RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
CAPNS1-216ENST00000628306 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
CAPNS1-216ENST00000628306 TUBAL3A6NHL2 446 aa21.79■■□□□ 1.08
CAPNS1-216ENST00000628306 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
CAPNS1-216ENST00000628306 SAC3D1A6NKF1 404 aa21.79■■□□□ 1.08
CAPNS1-216ENST00000628306 SOCS2O14508 198 aa21.79■■□□□ 1.08
CAPNS1-216ENST00000628306 ADAMDEC1O15204 470 aa21.79■■□□□ 1.08
CAPNS1-216ENST00000628306 STX11O75558 287 aa21.79■■□□□ 1.08
CAPNS1-216ENST00000628306 OPN1SWP03999 348 aa21.79■■□□□ 1.08
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF23P17027 643 aa21.79■■□□□ 1.08
CAPNS1-216ENST00000628306 RHCEP18577 417 aa21.79■■□□□ 1.08
CAPNS1-216ENST00000628306 CD53P19397 219 aa21.79■■□□□ 1.08
CAPNS1-216ENST00000628306 PRKAR1BP31321 381 aa21.79■■□□□ 1.08
CAPNS1-216ENST00000628306 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
CAPNS1-216ENST00000628306 HPCAP84074 193 aa21.79■■□□□ 1.08
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
CAPNS1-216ENST00000628306 NHSL2Q5HYW2 709 aa21.79■■□□□ 1.08
CAPNS1-216ENST00000628306 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
CAPNS1-216ENST00000628306 SIMC1Q8NDZ2 872 aa21.79■■□□□ 1.08
CAPNS1-216ENST00000628306 GPR32P1Q8NGA4 272 aa21.79■■□□□ 1.08
CAPNS1-216ENST00000628306 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
CAPNS1-216ENST00000628306 OIT3Q8WWZ8 545 aa21.79■■□□□ 1.08
CAPNS1-216ENST00000628306 C18orf12Q96KH6 178 aa21.79■■□□□ 1.08
CAPNS1-216ENST00000628306 EPYCQ99645 322 aa21.79■■□□□ 1.08
CAPNS1-216ENST00000628306 ABCG2Q9UNQ0 655 aa21.79■■□□□ 1.08
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC6A5Q9Y345 797 aa21.79■■□□□ 1.08
CAPNS1-216ENST00000628306 EXPH5Q8NEV8 1989 aa21.78■■□□□ 1.08
CAPNS1-216ENST00000628306 CD8B2A6NJW9 211 aa21.78■■□□□ 1.08
CAPNS1-216ENST00000628306 LGI1O95970 557 aa21.78■■□□□ 1.08
CAPNS1-216ENST00000628306 HRGP04196 525 aa21.78■■□□□ 1.08
CAPNS1-216ENST00000628306 IFNW1P05000 195 aa21.78■■□□□ 1.08
CAPNS1-216ENST00000628306 FPR1P21462 350 aa21.78■■□□□ 1.08
CAPNS1-216ENST00000628306 ALDH3A2P51648 485 aa21.78■■□□□ 1.08
CAPNS1-216ENST00000628306 FBXW4P57775 412 aa21.78■■□□□ 1.08
CAPNS1-216ENST00000628306 SORDQ00796 357 aa21.78■■□□□ 1.08
CAPNS1-216ENST00000628306 CHRNEQ04844 493 aa21.78■■□□□ 1.08
CAPNS1-216ENST00000628306 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
CAPNS1-216ENST00000628306 GALNT4Q8N4A0 578 aa21.78■■□□□ 1.08
CAPNS1-216ENST00000628306 CDS1Q92903 461 aa21.78■■□□□ 1.08
CAPNS1-216ENST00000628306 WDYHV1Q96HA8 205 aa21.78■■□□□ 1.08
CAPNS1-216ENST00000628306 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa21.78■■□□□ 1.08
CAPNS1-216ENST00000628306 OR10A5Q9H207 317 aa21.78■■□□□ 1.08
CAPNS1-216ENST00000628306 FOLH1BQ9HBA9 442 aa21.78■■□□□ 1.08
CAPNS1-216ENST00000628306 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF232Q9UNY5 417 aa21.78■■□□□ 1.08
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
CAPNS1-216ENST00000628306 C7orf72A4D263 438 aa21.77■■□□□ 1.08
CAPNS1-216ENST00000628306 PRAMEF25A6NGN4 478 aa21.77■■□□□ 1.08
CAPNS1-216ENST00000628306 IL2RAP01589 272 aa21.77■■□□□ 1.08
CAPNS1-216ENST00000628306 THBS1P07996 1170 aa21.77■■□□□ 1.08
CAPNS1-216ENST00000628306 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
CAPNS1-216ENST00000628306 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
CAPNS1-216ENST00000628306 PSG6Q00889 435 aa21.77■■□□□ 1.08
CAPNS1-216ENST00000628306 DAG1Q14118 895 aa21.77■■□□□ 1.08
CAPNS1-216ENST00000628306 KEAP1Q14145 624 aa21.77■■□□□ 1.08
CAPNS1-216ENST00000628306 FRRS1Q6ZNA5 592 aa21.77■■□□□ 1.08
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC29A4Q7RTT9 530 aa21.77■■□□□ 1.08
CAPNS1-216ENST00000628306 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
CAPNS1-216ENST00000628306 SMYD1Q8NB12 490 aa21.77■■□□□ 1.08
CAPNS1-216ENST00000628306 GNRHR2Q96P88 292 aa21.77■■□□□ 1.08
CAPNS1-216ENST00000628306 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
CAPNS1-216ENST00000628306 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
CAPNS1-216ENST00000628306 ANGPTL4Q9BY76 406 aa21.77■■□□□ 1.08
CAPNS1-216ENST00000628306 REEP1Q9H902 201 aa21.77■■□□□ 1.08
CAPNS1-216ENST00000628306 SH3GLB1Q9Y371 365 aa21.77■■□□□ 1.08
CAPNS1-216ENST00000628306 WDR45Q9Y484 360 aa21.77■■□□□ 1.08
CAPNS1-216ENST00000628306 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
CAPNS1-216ENST00000628306 OR6C76A6NM76 312 aa21.76■■□□□ 1.07
CAPNS1-216ENST00000628306 CLCA1A8K7I4 914 aa21.76■■□□□ 1.07
CAPNS1-216ENST00000628306 hCG_2039718K7EN88 272 aa21.76■■□□□ 1.07
CAPNS1-216ENST00000628306 INHBBP09529 407 aa21.76■■□□□ 1.07
CAPNS1-216ENST00000628306 BMP7P18075 431 aa21.76■■□□□ 1.07
CAPNS1-216ENST00000628306 GABRA3P34903 492 aa21.76■■□□□ 1.07
CAPNS1-216ENST00000628306 DCAF7P61962 342 aa21.76■■□□□ 1.07
CAPNS1-216ENST00000628306 PSPHP78330 225 aa21.76■■□□□ 1.07
CAPNS1-216ENST00000628306 EPS8Q12929 822 aa21.76■■□□□ 1.07
CAPNS1-216ENST00000628306 ZSWIM7Q19AV6 140 aa21.76■■□□□ 1.07
CAPNS1-216ENST00000628306 DCST2Q5T1A1 773 aa21.76■■□□□ 1.07
CAPNS1-216ENST00000628306 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
CAPNS1-216ENST00000628306 COX18Q8N8Q8 333 aa21.76■■□□□ 1.07
CAPNS1-216ENST00000628306 C9orf106Q8NAJ2 232 aa21.76■■□□□ 1.07
CAPNS1-216ENST00000628306 GPR151Q8TDV0 419 aa21.76■■□□□ 1.07
CAPNS1-216ENST00000628306 DIO2Q92813 273 aa21.76■■□□□ 1.07
CAPNS1-216ENST00000628306 LRRC46Q96FV0 321 aa21.76■■□□□ 1.07
CAPNS1-216ENST00000628306 PIP5K1AQ99755 562 aa21.76■■□□□ 1.07
CAPNS1-216ENST00000628306 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
CAPNS1-216ENST00000628306 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa21.76■■□□□ 1.07
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa21.76■■□□□ 1.07
CAPNS1-216ENST00000628306 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
CAPNS1-216ENST00000628306 AGAP5A6NIR3 686 aa21.75■■□□□ 1.07
CAPNS1-216ENST00000628306 PDLIM1O00151 329 aa21.75■■□□□ 1.07
CAPNS1-216ENST00000628306 FCMRO60667 390 aa21.75■■□□□ 1.07
CAPNS1-216ENST00000628306 E2F6O75461 281 aa21.75■■□□□ 1.07
CAPNS1-216ENST00000628306 ALPLP05186 524 aa21.75■■□□□ 1.07
CAPNS1-216ENST00000628306 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
CAPNS1-216ENST00000628306 CTSSP25774 331 aa21.75■■□□□ 1.07
CAPNS1-216ENST00000628306 SSTR4P31391 388 aa21.75■■□□□ 1.07
CAPNS1-216ENST00000628306 SMIM11AP58511 58 aa21.75■■□□□ 1.07
CAPNS1-216ENST00000628306 PPP2R2BQ00005 443 aa21.75■■□□□ 1.07
CAPNS1-216ENST00000628306 MED21Q13503 144 aa21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms