RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588374.1

EFTUD2-211, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 524 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-211ENST00000588374 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa6.09□□□□□ -1.43
EFTUD2-211ENST00000588374 WBP2NLQ6ICG8 309 aa6.09□□□□□ -1.43
EFTUD2-211ENST00000588374 OR2A2Q6IF42 318 aa6.09□□□□□ -1.43
EFTUD2-211ENST00000588374 VWA1Q6PCB0 445 aa6.09□□□□□ -1.43
EFTUD2-211ENST00000588374 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa6.09□□□□□ -1.43
EFTUD2-211ENST00000588374 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
EFTUD2-211ENST00000588374 GRINAQ7Z429 371 aa6.09□□□□□ -1.43
EFTUD2-211ENST00000588374 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
EFTUD2-211ENST00000588374 BTLAQ7Z6A9 289 aa6.09□□□□□ -1.43
EFTUD2-211ENST00000588374 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa6.09□□□□□ -1.43
EFTUD2-211ENST00000588374 COMTD1Q86VU5 262 aa6.09□□□□□ -1.43
EFTUD2-211ENST00000588374 CALHM3Q86XJ0 350 aa6.09□□□□□ -1.43
EFTUD2-211ENST00000588374 MCEMP1Q8IX19 187 aa6.09□□□□□ -1.43
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF610Q8N9Z0 462 aa6.09□□□□□ -1.43
EFTUD2-211ENST00000588374 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
EFTUD2-211ENST00000588374 OR8J3Q8NGG0 315 aa6.09□□□□□ -1.43
EFTUD2-211ENST00000588374 RNF217Q8TC41 542 aa6.09□□□□□ -1.43
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
EFTUD2-211ENST00000588374 STARD4Q96DR4 205 aa6.09□□□□□ -1.43
EFTUD2-211ENST00000588374 CMTM5Q96DZ9 223 aa6.09□□□□□ -1.43
EFTUD2-211ENST00000588374 ARL5BQ96KC2 179 aa6.09□□□□□ -1.43
EFTUD2-211ENST00000588374 ZFP3Q96NJ6 502 aa6.09□□□□□ -1.43
EFTUD2-211ENST00000588374 LRRC37BQ96QE4 947 aa6.09□□□□□ -1.43
EFTUD2-211ENST00000588374 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
EFTUD2-211ENST00000588374 WFDC6Q9BQY6 131 aa6.09□□□□□ -1.43
EFTUD2-211ENST00000588374 SRXN1Q9BYN0 137 aa6.09□□□□□ -1.43
EFTUD2-211ENST00000588374 OR11A1Q9GZK7 315 aa6.09□□□□□ -1.43
EFTUD2-211ENST00000588374 RNF122Q9H9V4 155 aa6.09□□□□□ -1.43
EFTUD2-211ENST00000588374 CMTM6Q9NX76 183 aa6.09□□□□□ -1.43
EFTUD2-211ENST00000588374 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
EFTUD2-211ENST00000588374 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
EFTUD2-211ENST00000588374 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa6.09□□□□□ -1.43
EFTUD2-211ENST00000588374 CHRNA9Q9UGM1 479 aa6.09□□□□□ -1.43
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC13A4Q9UKG4 626 aa6.09□□□□□ -1.43
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF175Q9Y473 711 aa6.09□□□□□ -1.43
EFTUD2-211ENST00000588374 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
EFTUD2-211ENST00000588374 COL12A1Q99715 3063 aa6.09□□□□□ -1.44
EFTUD2-211ENST00000588374 ICE1Q9Y2F5 2266 aa6.09□□□□□ -1.44
EFTUD2-211ENST00000588374 ELOVL7A1L3X0 281 aa6.08□□□□□ -1.44
EFTUD2-211ENST00000588374 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
EFTUD2-211ENST00000588374 SYT5O00445 386 aa6.08□□□□□ -1.44
EFTUD2-211ENST00000588374 FAAHO00519 579 aa6.08□□□□□ -1.44
EFTUD2-211ENST00000588374 GSTA4O15217 222 aa6.08□□□□□ -1.44
EFTUD2-211ENST00000588374 DCTN3O75935 186 aa6.08□□□□□ -1.44
EFTUD2-211ENST00000588374 LGI1O95970 557 aa6.08□□□□□ -1.44
EFTUD2-211ENST00000588374 KLK2P20151 261 aa6.08□□□□□ -1.44
EFTUD2-211ENST00000588374 FPR1P21462 350 aa6.08□□□□□ -1.44
EFTUD2-211ENST00000588374 ENPP1P22413 925 aa6.08□□□□□ -1.44
EFTUD2-211ENST00000588374 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
EFTUD2-211ENST00000588374 PRDX6P30041 224 aa6.08□□□□□ -1.44
EFTUD2-211ENST00000588374 PRKAR1BP31321 381 aa6.08□□□□□ -1.44
EFTUD2-211ENST00000588374 KCNJ5P48544 419 aa6.08□□□□□ -1.44
EFTUD2-211ENST00000588374 CLK1P49759 484 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
EFTUD2-211ENST00000588374 DIO1P49895 249 aa6.08□□□□□ -1.44
EFTUD2-211ENST00000588374 ASCL1P50553 236 aa6.08□□□□□ -1.44
EFTUD2-211ENST00000588374 CTBP2P56545 445 aa6.08□□□□□ -1.44
EFTUD2-211ENST00000588374 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
EFTUD2-211ENST00000588374 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
EFTUD2-211ENST00000588374 RAC3P60763 192 aa6.08□□□□□ -1.44
EFTUD2-211ENST00000588374 LIPEQ05469 1076 aa6.08□□□□□ -1.44
EFTUD2-211ENST00000588374 TFF3Q07654 80 aa6.08□□□□□ -1.44
EFTUD2-211ENST00000588374 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
EFTUD2-211ENST00000588374 MYBPHQ13203 477 aa6.08□□□□□ -1.44
EFTUD2-211ENST00000588374 OR1Q1Q15612 314 aa6.08□□□□□ -1.44
EFTUD2-211ENST00000588374 SYT14P1Q58G82 188 aa6.08□□□□□ -1.44
EFTUD2-211ENST00000588374 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
EFTUD2-211ENST00000588374 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa6.08□□□□□ -1.44
EFTUD2-211ENST00000588374 C3orf33Q6P1S2 294 aa6.08□□□□□ -1.44
EFTUD2-211ENST00000588374 TMPPEQ6ZT21 453 aa6.08□□□□□ -1.44
EFTUD2-211ENST00000588374 FCRLAQ7L513 359 aa6.08□□□□□ -1.44
EFTUD2-211ENST00000588374 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC30A8Q8IWU4 369 aa6.08□□□□□ -1.44
EFTUD2-211ENST00000588374 TUSC5Q8IXB3 177 aa6.08□□□□□ -1.44
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC15A3Q8IY34 581 aa6.08□□□□□ -1.44
EFTUD2-211ENST00000588374 MICU2Q8IYU8 434 aa6.08□□□□□ -1.44
EFTUD2-211ENST00000588374 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
EFTUD2-211ENST00000588374 OR52E4Q8NGH9 312 aa6.08□□□□□ -1.44
EFTUD2-211ENST00000588374 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
EFTUD2-211ENST00000588374 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
EFTUD2-211ENST00000588374 DDIT4LQ96D03 193 aa6.08□□□□□ -1.44
EFTUD2-211ENST00000588374 LRRC46Q96FV0 321 aa6.08□□□□□ -1.44
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF559Q9BR84 538 aa6.08□□□□□ -1.44
EFTUD2-211ENST00000588374 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
EFTUD2-211ENST00000588374 SFXN3Q9BWM7 321 aa6.08□□□□□ -1.44
EFTUD2-211ENST00000588374 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
EFTUD2-211ENST00000588374 TRIM2Q9C040 744 aa6.08□□□□□ -1.44
EFTUD2-211ENST00000588374 ENKD1Q9H0I2 346 aa6.08□□□□□ -1.44
EFTUD2-211ENST00000588374 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
EFTUD2-211ENST00000588374 COQ10BQ9H8M1 238 aa6.08□□□□□ -1.44
EFTUD2-211ENST00000588374 TMEM27Q9HBJ8 222 aa6.08□□□□□ -1.44
EFTUD2-211ENST00000588374 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
EFTUD2-211ENST00000588374 ARL8BQ9NVJ2 186 aa6.08□□□□□ -1.44
EFTUD2-211ENST00000588374 KLHL28Q9NXS3 571 aa6.08□□□□□ -1.44
EFTUD2-211ENST00000588374 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
EFTUD2-211ENST00000588374 MPDZO75970 2070 aa6.08□□□□□ -1.44
EFTUD2-211ENST00000588374 CACNA1CQ13936 2221 aa6.07□□□□□ -1.44
EFTUD2-211ENST00000588374 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
EFTUD2-211ENST00000588374 A8MVM7 634 aa6.07□□□□□ -1.44
EFTUD2-211ENST00000588374 A8MXE2 369 aa6.07□□□□□ -1.44
EFTUD2-211ENST00000588374 M0R3H8 397 aa6.07□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms