RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 P2RX2Q9UBL9 471 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF232Q9UNY5 417 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 HIVEP1P15822 2718 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 FAM221AA4D161 298 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 AGAP5A6NIR3 686 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 SULT2B1O00204 365 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 CLIC1O00299 241 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 GOSR1O95249 250 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 BCHEP06276 602 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 DBIP07108 87 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 CHRM4P08173 479 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 ZCCHC18P0CG32 403 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 UQCRBP14927 111 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 CRISP3P54108 245 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 RAC3P60763 192 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 DSTNP60981 165 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 FUT5Q11128 374 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 KEAP1Q14145 624 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 GTDC1Q4AE62 458 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 SLC25A53Q5H9E4 307 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 CGB2Q6NT52 195 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 SLC2A7Q6PXP3 512 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF550Q7Z398 422 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 GRINAQ7Z429 371 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 TUSC5Q8IXB3 177 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 CMIPQ8IY22 773 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 SLC43A2Q8N370 569 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 RNF128Q8TEB7 428 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 WDR60Q8WVS4 1066 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF524Q96C55 264 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 PIK3IP1Q96FE7 263 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 EBF4Q9BQW3 602 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 CCDC28BQ9BUN5 200 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 SLC38A1Q9H2H9 487 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 CTPS2Q9NRF8 586 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 SLC6A13Q9NSD5 602 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 KLHL9Q9P2J3 617 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 MPDZO75970 2070 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 VPS13CQ709C8 3753 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 MED13LQ71F56 2210 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 C5orf58C9J3I9 102 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 NR5A2O00482 541 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 AP3D1O14617 1153 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 DCTN3O75935 186 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 NTN1O95631 604 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 HRGP04196 525 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 YES1P07947 543 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 CD1EP15812 388 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 AGTR1P30556 359 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 MAGEA8P43361 318 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 HTR3AP46098 478 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 PCYT1AP49585 367 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 DIO1P49895 249 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 OR2B6P58173 313 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 COPZ1P61923 177 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 GUSBP1Q15486 140 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 LIN52Q52LA3 116 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 AGKQ53H12 422 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 SYT14P1Q58G82 188 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 TMPPEQ6ZT21 453 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 VRK2Q86Y07 508 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 OR52P1PQ8NH57 321 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 GTF2H4Q92759 462 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 PMM1Q92871 262 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 NINJ1Q92982 152 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 VCXQ9H320 206 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 RAD21L1Q9H4I0 556 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 ARMC7Q9H6L4 198 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 DCLRE1BQ9H816 532 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 COQ10BQ9H8M1 238 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 RLIMQ9NVW2 624 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 KLHL13Q9P2N7 655 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 CHRNA9Q9UGM1 479 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 TESMINQ9Y4I5 508 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa7.42□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53 ms