RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586900.1

PKN1-208, Transcript of protein kinase N1, human

TSL 3

Gene PKN1, Length 550 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKN1-208	ENST00000586900	TPD52L3	Q96J77	140 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	TUBA1C	Q9BQE3	449 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	ALKBH4	Q9NXW9	302 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	SLC5A6	Q9Y289	635 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	TMED7	Q9Y3B3	224 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	HDGFL3	Q9Y3E1	203 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	FAM215A	Q9Y5M1	114 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	UBR5	O95071	2799 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900		A0A0J9YW62	118 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PKN1-208	ENST00000586900	CCL21	O00585	134 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PKN1-208	ENST00000586900	EIF1AY	O14602	144 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
PKN1-208	ENST00000586900	LRRTM2	O43300	516 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PKN1-208	ENST00000586900	SEC14L5	O43304	696 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PKN1-208	ENST00000586900	TIMP3	P35625	211 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PKN1-208	ENST00000586900	PER3	P56645	1201 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PKN1-208	ENST00000586900	TMEM176B	Q3YBM2	270 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
PKN1-208	ENST00000586900	SYT14P1	Q58G82	188 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PKN1-208	ENST00000586900	ALG10B	Q5I7T1	473 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PKN1-208	ENST00000586900	ENTPD8	Q5MY95	495 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PKN1-208	ENST00000586900	LCN8	Q6JVE9	175 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PKN1-208	ENST00000586900	C5orf46	Q6UWT4	87 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PKN1-208	ENST00000586900	VTCN1	Q7Z7D3	282 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PKN1-208	ENST00000586900	RBM45	Q8IUH3	476 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
PKN1-208	ENST00000586900	OR10D3	Q8NH80	312 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PKN1-208	ENST00000586900	VANGL1	Q8TAA9	524 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
PKN1-208	ENST00000586900	STK35	Q8TDR2	534 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PKN1-208	ENST00000586900	SMPDL3B	Q92485	455 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PKN1-208	ENST00000586900	WNT2B	Q93097	391 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PKN1-208	ENST00000586900	DDIT4L	Q96D03	193 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PKN1-208	ENST00000586900	HSH2D	Q96JZ2	352 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PKN1-208	ENST00000586900	TTYH2	Q9BSA4	534 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PKN1-208	ENST00000586900	PRR14	Q9BWN1	585 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PKN1-208	ENST00000586900	CADM1	Q9BY67	442 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
PKN1-208	ENST00000586900	POTEKP	Q9BYX7	375 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PKN1-208	ENST00000586900	LRMDA	Q9H2I8	198 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PKN1-208	ENST00000586900	TMEM185B	Q9H7F4	350 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PKN1-208	ENST00000586900	TIGAR	Q9NQ88	270 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PKN1-208	ENST00000586900	SELENON	Q9NZV5	590 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PKN1-208	ENST00000586900	SH3BGRL2	Q9UJC5	107 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PKN1-208	ENST00000586900	TRAPPC4	Q9Y296	219 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PKN1-208	ENST00000586900	ZNF175	Q9Y473	711 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PKN1-208	ENST00000586900	DIDO1	Q9BTC0	2240 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
PKN1-208	ENST00000586900	FASN	P49327	2511 aa	Known RBP	11.07	□□□□□ -0.64
PKN1-208	ENST00000586900		A0A087WUJ7	227 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PKN1-208	ENST00000586900	TMEM72	A0PK05	275 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PKN1-208	ENST00000586900	CLEC18A	A5D8T8	446 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PKN1-208	ENST00000586900	TRAPPC13	A5PLN9	417 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PKN1-208	ENST00000586900	MBD3L4	A6NDZ8	208 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
PKN1-208	ENST00000586900	MBD3L3	A6NE82	208 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
PKN1-208	ENST00000586900	MBD3L5	A6NJ08	208 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
PKN1-208	ENST00000586900	CLCA1	A8K7I4	914 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PKN1-208	ENST00000586900		A8MVM7	634 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PKN1-208	ENST00000586900		H0YC42	278 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PKN1-208	ENST00000586900	PYCARD-AS1	I3L0S3	204 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PKN1-208	ENST00000586900	DNPH1	O43598	174 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PKN1-208	ENST00000586900	CHP2	O43745	196 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PKN1-208	ENST00000586900	NPIPB7	O75200	414 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PKN1-208	ENST00000586900	PDE5A	O76074	875 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PKN1-208	ENST00000586900	STAMBP	O95630	424 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PKN1-208	ENST00000586900	IFNW1	P05000	195 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PKN1-208	ENST00000586900	THRB	P10828	461 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PKN1-208	ENST00000586900	TNFRSF1B	P20333	461 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PKN1-208	ENST00000586900	SHC1	P29353	583 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PKN1-208	ENST00000586900	SLC7A1	P30825	629 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PKN1-208	ENST00000586900	IFNA8	P32881	189 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PKN1-208	ENST00000586900	SFTPD	P35247	375 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PKN1-208	ENST00000586900	OR1E2	P47887	323 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PKN1-208	ENST00000586900	TPD52	P55327	224 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
PKN1-208	ENST00000586900	CARD18	P57730	90 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PKN1-208	ENST00000586900	RAC3	P60763	192 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PKN1-208	ENST00000586900	MS4A2	Q01362	244 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PKN1-208	ENST00000586900	SGCB	Q16585	318 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PKN1-208	ENST00000586900	RIPPLY2	Q5TAB7	128 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PKN1-208	ENST00000586900	HBM	Q6B0K9	141 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PKN1-208	ENST00000586900	POMZP3	Q6PJE2	187 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PKN1-208	ENST00000586900	CLEC18B	Q6UXF7	455 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PKN1-208	ENST00000586900	RPTN	Q6XPR3	784 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PKN1-208	ENST00000586900	LINC00114	Q6XXX2	140 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PKN1-208	ENST00000586900	TMPPE	Q6ZT21	453 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PKN1-208	ENST00000586900	FKBP9P1	Q75LS8	142 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PKN1-208	ENST00000586900	FJX1	Q86VR8	437 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PKN1-208	ENST00000586900	DHFR2	Q86XF0	187 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PKN1-208	ENST00000586900	CLEC18C	Q8NCF0	446 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PKN1-208	ENST00000586900	ATP6V1C2	Q8NEY4	427 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PKN1-208	ENST00000586900	OR10Q1	Q8NGQ4	319 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PKN1-208	ENST00000586900	MBD3L2	Q8NHZ7	208 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
PKN1-208	ENST00000586900	ADAMTS16	Q8TE57	1224 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PKN1-208	ENST00000586900	OSTF1	Q92882	214 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PKN1-208	ENST00000586900	PYURF	Q96I23	114 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PKN1-208	ENST00000586900	MPP4	Q96JB8	637 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PKN1-208	ENST00000586900	CLPTM1L	Q96KA5	538 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PKN1-208	ENST00000586900	TRIB1	Q96RU8	372 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PKN1-208	ENST00000586900	COQ10B	Q9H8M1	238 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PKN1-208	ENST00000586900	CLCF1	Q9UBD9	225 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PKN1-208	ENST00000586900	RELN	P78509	3460 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PKN1-208	ENST00000586900	PCNX1	Q96RV3	2341 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PKN1-208	ENST00000586900	MPDZ	O75970	2070 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PKN1-208	ENST00000586900	NCOA6	Q14686	2063 aa	Predicted RBP	11.06	□□□□□ -0.64
PKN1-208	ENST00000586900	ELOA3D	A6NLF2	546 aa	Predicted RBP	11.06	□□□□□ -0.64
PKN1-208	ENST00000586900	CPSF4L	A6NMK7	179 aa	Known RBP	11.06	□□□□□ -0.64

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