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Ctu2Q3U308 514 aa6.45□□□□□ -1.38
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Tbc1d24Q3UUG6 561 aa6.45□□□□□ -1.38
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Cxcl17Q5UW37 119 aa6.45□□□□□ -1.38
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Muc19Q6JHY2 733 aa6.45□□□□□ -1.38
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Znf728Q6P5C7 752 aa6.45□□□□□ -1.38
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Mfsd13aQ6PDE8 519 aa6.45□□□□□ -1.38
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Paqr9Q6TCG2 375 aa6.45□□□□□ -1.38
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Olfr871Q7TRF0 311 aa6.45□□□□□ -1.38
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Fam76bQ80XP8 339 aa6.45□□□□□ -1.38
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Pamr1Q8BU25 720 aa6.45□□□□□ -1.38
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Slc49a3Q8CE47 516 aa6.45□□□□□ -1.38
Ttf1-201ENSMUST00000100237 CipcQ8R0W1 432 aa6.45□□□□□ -1.38
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Tmem106aQ8VC04 261 aa6.45□□□□□ -1.38
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Med17Q8VCD5 649 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Cd276Q8VE98 316 aa6.45□□□□□ -1.38
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Olfr99Q8VFE4 305 aa6.45□□□□□ -1.38
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Olfr535Q8VGL3 312 aa6.45□□□□□ -1.38
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Serpinb1bQ8VHP7 382 aa6.45□□□□□ -1.38
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Mto1Q923Z3 669 aa6.45□□□□□ -1.38
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Ifitm3Q9CQW9 137 aa6.45□□□□□ -1.38
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Psg23Q9D2U0 471 aa6.45□□□□□ -1.38
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Psg21Q9DAV5 471 aa6.45□□□□□ -1.38
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Prl8a6Q9DAY2 240 aa6.45□□□□□ -1.38
Ttf1-201ENSMUST00000100237 GabarapQ9DCD6 117 aa6.45□□□□□ -1.38
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Hsd17b11Q9EQ06 298 aa6.45□□□□□ -1.38
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Lpar3Q9EQ31 354 aa6.45□□□□□ -1.38
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Cbll1Q9JIY2 491 aa6.45□□□□□ -1.38
Ttf1-201ENSMUST00000100237 PtgfrnQ9WV91 879 aa6.45□□□□□ -1.38
Ttf1-201ENSMUST00000100237 SonQ9QX47 2444 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 56.1 ms